Jmol

För det rättsliga förfarandet, se dom som en lag .
Jmol
Utvecklare Jmol utvecklingsteam
Initial release 2001 ; 22 år sedan ( 2001 )
Stabil frisättning
Edit this on Wikidata 14.31.34 / 7 mars 2021 ; 23 månader sedan ( 7 mars 2021 )
Förvar sourceforge .net /projects /jmol
Skrivet i Java
Operativ system Cross-plattform
Plattform System med Java och webbläsare utan Java
Tillgänglig i 16 språk
Lista över språk
Katalanska, kinesiska, danska, holländska, engelska, franska, tyska, ungerska, indonesiska, italienska, koreanska, portugisiska, spanska, turkiska, ukrainska
Typ Molekylär modellering
Licens LGPL 2.0
Hemsida www .jmol .org

Jmol är datorprogramvara för molekylär modellering av kemiska strukturer i 3-dimensioner . Jmol returnerar en 3D-representation av en molekyl som kan användas som ett läromedel eller för forskning t.ex. inom kemi och biokemi . Det är skrivet på programmeringsspråket Java , så det kan köras på operativsystemen Windows , macOS , Linux och Unix , om Java är installerat. Det är gratis och öppen källkod som släpps under en GNU Lesser General Public License (LGPL) version 2.0. Det finns en fristående applikation och ett mjukvaruutvecklingskit (SDK) som kan integreras i andra Java-applikationer, som Bioclipse och Taverna .

En populär funktion är en applet som kan integreras i webbsidor för att visa molekyler på en mängd olika sätt. Molekyler kan till exempel visas som boll-och-stick-modeller , rymdfyllande modeller , banddiagram etc. Jmol stöder ett brett utbud av kemiska filformat , inklusive Protein Data Bank (pdb), Crystallographic Information File (cif), MDL Molfile (mol) och Chemical Markup Language (CML). Det finns också en JavaScript- version ( HTML5 ), JSmol , som kan användas på datorer utan Java.

Jmol-appleten, bland andra förmågor, erbjuder ett alternativ till plugin-programmet Chime , som inte längre är under aktiv utveckling. Även om Jmol har många funktioner som Chime saknar, gör den inte anspråk på att återskapa alla Chime-funktioner, framför allt Sculpt -läget. Chime kräver plugin- installation och Internet Explorer 6.0 eller Firefox 2.0 på Microsoft Windows eller Netscape Communicator 4.8 på Mac OS 9 . Jmol kräver Java- installation och fungerar på en mängd olika plattformar. Jmol är till exempel fullt fungerande i Mozilla Firefox , Internet Explorer , Opera , Google Chrome och Safari .


Skärmdumpar

  • Crystal structure of an H/ACA box RNP from Pyrococcus furiosus.

    Kristallstruktur av en H/ACA-box RNP från Pyrococcus furiosus .

  • Highlighting two salt bridges in hemoglobin tetramer (hemo group as sticks at bottom-right).

    Markera två saltbryggor i hemoglobintetramer (hemogrupp som stickor längst ner till höger).

  • A fragment of transcription factor TFIIIA forming three consecutive zinc finger motifs, bound to a stretch of DNA.

    Ett fragment av transkriptionsfaktor TFIIIA som bildar tre på varandra följande zinkfingermotiv, bundet till en DNA-sträcka.

  • Eubacterial 70S Ribosome from Thermus thermophilus.

    Eubacterial 70S Ribosom från Thermus thermophilus .

Se även

externa länkar

Hämtad från " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Jmol&oldid=1093745822 "