Holo-(acyl-bärar-protein)-syntas
| fosfonantetenyltransferas | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 holo-[acyl-bärarprotein] syntas trimer, Helicobacter pylori
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| EG nr. | 2.7.8.7 | ||||||||
| CAS-nr. | 37278-30-1 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| ACPS | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 kristallstruktur av 4'-fosfopantetheinyltransferas sfp-koenzym a-komplex
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| Symbol | ACPS | ||||||||
| Pfam | PF01648 | ||||||||
| InterPro | IPR008278 | ||||||||
| SCOP2 | 1qr0 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Inom enzymologi och molekylärbiologi är ett holo-[acyl-bärarprotein]-syntas (ACPS, EC 2.7.8.7 ) ett enzym som katalyserar den kemiska reaktionen:
- CoA-[4'-fosfopantein] + apo- acylbärarprotein adenosin 3',5'-bisfosfat + holoacylbärarprotein
Detta enzym tillhör familjen transferaser , speciellt de som överför icke-standardiserade substituerade fosfatgrupper. Det är också känt som 4'-fosfonantetinyltransferas efter gruppen det överför.
Fungera
Alla ACPS - enzymer kända hittills är evolutionärt relaterade till varandra i en enda superfamilj av proteiner . Det överför en 4'- fosfopantein (4'-PP) del från koenzym A (CoA) till ett invariant serin i ett acylbärarprotein (ACP), ett litet protein som ansvarar för acylgruppaktivering i fettsyrabiosyntes . Denna - translationella modifiering gör holo-ACP kapabel till acylgruppaktivering via tioesterifiering av cysteamintiolen av 4'-PP. Denna superfamilj består av två undertyper: den trimera ACPS-typen såsom E. coli ACPS och den monomera Sfp-typen (PCP-syntetiserande) såsom B. subtilis SFP. Strukturer från båda familjerna är nu kända. Den aktiva platsen rymmer en magnesiumjon . De mest konserverade regionerna av proteinet är involverade i bindningen av magnesiumjonen .
Nomenklatur
Det systematiska namnet på denna enzymklass är CoA-[4'-fosfopantein]:apo-[acyl-bärarprotein] 4'-pantetinfosfotransferas . Andra namn i vanlig användning, utan hänsyn till stavningsskillnaden mellan syntetas/syntas, inkluderar acylbärarproteinholoproteinsyntetas, holo-ACP-syntetas, koenzym A:fettsyrasyntetasapoenzym 4'-fosfopantein, acylbärarproteinsyntetas (ACPS), PPTas, acylbärare proteinsyntas, P-panttransferas och CoA:apo-[acyl-bärarprotein] panteteinfosfotransferas.
Strukturstudier
I slutet av 2007 har 8 strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB- accessionskoderna 1F7L , 1F7T , 1F80 , 1FTE , 1FTF , 1FTH , 2JBZ och 2JCA .
Vidare läsning
- Elovson J, Vagelos PR (juli 1968). "Acylbärarprotein. X. Acylbärarproteinsyntetas". Journal of Biological Chemistry . 243 (13): 3603–11. PMID 4872726 .
- Prescott DJ, Vagelos PR (1972). "Acylbärarprotein". Framsteg inom enzymologi och relaterade områden inom molekylärbiologi . Framsteg inom enzymologi - och relaterade områden inom molekylärbiologi. Vol. 36. s. 269–311. doi : 10.1002/9780470122815.ch8 . ISBN 9780470122815 . PMID 4561013 .
- Lambalot RH, Gehring AM, Flugel RS, Zuber P, LaCelle M, Marahiel MA, Reid R, Khosla C, Walsh CT (november 1996). "En ny enzymsuperfamilj - fosfopantetheinyltransferaserna" . Kemi & biologi . 3 (11): 923–36. doi : 10.1016/S1074-5521(96)90181-7 . PMID 8939709 .
- Walsh CT, Gehring AM, Weinreb PH, Quadri LE, Flugel RS (oktober 1997). "Post-translationell modifiering av polyketid- och icke-ribosomala peptidsyntaser". Aktuell åsikt i kemisk biologi . 1 (3): 309–15. doi : 10.1016/S1367-5931(97)80067-1 . PMID 9667867 .
- Mootz HD, Finking R, Marahiel MA (oktober 2001). "4'-fosfopanteinöverföring i primär och sekundär metabolism av Bacillus subtilis" . Journal of Biological Chemistry . 276 (40): 37289–98. doi : 10.1074/jbc.M103556200 . PMID 11489886 .
- Joshi AK, Zhang L, Rangan VS, Smith S (augusti 2003). "Klonning, uttryck och karakterisering av ett humant 4'-fosfopanteteinyltransferas med bred substratspecificitet" . Journal of Biological Chemistry . 278 (35): 33142–9. doi : 10.1074/jbc.M305459200 . PMID 12815048 .
