Flock House-virus

Flock House virus
Klassificering av virus
(orankad):	Virus
Rike :	Riboviria
Rike:	Orthornavirae
Provins:	Kitrinoviricota
Klass:	Magsaviricetes
Beställa:	Nodamuvirales
Familj:	Nodaviridae
Släkte:	Alfanodavirus
Arter:	Flock House-virus

Flock House-virus (FHV) är i alphanodavirus -släktet av virusfamiljen Nodaviridae . Flock House-virus isolerades från en gräslarv ( Costelytra Zealandica ) vid forskningsstationen Flock House i Bulls, Nya Zeeland . FHV är ett omfattande studerat virus och anses vara ett modellsystem för studiet av andra icke-höljeförsedda RNA-virus på grund av dess ringa storlek och genetiska följsamhet, särskilt för att studera rollen av den övergående exponerade hydrofoba gammapeptiden och metastabiliteten hos den virala kapsiden . FHV kan konstrueras i insektscellkultur vilket möjliggör skräddarsydd produktion av naturliga eller muterade autentiska virioner eller virusliknande partiklar. FHV är en plattform för nanoteknik och nanomedicin, till exempel för epitopvisning och vaccinutveckling. Viralt inträde i värdceller sker via receptormedierad endocytos. Receptorbindning initierar en sekvens av händelser under vilka viruset utnyttjar värdmiljön för att leverera den virala lasten till värdcytosolen. Receptorbindning leder till metastabiliteten hos kapsidproteinerna, vars koordinerade omarrangemang är avgörande för efterföljande steg i infektionsvägen. Dessutom är den övergående exponeringen av en kovalent oberoende hydrofob y-peptid ansvarig för att bryta cellmembran och är sålunda väsentlig för det virala inträdet av FHV i värdceller.

Genom

Flockhusvirusgenom och funktionell karta över replikasprotein A.

Flock House-virus är ett litet, icke-hölje, ikosaedriskt T=3-insektsvirus som innehåller ett tvådelat positivt sens ssRNA-genom som omfattar två gener: RNA1 (3,1 kb) och RNA2 (1,4 kb). RNA1 kodar för det RNA-beroende RNA-polymeraset och innehåller också ett ramförskjutet subgenomiskt RNA 3 (369 nts) som kodar för protein B2, ansvarigt för hämning av RNAi-vägar. RNA2 kodar för kapsidprekursorn, alfa, varav 180 kopior bildar den virala kapsiden av FHV. Vid mognad genomgår alfa en autokatalytisk klyvning i sin C-terminal för att bilda beta, som bildar den huvudsakliga strukturella kapsidkomponenten, och gamma, en kort hydrofob peptid som krävs för endosompenetration som förblir associerad med den virala kapsiden. Virusliknande partiklar (VLPs) av FHV bildas spontant i S. frugiperda- cellinjer (t.ex. Sf21) när RNA2 uttrycks från en bakulovirusvektor och paketerar cellulära RNA.

Räckvidd

FHV isolerades ursprungligen från Nya Zeelands gräsvallar ( Costelytra zealandica ) i den tidigare Flock House jordbruksanläggning i Bulls, Ragnitikei, Nya Zeeland. Isolat passerades i Drosophila -celler i kultur, som därefter visades uppvisa celldöd (cytopatisk effekt). FHV kan också infektera levande flugor. FHV har visat sig infektera medicinskt viktiga släkten av insekter: myggor, t.ex. Anopheles gambiae; tsetseflugan; och Chagas-vektorn, Rhodnius prolixus Stal. Infektion av dessa organismer med FHV har visat sig ha liknande egenskaper i termer av viral titer, virusspridning och mortalitet som har visats för infektioner med fruktflugor.

Kapsidstruktur

Strukturen och biofysikaliska egenskaperna hos autentiska virioner av FHV och hos virusliknande partiklar (VLP) har studerats omfattande.

Andra studier

FHV har tillhandahållit ett modellsystem för studier av uppkomsten och utvecklingen av defekt-interfererande RNA (DI-RNA).