Escherichia virus T5
| Escherichia virus T5 | |
|---|---|
| Virusklassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Duplodnaviria |
| Rike: | Heunggongvirae |
| Provins: | Uroviricota |
| Klass: | Caudoviricetes |
| Beställa: | Caudovirales |
| Familj: | Demerecviridae |
| Släkte: | Tequintavirus |
| Arter: |
Escherichia virus T5
|
| Synonymer | |
|
|
Escherichia virus T5 , ibland kallat Bacteriophage T5, är ett kaudalt virus inom familjen Demerecviridae . Denna bakteriofag infekterar specifikt E. coli -bakterieceller och följer en lytisk livscykel .
Struktur och genom
T5- virionen inkluderar en 90 nanometer ikosaedrisk kapsid (huvud) och en 250 nanometer lång flexibel, icke- sammandragande svans.
Kapsiden innehåller fagens 121 750 baspar, dubbelsträngade DNA -genom som kodar för cirka 168 proteiner (nu reducerat till 162). Genomet har en unik sekvens på 111 613 bp med två identiska stora direktterminala repetitioner på 10 139 bp. När genomsekvensen publicerades 2005 hade endast 61 (36,3%) av de 168 kodade proteinerna tilldelats funktioner baserat på homologi med kända sekvenser. Mer än hälften av alla gener (92 eller 54,7%) förutspåddes ORF som saknade likhet med några kända proteiner. Antalet okarakteriserade proteiner förblir högt på cirka 50 % av genomet (baserat på den senaste annoteringen av referensproteomet i Uniprot, 2021 ).
Infektion
Bakteriofag T5 har visat sig infektera E. coli efter att dess receptorbindande protein, pb5, binder till värdcellens yttre membran ferrikromtransportör , FhuA. Bindningen utlöser strukturella förändringar i pb5 och leder så småningom till DNA-frisättning från fagkapsiden.
externa länkar