Tunikamycin

Tunikamycin
Tunicamycin.svg
Namn
IUPAC-namn
(E)-N-[(2S,3R,4R,5R,6R)-2-[(2R,3R,4R,5S,6R)-

3-acetamido-4,5-dihydroxi-6-(hydroximetyl)oxan-2-yl]oxi-6-[2-[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1- yl)-3,4-dihydroxioxolan-2-yl]-2-hydroxietyl]-4,5-dihydroxioxan-

3-yl]-5-metylhex-2-enamid
Andra namn
NSC 177382
Identifierare
3D-modell ( JSmol )
ChEMBL
ChemSpider
ECHA InfoCard 100.115.295 Edit this at Wikidata
EG-nummer
  • 601-012-4
Maska Tunikamycin
UNII
  • InChI=1S/C30H46N4O16/c1-11(2)5-4-6-16(38)32-19-23(43)20(40)14(47-29(19)50-28-18(31- 12(3)36)22(42)21(41)15(10-35)48-28)9-13(37)26-24(44)25(45)27(49-26)34-8- 7-17(39)33-30(34)46/h4,6-8,11,13-15,18-29,35,37,40-45H,5,9-10H2,1-3H3,(H ,31,36)(H,32,38)(H,33,39,46)/b6-4+/t13a,14-,15-,18-,19-,20+,21-,22- ,23-,24+,25-,26-,27-,28-,29+/m1/s1
    Nyckel: ZHSGGJXRNHWHRS-VIDYELAYSA-N
  • CC(C)C\C=C\C(=O)N[C@@H]1[C@H]([C@H]([C@H](O[C@H]1O[C @@H]2[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O)NC(=O)C)CC([C @@H]3[C@H]([C@H]([C@@H](O3)N4C=CC(=O)NC4=O)O)O)O)O)O
Egenskaper
C39H64N4O16 _ _ _ _ _ _ _
Molar massa N/A
Faror
GHS- märkning :
GHS06: Toxic
Fara
H300
Om inte annat anges ges data för material i standardtillstånd (vid 25 °C [77 °F], 100 kPa).
☒  N ( vad är check☒ Y N ?)

Tunicamycin är en blandning av homologa nukleosidantibiotika som hämmar UDP-HexNAc: polyprenol-P HexNAc-1-P - enzymfamiljen. I eukaryoter inkluderar detta enzymet GlcNAc fosfotransferas (GPT), som katalyserar överföringen av N-acetylglukosamin-1-fosfat från UDP-N-acetylglukosamin till dolikolfosfat i det första steget av glykoproteinsyntesen . Tunikamycin blockerar N-kopplad glykosylering (N-glykaner) och behandling av odlade mänskliga celler med tunikamycin orsakar cellcykelstopp i G1-fasen . Det används som ett experimentellt verktyg inom biologi , t.ex. för att inducera ett oveckat proteinsvar . Tunicamycin produceras av flera bakterier , inklusive Streptomyces clavuligerus och Streptomyces lysosuperificus .

Tunikamycinhomologer har varierande molekylvikter på grund av variationen i fettsyrasidokedjekonjugat .

Biosyntes

Biosyntesen av tunicamyciner studerades i Streptomyces chartreusis och en föreslagen biosyntesväg karakteriserades. Bakterierna använder enzymerna i tun- genklustret (TunA-N) för att göra tunikamyciner.

TunA använder startenheten uridin difosfat-N-acetyl-glukosamin (UDP-GlcNAc) och katalyserar uttorkningen av 6'-hydroxylgruppen. Först abstraherar en Tyr-rest i TunA en proton från 4'-hydroxylgruppen och bildar en keton i den positionen. En hydrid abstraheras därefter från 4'-kolet med NAD+, vilket bildar NADH. Ketonen stabiliseras genom vätebindning från Tyr-resten och en närliggande Thr-rest. En glutamatrest abstraherar sedan en proton från 5'-kolet och trycker upp elektronerna för att bilda en dubbelbindning mellan 5'- och 6'-kolet. Ett närliggande cystein donerar en proton till hydroxylgruppen när den lämnar som vatten. NADH donerar en hydrid till 4'-kolet, omvandlar en hydroxid i den positionen och bildar UDP-6'-deoxi-5-6-en-GlcNAc. TunF katalyserar sedan epimeriseringen av intermediären till UDP-6'-deoxi-5-6-en-GalNAc, vilket ändrar 4'-hydroxylen från ekvatorial till axiell position.

  • Natural products scheme 1.png

Den andra startenheten för tunikamycin är uridin, som framställs av uridintrifosfat (UTP). TunN är ett nukleotiddifosfatas och katalyserar avlägsnandet av pyrofosfat från UTP för att bilda uridinmonofosfat. Det sista fosfatet avlägsnas av det förmodade monofosfataset, TunG.

  • Scheme 2.png

När uridin och UDP-6'-deoxi-5-6-en-GalNAc väl har producerats, katalyserar TunB deras koppling vid 6'-kolet av UDP-6'-deoxi-5-6-en-GalNAc. TunB använder S-adenyslmetionin (SAM) för att bilda en radikal på 5'-kolet i ribosen på uracil. TunM tros katalysera bildningen av en ny bindning mellan 5'-kolet i uridin och 6'-kolet i UDP-6'-deoxi-5-6-en-GalNAc med hjälp av elektronen från uridinradikalen och en av elektronerna från dubbelbindningen av UDP-6'-deoxi-5-6-en-GalNAc. Radikalen på UDP-6'-deoxi-5-6-en-GalNAc släcks sedan genom att ett väte avlägsnas från SAM. Den resulterande molekylen är UDP-N-acetyl-tunikamin. TunH katalyserar sedan hydrolysen av UDP från UDP-N-acetyl-tunicamin. En annan molekyl av UDP-GlcNAc introduceras och en β-1,1-glykosidbindning bildas därefter, katalyserad av TunD. Den resulterande molekylen deacetyleras av TunE. TunL och ett fettacyl-ACP-ligas används för att ladda metaboliska fettsyror på acylbärarproteinet, TunK. TunC fäster sedan fettsyran till den fria aminen och producerar tunikamycin.

  • Tunicamycin scheme 3.png

Se även

externa länkar

Hämtad från " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Tunicamycin&oldid=1059994088 "