Sporosarcina
| Sporosarcina | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | |
| Provins: | |
| Klass: | |
| Beställa: |
Caryphanales
|
| Familj: | |
| Släkte: |
Sporosarcina
|
Sporosarcina är ett släkte av bakterier .
Specifikation
Cellerna av arten av Sporosarcina är antingen stavformade eller coccoid . Sporosarcina bildar endosporer . Majoriteten av arterna av Sporosarcina är rörliga (rörliga).
Ämnesomsättning
Alla arter av Sporosarcina är heterotrofa . De utför inte fotosyntes. Några få arter är obligatoriska aeroba , de behöver syre. Andra är fakultativa aeroba , de kan också utföra metabolism i frånvaro av syre.
Ekologi
Vissa arter, såsom S. ureae, har enzymet ureas och kan därmed bryta ner urea . Arten bildar den högsta befolkningstätheten i jordar som är utsatta för påverkan av urin. Dessa inkluderar till exempel ängar där boskap hålls. S. ureae spelar alltså en viktig roll i ekosystemet .
Molekylära signaturer
Analyser av genomsekvenser av Sporosarcina- arter identifierade åtta konserverade signaturindels (CSI) som är unikt närvarande i detta släkte i proteinerna aspartat-tRNA-ligas , A/G-specifikt adeninglykosylas, tymidylatsyntas , RDD-familjens protein, DEAD/DEAH box-helikas membranproteininsertas YidC, cytokrom b6 och ett hypotetiskt protein. Dessa molekylära signaturer ger en ny och pålitlig metod för att molekylärt skilja Sporosarcina- arter från andra släkten i familjen Caryophanaceae och andra bakterier.
Systematik
Sporosarcina tillhör Bacillota . Några exempel på arter:
- Sporosarcina luteola Tominaga et al. 2009
- Sporosarcina aquimarina Yoon et al. 2001
- Sporosarcina contaminans Kämpfer et al. 2010
- Sporosarcina globispora (Larkin och Stokes 1967) Yoon et al. 2001
- Sporosarcina newyorkensis Wolfgang et al. 2012
- Sporosarcina pasteurii (Miquel 1889) Yoon et al. 2001
- Sporosarcina psychrophila (Nakamura 1984) Yoon et al. 2001
- Sporosarcina saromensis An et al. 2007
- Sporosarcina siberiensis Zhang et al. 2014
- Sporosarcina soli Kwon et al. 2007
- Sporosarcina terrae Sun et al. 2017
- Sporosarcina thermotolerans Kämpfer et al. 2010
- Sporosarcina ureae (Beijerinck 1901) Kluyver och van Niel 1936
- ^ a b c d Garrity, George M. (2009). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: The Firmicutes, Volym 3 av Bergey's Manual of Systematic Bacteriology .
- ^ Schlegel, Hans G. (1992). Allgemeine Mikrobiologi . ISBN 3-13-444607-3 .
- ^ Gupta, Radhey S.; Patel, Sudip (2020-01-14). "Robust avgränsning av familjen Caryophanaceae (Planococcaceae) och dess olika släkten inklusive tre nya släkten baserade på fylogenomik och mycket specifika molekylära signaturer" . Frontiers in Microbiology . 10 : 2821. doi : 10.3389/fmicb.2019.02821 . ISSN 1664-302X . PMC 6971209 . PMID 32010063 .
- ^ JP Euzéby: Lista över prokaryota namn med stående i nomenklaturen (LPSN)
