NC10 fil

41598 2016 Article BFsrep32241 Fig4k HTML.png
NC10 phylum
CLSM bild av en mikrokoloni av NC10 bakterier ( Ca. Methylomirabilis sinica ) Vetenskaplig
klassificering
Domän:
Provins:
"Methylomirabilota"
Klass:
"Methylomirabilia"
Order
  • "Rokubacteriales"
  • "Methylomirabilales"
Synonymer
  • "Rokubacteria" Hug et al. 2016

NC10 är en bakteriefilum med kandidatstatus , vilket innebär att dess medlemmar förblir oodlade till dags dato. Svårigheten att producera labbkulturer kan vara kopplad till låga tillväxthastigheter och andra begränsande tillväxtfaktorer.

Methylomirabilis oxyfera , en medlem av NC10 phylum, är den första organismen som upptäckts för att koppla metanoxidation till reduktionen av nitrit till dikväve (N 2 ). Detta är betydelsefullt av flera skäl. För det första finns det bara tre andra biologiska vägar kända för att producera syre ( fotosyntes , kloratandning och avgiftning av reaktiva syrearter) . För det andra länkar anaerob metanoxidation (AMO) kopplad till nitritreduktion de globala kol- och kvävecyklerna , och på så sätt kan denitrifierande metanotrofer i NC10-fylumet påverka metanhalten i atmosfären. För det tredje öppnar detta fynd möjligheten att syre var tillgängligt i atmosfären före utvecklingen av syrehaltig fotosyntes och den stora oxidationshändelsen , som utmanar vissa aspekter av moderna teorier om utvecklingen av tidiga liv på jorden.

NC10-filen föreslogs först 2003 på basis av mycket divergerande 16S rRNA-gensekvenser från vattenlevande mikrobiella formationer i översvämmade grottor (Nullarbor-grottor, Australien). De första genominsikterna för filumen publicerades 2010. Medlemmar av NC10-filumen har upptäckts i miljöer inklusive Brunssummerheides torvmarker (Limburg, Nederländerna), den djupt skiktade sjön Zug (Centralschweiz) och ett risfält med långvarig befruktning (Hangzhou, Kina)

NC10-arter som hittills föreslagits inkluderar Methylomirabilis oxyfera och Methylomirabilis lanthanidiphila

Taxonomi

120 markörproteiner baserade GTDB 07-RS207

"Rokubacteriales"

  " Ca. Methylomirabilis "

" Ca. M. limnetica "

" Ca. M. lanthanidiphila "

" Ca. M. oxygeniifera "

Den för närvarande accepterade taxonomin är baserad på listan över prokaryota namn med stående i nomenklaturen (LPSN) och National Center for Biotechnology Information (NCBI). Men många taxonomiska namn är hämtade från Genome Taxonomy Database release 06-RS202.

  • Klass "Methylomirabilia"
    • Beställ "Rokubacteriales" (CSP1-6)
    • Beställ "Methylomirabilales" Cabrol et al. 2020 (NC10)
      • Familj "Methylomirabilaceae"
        • Släktet " Candidatus Methylomirabilis " Ettwig et al. 2010
          • " Ca.M. lanthanidiphila" Versantvoort et al. 2018
          • " Ca.M. limnetica" Graf et al. 2018
          • " Ca. M. oxygeniifera " corrig. Ettwig et al. 2010
          • " Ca.M. sinica" He et al. 2016

Se även