Lysin 2,3-aminomutas
| Lysin 2,3- | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| aminomutasidentifierare | |||||||||
| EG nr. | 5.4.3.2 | ||||||||
| CAS-nr. | 9075-20-1 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| |||||||||
Lysin 2,3-aminomutas (KAM eller LAM) ( EC 5.4.3.2 ) är ett radikalt SAM- enzym som underlättar omvandlingen av aminosyran lysin till beta-lysin . Den åstadkommer denna omvandling med hjälp av tre kofaktorer och en 5'- deoxiadenosylradikal bildad i en S-Adenosylmetionin ( SAM) aktiverad radikalreaktionsväg. [1] Den generaliserade reaktionen visas nedan:
Strukturera
Till höger visas den tredimensionella strukturen av lysin-2,3-aminomutasproteinet. Strukturen bestämdes genom röntgenkristallografi till 2,1 Ångströms upplösning och sågs kristallisera som en homotetramer. [2] KAM renades och karakteriserades först i Clostridium subterminale för studier av lysinmetabolism.
Kofaktorer
Fyra nyckelkofaktorer krävs för reaktionen som katalyseras av lysin-2,3-aminomutasenzymet. Dom är:
- S-Adenosylmetionin (SAM): Hjälper till att generera radikalmellanprodukten genom att låna en elektron.
- Pyridoxalfosfat (PLP): Ansvarig för bindning av aminosyran under reaktion. Pi-systemet för denna molekyl underlättar radikal delokalisering under bildning av en aziridinylradikal. Strukturen ges nedan:
- Zinkmetall : Krävs för koordination mellan dimererna i proteinet.
- Järn-svavelkluster : En 4 järn-4 svavelkluster krävs för bildning av en 5'-deoxiadenosylradikal. Denna radikal fungerar sedan som den "stabila" radikalbäraren i reaktionsmekanismen som överför radikalen till aminosyran.
Reaktionsmekanism
Den generaliserade reaktionen sker i 5 steg:
- Radikalbildning : En "stabil" radikal bildas genom en radikal SAM- mekanism i vilken en S-adenosylmetionin bildar en 5'-deoxiadenosylradikal.
- Enzymbindning : Lysin 2,3-aminomutas binder till pyridoxalfosfat (PLP).
- Aminosyrabindning : Aminosyran (lysin eller beta-lysin beroende på framåt- eller omvända reaktioner) binder till pyridoxalfosfat.
- Radikalöverföring : 5'-deoxiadenosylradikalen överförs till aminosyran och en aziridinylradikal bildas. I denna konfiguration stabiliseras radikalen av pi-systemet av pyridoxalfosfat.
- Aminosyraomvandling : I det sista steget bildas den nya aminosyran och radikalen återförs till sitt mer stabila tillstånd på 5'-deoxiadenosylen.
Reaktionsmekanismen som beskrivs ovan visas nedan:
externa länkar
- Lysin+2,3-aminomutas vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
