CompTox Chemicals Dashboard
 | |
| Innehåll | |
|---|---|
| Beskrivning | Kemikaliedatabas riktad mot miljövetenskap och ger tillgång till över 875 000 kemiska föreningar, egenskaper, bioanalysdata och tillhörande information. Sökningar |
| Kontakt | |
| Forskningscenter | Naturvårdsverket |
| Laboratorium |
|
| Primärt citat | CompTox Chemistry Dashboard: en gemenskapsdataresurs för miljökemi. |
| Tillgång | |
| Hemsida | |
| Ladda ner URL | |
| Diverse | |
| Licens | Allmängods |
| Frekvens för datautgivning |
Var 6:e månad |
| Kurationspolicy | Manuellt kurerad |
CompTox Chemicals Dashboard är en fritt tillgänglig onlinedatabas skapad och underhållen av US Environmental Protection Agency ( EPA). Databasen ger tillgång till flera typer av data, inklusive fysikalisk-kemiska egenskaper , miljömässigt öde och transport, exponering, användning, in vivo- toxicitet och in vitro- bioanalys. EPA och andra forskare använder data och modeller som finns i instrumentpanelen för att hjälpa till att identifiera kemikalier som kräver ytterligare testning och minska användningen av djur i kemiska tester. Dashboarden används också för att ge allmänheten tillgång till information från EPA:s handlingsplaner, t.ex. kring perfluorerade alkylerade ämnen .
Ursprungligen kallad Chemistry Dashboard, den första versionen släpptes 2016. Den senaste versionen av databasen (version 3.0.5) innehåller manuellt utvalda data för över 875 000 kemikalier och innehåller de senaste data som genererats från EPA:s Toxicity Forecaster (ToxCast) hög- genomströmningsscreeningsprogram. Chemicals Dashboard innehåller data från flera tidigare EPA-databaser i ett paket inklusive ToxCast Dashboard, Endocrine Disruption Screening Program (EDSP) Dashboard och Chemical and Products Database (CPDat).
Omfattning och tillgång
Databasen CompTox Chemicals Dashboard innehåller högkvalitativa kemiska strukturer och information som har blivit utförligt kurerad och kvalitetskontrollerad, som kan användas som en resurs för analytiska forskare som är involverade i strukturidentifiering.
Data om kemiska faror i instrumentpanelen kommer från både traditionella försöksdjursstudier och screening med hög genomströmning . Biologiska data från screening med hög genomströmning genereras av EPA:s ToxCast-program, ToxCast-data i databasen ger information om de analyser som används och deras responsstyrka och effekt. Dessa data finns på fliken bioaktivitet.
Chemicals Dashboard kan nås via ett webbgränssnitt eller uppsättningar av data i den kan laddas ner för användning offline. Fliken Listor kan användas för att bläddra och ladda ner grupper av relaterade kemikalier baserat på deras relevans för ett specifikt forskningsämne (som tillsatser i cigaretter eller kemikalier som visar effekter på neuroutvecklingseffekter ) eller de specifika analysens slutpunkter som de omfattas av.
Inom instrumentpanelen online kan sökningar utföras efter produkt-/användningskategorier, analys/gen, systematiskt namn, synonym, CAS-nummer , DSSTox Substance ID eller InChiKey . Under fliken Avancerad sökning kan kemikalier sökas baserat på deras massa eller molekylformel . Sökningar kan också utföras för grupper av kemikalier baserade på kemiskt namn CASRN, InChIKey, DSSTox Substance ID, DSSTox Compound ID, InChIKey Skeleton, MS-Ready Formula, Exact Formula eller Monoisotopic Mass med hjälp av batchsökningsfunktionen.
Andra funktioner
Ett automatiserat read-across-verktyg som heter Generalized Read-Across (GenRA) är integrerat i The Chemicals Dashboard. GenRA är utformad för att behålla experthänsynen som är inneboende i genomläsningsmetoden, men automatisera den kemiska urvalsprocessen för att hjälpa till att förutsäga toxicitet.
Dashboarden har också möjlighet att söka i befintliga vetenskapliga litteraturkällor som PubMed , via en webbaserad version av "Abstract Sifter", Google Scholar och rapporter från EPA:s provisoriska peer reviewed toxicitetsvärden ( PPRTV ) och EPA Integrated Risk Information System ( IRIS ).
QSAR- förutsägelse i realtid för flera fysikalisk-kemiska egenskaper och toxicitetsändpunkter är tillgänglig via fliken förutsägelser .
Stödjer masspektrometri
Instrumentpanelen ger stöd för masspektrometri som ger sökningar mot de kemiska data som finns i databasen baserat på massa och molekylformel . Instrumentpanelen har tillämpats på icke-riktad analys som söker efter " kända okända ". Både riktad masspektrometri och icke-riktad masspektrometri stöds. Sökningarna använder en sökning baserad på "MS-Ready" former av kemiska föreningar. Enskilda kemiska substabces kollapsas till en form som skulle detekteras med masspektrometri så att salter avsaltas och neutraliseras och flerkomponentskemikalier separeras i sina individuella komponenter.