Phikmvvirus
| Phikmvvirus | |
|---|---|
| Virus klassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Duplodnaviria |
| Rike: | Heunggongvirae |
| Provins: | Uroviricota |
| Klass: | Caudoviricetes |
| Beställa: | Caudovirales |
| Familj: | Autographiviridae |
| Underfamilj: | Krylovirinae |
| Släkte: | Phikmvvirus |
Phikmvvirus är ett släkte av virus som infekterar bakterier . Det finns för närvarande 16 arter i detta släkte inklusive typen Pseudomonas virus phiKMV . Bakteriofag phiKMV och dess släktingar är kända för att vara mycket virulenta fager, som producerar stora (3–15 mm (0,12–0,59 tum) diameter) klara plack på en mottaglig värd. Det enda rapporterade undantaget är fag LKA1, som ger små plack (1 mm (0,039 tum)) omgivna av en halo. Medan alla andra P. aeruginosa -specifika phikmvvirus använder typ IV pili som primär receptor, fäster LKA1-partiklar till det bakteriella lipopolysackaridskiktet .
Taxonomi
Följande arter är erkända:
- Pseudomonas-virus 130-113
- Pseudomonas virus 15pyo
- Pseudomonas virus Ab05
- Pseudomonas virus ABTNL
- Pseudomonas virus DL62
- Pseudomonas-virus kF77
- Pseudomonas virus LKD16
- Pseudomonas virus LUZ19
- Pseudomonas virus MPK6
- Pseudomonas virus MPK7
- Pseudomonas virus NFS
- Pseudomonas-virus PAXYB1
- Pseudomonas virus phiKMV
- Pseudomonas virus PT2
- Pseudomonas virus PT5
- Pseudomonas virus RLP
Virologi
Elektronmikroskopisk avbildning av renade fagpartiklar avslöjade dessa fager som typiska medlemmar av Podoviridae , med en huvuddiameter på cirka 60 nm (2,4 × 10 -6 tum) och en stubbig svans med en längd på 8-10 nm. Även om phiKMV-fagen liknar det välstuderade podoviruset T7 i övergripande genomarkitektur , var det den första kända T7-liknande fagen som kodade för en enkelsubenhets- RNA-polymerasgen nedströms dess DNA -metabolismgener istället för i den tidiga genomiska regionen. Baserat på dessa egenskaper klassificeras släktet Phikmvvirus inom Autographiviridae .
| Släkte | Strukturera | Symmetri | Capsid | Genomiskt arrangemang | Genomisk segmentering |
|---|---|---|---|---|---|
| Phikmvvirus | Huvud-Svans | T=7 | Ej kuverterade | Linjär | Endelad |
Livscykel
Viral replikation är cytoplasmatisk. Inträde i värdcellen uppnås genom absorption i värdcellen. DNA-mallrad transkription är metoden för transkription. Viruset lämnar värdcellen genom lys, och holin/endolysin/spanin-proteiner. Bakterier fungerar som den naturliga värden. Överföringsvägar är passiv diffusion.
| Släkte | Värdinformation | Vävnadstropism | Inträdesuppgifter | Releaseinformation | Replikeringsplats | Monteringsplats | Överföring |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Phikmvvirus | Bakterie | Ingen | Injektion | Lysis | Cytoplasma | Cytoplasma | Passiv diffusion |
externa länkar