NC10 fil
NC10 phylum | |
---|---|
CLSM bild av en mikrokoloni av NC10 bakterier ( Ca. Methylomirabilis sinica ) Vetenskaplig | |
klassificering | |
Domän: | |
Provins: |
"Methylomirabilota"
|
Klass: |
"Methylomirabilia"
|
Order | |
|
|
Synonymer | |
|
NC10 är en bakteriefilum med kandidatstatus , vilket innebär att dess medlemmar förblir oodlade till dags dato. Svårigheten att producera labbkulturer kan vara kopplad till låga tillväxthastigheter och andra begränsande tillväxtfaktorer.
Methylomirabilis oxyfera , en medlem av NC10 phylum, är den första organismen som upptäckts för att koppla metanoxidation till reduktionen av nitrit till dikväve (N 2 ). Detta är betydelsefullt av flera skäl. För det första finns det bara tre andra biologiska vägar kända för att producera syre ( fotosyntes , kloratandning och avgiftning av reaktiva syrearter) . För det andra länkar anaerob metanoxidation (AMO) kopplad till nitritreduktion de globala kol- och kvävecyklerna , och på så sätt kan denitrifierande metanotrofer i NC10-fylumet påverka metanhalten i atmosfären. För det tredje öppnar detta fynd möjligheten att syre var tillgängligt i atmosfären före utvecklingen av syrehaltig fotosyntes och den stora oxidationshändelsen , som utmanar vissa aspekter av moderna teorier om utvecklingen av tidiga liv på jorden.
NC10-filen föreslogs först 2003 på basis av mycket divergerande 16S rRNA-gensekvenser från vattenlevande mikrobiella formationer i översvämmade grottor (Nullarbor-grottor, Australien). De första genominsikterna för filumen publicerades 2010. Medlemmar av NC10-filumen har upptäckts i miljöer inklusive Brunssummerheides torvmarker (Limburg, Nederländerna), den djupt skiktade sjön Zug (Centralschweiz) och ett risfält med långvarig befruktning (Hangzhou, Kina)
NC10-arter som hittills föreslagits inkluderar Methylomirabilis oxyfera och Methylomirabilis lanthanidiphila
Taxonomi
120 markörproteiner baserade GTDB 07-RS207 | |||||||||||||||||||||
|
Den för närvarande accepterade taxonomin är baserad på listan över prokaryota namn med stående i nomenklaturen (LPSN) och National Center for Biotechnology Information (NCBI). Men många taxonomiska namn är hämtade från Genome Taxonomy Database release 06-RS202.
- Klass "Methylomirabilia"
- Beställ "Rokubacteriales" (CSP1-6)
- Beställ "Methylomirabilales" Cabrol et al. 2020 (NC10)
- Familj "Methylomirabilaceae"
- Släktet " Candidatus Methylomirabilis " Ettwig et al. 2010
- " Ca.M. lanthanidiphila" Versantvoort et al. 2018
- " Ca.M. limnetica" Graf et al. 2018
- " Ca. M. oxygeniifera " corrig. Ettwig et al. 2010
- " Ca.M. sinica" He et al. 2016
- Släktet " Candidatus Methylomirabilis " Ettwig et al. 2010
- Familj "Methylomirabilaceae"