Sulfolobaceae
|
|
| Sulfolobaceae | |
|---|---|
| Sulfolobus | |
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | Archaea |
| Rike: | Proteoarchaeota |
| Superfylum: | TACK grupp |
| Provins: | Termoproteota |
| Klass: | Termoprotein |
| Beställa: | Sulfolobales |
| Familj: |
Sulfolobaceae Stetter 1989 |
| Genera | |
|
|
Sulfolobaceae är en familj av Sulfolobales som tillhör domänen Archaea . Familjen består av flera släkten anpassade för att överleva miljönischer med extrem temperatur och låga pH-förhållanden.
Ekologi
Sulfolobaceae -arter är termofiler som vanligtvis finns i varma källor , hydrotermiska öppningar , mudpots och vulkaniskt aktiva regioner, med Sulfolobus -släktet som finns nästan var som helst med vulkanisk aktivitet. Sulfolobaceae finns i temperaturer från 40 till 95 °C. De finns i pH-nivåer mellan 1 och 6, vilket gör specifika arter acidofiler . Vissa arter, som Metallosphaera prunae , har hittats som lever på pyrande avfallsmaterial från gruvor genom att använda en litoautotrofisk metabolism.
Sulfolobaceae är involverade i biofilmbildning . Analys av biofilmer producerade av olika arter har visat att mycket få reglerande proteiner är gemensamma mellan dessa arter, vilket indikerar att flera olika regleringsmekanismer för biofilmbildning kan existera. Sulfolobus acidocaldarius har observerats bilda tornliknande biofilmstrukturer och Sulfolobus solfataricus har observerats bilda mattliknande biofilmer.
Ämnesomsättning
Sulfolobaceae- arter uppvisar en mångfald av metabolismer inklusive aerob , fakultativ anaerob eller obligat anaerob med kemoheterotrofisk , litoautotrofisk eller mixotrofisk livsstil. Vissa arter uppvisar metabolisk flexibilitet och kan använda flera olika metaboliska vägar beroende på tillgängliga energikällor, medan andra har ett snävt utbud av metaboliska alternativ.
Kemoheterotrofa Sulfolobaceae får sin energi genom att oxidera reducerade organiska kolföreningar, inklusive D-glukos , D-galaktos , andra vanliga sockerarter, aminosyror och andra komplexa molekyler, med hjälp av oxiderade former av svavel . Litoautotrofisk metabolism, å andra sidan, innebär att man får energi från oxidation av reducerade föreningar som elementärt svavel, svavelmalmer och andra reducerade svavelföreningar eller molekylärt väte.
Sulfolobaceae föredrar miljöer med låg natriumkloridhalt, med undantag för släktet Acidianus . Glykogen används som långtidslagring av kol och energi.
Morfologiska egenskaper
Sulfolobaceae -arter har regelbundna, oregelbundna eller flikiga kockercellsformer . Deras storlek faller mellan 0,5 och 2 μm i diameter. Flera olika ytbihang har observerats, inklusive archaella hos rörliga arter, typiskt uttryckta vid svält.
Unikt för Sulfolobus acidocaldarious är de arkeala adhesiva pili som är viktiga för ytfästning vid biofilmbildning. Archaeal typ IV pilin ytbihangsuttryck sker genom ett dedikerat typ IV prepilin signalpeptidas innan filament kan sättas ihop. En sockerbindande ytstruktur som kallas bindosom har hittats i Sulfolobus solfataricus . När de sätts ihop till ett dedikerat bindosomsammansättningssystem är de aktiva i transporten av socker.
Proteinhaltiga toxiner benämnda sulfolobiciner har producerats av vissa stammar av Sulfolobus islandicus . Dessa toxiner kan ge en konkurrensfördel, eftersom de hämmar tillväxten av icke-toxinproducerande stammar av S. islandicus och vissa andra Sulfolobus- arter. Andra arter, såsom Sulfolobus acidocaldarius , hämmas inte. Genen som kodar för sulfolobiciner har identifierats i andra Sulfolobus- arter .
Fylogeni
Den för närvarande accepterade taxonomin är baserad på listan över prokaryota namn med Standing in Nomenclature (LPSN) och National Center for Biotechnology Information (NCBI)
| 16S rRNA-baserad LTP _12_2021. | 53 markörproteiner baserade GTDB 07-RS207. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Vidare läsning
Tidskrifter
- Judicial Commission of the International Committee on Systematics of Prokaryotes (2005). "De nomenklaturella typerna av ordningarna Acholeplasmatales, Halanaerobiales, Halobacteriales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanomicrobiales, Planctomycetales, Prochlorales, Sulfolobales, Thermococcales, Thermoproteales och Verrucomicrobiales är,, ococcus, Methanomicrobium, Planctomyces, Prochloron, Sulfolobus , Thermococcus, Thermoproteus respektive Verrucomicrobium. Yttrande 79" . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 55 (Pt 1): 517–518. doi : 10.1099/ijs.0.63548-0 . PMID 15653928 .
- Euzeby JP; Tindall BJ (2001). "Nomenklaturtyp av order: korrigeringar som är nödvändiga enligt reglerna 15 och 21a i den bakteriologiska koden (1990 års revision), och angivande av lämpliga nomenklaturtyper av klasser och underklasser. Begäran om ett yttrande" . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 51 (Pt 2): 725–727. doi : 10.1099/00207713-51-2-725 . PMID 11321122 .
Böcker
- Stetter, KO (1989). "Orden III. Sulfolobales ord. nov. Familj Sulfolobaceae fam. nov.". I JT Staley; MP Bryant; N Pfennig; JG Holt (red.). Bergeys manual för systematisk bakteriologi . Vol. 3 (första upplagan). Baltimore: The Williams & Wilkins Co. sid. 169.