Teseptimavirus

Phage t7.png
Teseptimavirus
Escherichia virus T7
Virusklassificering
(orankad): Virus
Rike : Duplodnaviria
Rike: Heunggongvirae
Provins: Uroviricota
Klass: Caudoviricetes
Beställa: Caudovirales
Familj: Autographiviridae
Underfamilj: Studiervirinae
Släkte: Teseptimavirus

Teseptimavirus (synonymer T7 faggrupp , T7-liknande fager , T7-liknande virus , T7liknande virus ) är ett släkte av virus i ordningen Caudovirales , i familjen Autographiviridae , i underfamiljen Studiervirinae . Bakterier fungerar som den naturliga värden, med överföring som uppnås genom passiv diffusion. Det finns för närvarande 17 arter i detta släkte, inklusive typen Escherichia virus T7 .

Taxonomi

Följande arter är erkända:

  • Enterobakterievirus IME390
  • Escherichia-virus 13a
  • Escherichia virus 64795ec1
  • Escherichia virus C5
  • Escherichia-virus CICC80001
  • Escherichia virus Ebrios
  • Escherichia-virus EG1
  • Escherichia virus HZ2R8
  • Escherichia virus HZP2
  • Escherichia virus N30
  • Escherichia virus NCA
  • Escherichia virus T7
  • Salmonellavirus 3A8767
  • Salmonellavirus Vi06
  • Stenotrophomonas virus IME15
  • Yersinia-virus YpPY
  • Yersinia virus YpsPG

Strukturera

Sp6like-virus är icke-hölje , med huvud och svans. Huvudet har icosaedrisk symmetri (T=7) cirka 60 nm i diameter. Svansen är icke-sammandragande och har sex korta subterminala fibrer.

Släkte Strukturera Symmetri Capsid Genomiskt arrangemang Genomisk segmentering
Teseptimavirus Huvud-Svans T=7 Ej kuverterade Linjär Endelad

Genom

Genomerna är linjära, cirka 40-42 kb långa. Alla tre virusens genom är fullständigt sekvenserade och finns tillgängliga på NCBI:s hemsida. De sträcker sig mellan 37k och 40k nukleotider, med 42 till 60 proteiner. Alla tre fullständiga genom, såväl som flera ytterligare "oklassificerade" virusgenom, finns tillgängliga här

Livscykel

Viral replikation är cytoplasmatisk. Viruset fäster till värdcellens adhesionsreceptorer med hjälp av sina svansfibrer och skjuter ut det virala DNA:t i värdperiplasman via det korta svanssystemet . Klass I-gener transkriberas av värdcellens RNA-polymeras innan det virala genomet helt lämnar kapsiden. Klass II-gener transkriberas sedan av T7 RNA-polymeras och värdgenomet bryts ned. Genomiskt DNA replikeras av T7 DNA-polymeras och konkatemerer bildas innan klass III-gener transkriberas. Slutligen sätts prokapsiden ihop och packas, svansen sätts ihop och de mogna virionerna frisätts via lys. Bakterier fungerar som den naturliga värden. Överföringsvägar är passiv diffusion.

Släkte Värdinformation Vävnadstropism Inträdesuppgifter Releaseinformation Replikeringsplats Monteringsplats Överföring
Teseptimavirus Bakterie Ingen Injektion Lysis Cytoplasma Cytoplasma Passiv diffusion

Historia

Enligt ICTV :s andra rapport 1976 accepterades släktet T7likevirus först under namnet T7 faggrupp , utan tilldelning till en beställning, familj eller underfamilj. I ICTV:s tredje rapport 1981 klassificerades släktet i familjen Poloviridae . T7-faggruppen döptes om till T7-liknande fager i den sjätte rapporten 1995. 1998 flyttades hela familjen in i den nyskapade ordningen Caudovirales , och släktet döptes om igen i den sjunde rapporten 1999 till T7-liknande virus . 2009 flyttade släktet till den nyskapade underfamiljen Autographivirinae , och det döptes om igen 2012 till T7likevirus . Släktet döptes senare om till Teseptimavirus under den nyligen etablerade familjen Autographiviridae och underfamiljen Studiervirinae .

externa länkar