Tequintavirus
| Tequintavirus | |
|---|---|
| Virus klassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Duplodnaviria |
| Rike: | Heunggongvirae |
| Provins: | Uroviricota |
| Klass: | Caudoviricetes |
| Beställa: | Caudovirales |
| Familj: | Demerecviridae |
| Underfamilj: | Markadamsvirinae |
| Släkte: | Tequintavirus |
Tequintavirus (synonymer T5-liknande fager , T5-liknande virus , T5liknande virus ) är ett släkte av virus i ordningen Caudovirales , i familjen Demerecviridae . Bakterier fungerar som den naturliga värden, med överföring som uppnås genom passiv diffusion. Det finns för närvarande 22 arter i detta släkte, inklusive typen Escherichia virus T5 .
Taxonomi
Följande arter är erkända:
- Escherichia-virus AKFV33
- Escherichia virus BF23
- Escherichia virus chee24
- Escherichia virus DT5712
- Escherichia virus DT57C
- Escherichia virus FFH1
- Escherichia virus Gostya9
- Escherichia virus H8
- Escherichia virus mar004NP2
- Escherichia virus OSYSP
- Escherichia virus phiAPCEc03
- Escherichia virus phiLLS
- Escherichia virus slur09
- Escherichia virus T5
- Salmonellavirus NR01
- Salmonellavirus S131
- Salmonellavirus Shivani
- Salmonellavirus SP01
- Salmonellavirus SP3
- Salmonellavirus SPC35
- Shigella-virus SHSML45
- Shigella virus SSP1
Strukturera
Tequintavirus är icke-hölje , med huvud och svans. Huvudet är ikosaedriskt (T=13) och är cirka 90 nm i diameter. Svansen är cirka 180 nm lång, 9 nm bred. Den har tre långa, krökta terminalfibrer med en längd på cirka 120 nm, och en enda rak central fiber fäst vid en konisk spets.
| Släkte | Strukturera | Symmetri | Capsid | Genomiskt arrangemang | Genomisk segmentering |
|---|---|---|---|---|---|
| Tequintavirus | Huvud-Svans | T=13 | Ej kuverterade | Linjär | Endelad |
Genom
Genomerna är linjära, cirka 121 kb långa. Typarterna, Enterobacteria-fagen T5, och flera andra arter har sekvenserats fullständigt. Genomerna varierar mellan ungefär 108-121 tusen nukleotider, med cirka 140 till 170 förutspådda öppna läsramar . De kompletta genomen, liksom två andra liknande, oklassificerade genom finns tillgängliga här .
Livscykel
Viruset fäster till värdcellens adhesionsreceptorer med hjälp av dess terminala fibrer och bryter ner cellväggen med hjälp av viralt exolysin tillräckligt för att skjuta ut det virala DNA:t i värdcytoplasman via ett långt flexibelt svansutdrivningssystem . Replikation följer DNA-strängens förskjutning, via replikativ transpositionsmodell. DNA-mallrad transkription är metoden för transkription. När de virala generna har replikerats, sätts prokapsiden ihop och packas. Svansen sätts sedan ihop och de mogna virionerna frisätts via lys. Bakterier fungerar som den naturliga värden. Överföringsvägar är passiv diffusion.
| Släkte | Värdinformation | Vävnadstropism | Inträdesuppgifter | Releaseinformation | Replikeringsplats | Monteringsplats | Överföring |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tequintavirus | Bakterie | Ingen | Injektion | Lysis | Cytoplasma | Cytoplasma | Passiv diffusion |
Historia
Enligt ICTV :s rapport från 1996 accepterades släktet T5likevirus först under namnet T5-liknande fager , som endast tilldelades familjen Siphoviridae . Hela familjen flyttades för att beställa Caudovirales 1998, och släktet döptes om till T5-liknande virus i ICTV:s sjunde rapport 1999. 2012 döptes det om till T5likevirus igen . Släktet döptes senare om till Tequintavirus och placerades i den nyetablerade familjen Demerecviridae . [ citat behövs ]