Polynukleotid 5'-hydroxyl-kinas
| ATP-beroende polydeoxiribonukleotid 5'-hydroxyl-kinas- | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||||
| EG nr. | 2.7.1.78 | ||||||||
| CAS-nr. | 37211-65-7 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Inom enzymologi är en polynukleotid 5'-hydroxyl-kinas ( EC 2.7.1.78 ) ett enzym som katalyserar den kemiska reaktionen
- ATP + 5'-defosfo-DNA ADP + 5'-fosfo-DNA
Således är de två substraten för detta enzym ATP och 5'-defosfo-DNA, medan dess två produkter är ADP och 5'-fosfo-DNA. Polynukleotidkinas är ett T7-bakteriofag (eller T4-bakteriofag ) enzym som katalyserar överföringen av ett gamma- fosfat från ATP till den fria hydroxyländen av 5'- DNA eller RNA . Den resulterande produkten kan användas för att slutmärka DNA eller RNA, eller i ligeringsreaktioner.
Nomenklatur
Detta enzym tillhör familjen transferaser , speciellt de som överför fosforinnehållande grupper ( fosfotransferaser ) med en alkoholgrupp som acceptor. Det systematiska namnet på denna enzymklass är ATP:5'-defosfopolynukleotid 5'-fosfotransferas . Andra namn i vanligt bruk inkluderar:
- ATP:5'-defosfopolynukleotid 5'-fosfatas
- PNK
- polynukleotid 5'-hydroxylkinas (fosforylerande),
- 5'-hydroxylpolynukleotidkinas,
- 5'-hydroxyl polyribonukleotidkinas,
- 5'-hydroxyl RNA kinas,
- DNA 5'-hydroxylkinas,
- DNA kinas,
- polynukleotidkinas och
- polynukleotid 5'-hydroxikinas.
- Novogrodsky A, Hurwitz J (1966). "Den enzymatiska fosforyleringen av ribonukleinsyra och deoxiribonukleinsyra. I. Fosforylering vid 5'-hydroxyltermini". J. Biol. Chem . 241 (12): 2923–32. PMID 4287929 .
- Novogrodsky A, Tal M, Traub A, Hurwitz J (1966). "Den enzymatiska fosforyleringen av ribonukleinsyra och deoxiribonukleinsyra. II. Ytterligare egenskaper hos 5'-hydroxylpolynukleotidkinaset". J. Biol. Chem . 241 (12): 2933–43. PMID 4287930 .
externa länkar
