Fytoreovirus
|
|
| Phytoreovirus | |
|---|---|
| Cryo-EM av proteinkapsidstruktur av risdvärgvirus ( RDV) | |
| Virusklassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Riboviria |
| Rike: | Orthornavirae |
| Provins: | Duplornaviricota |
| Klass: | Resentoviricetes |
| Beställa: | Reovirales |
| Familj: | Reoviridae |
| Underfamilj: | Sedoreovirinae |
| Släkte: | Fytoreovirus |
Phytoreovirus är ett släkte av virus , i familjen Reoviridae , i underfamiljen Sedoreovirinae . De är reovirus utan torn som är stora jordbrukspatogener, särskilt i Asien . Oryza sativa för RDV och RGDV, tvåhjärtbladiga för WTV, och bladhoppare fungerar som naturliga värdar. Det finns tre arter i detta släkte. Sjukdomar associerade med detta släkte inkluderar: WTV: gallor (tumör). RDV: dvärg (eller stunt) sjukdom av ris. RGDV: dvärgväxt, hämmande och gallor.
Klassificering
En medlem av denna familj, Rice Dwarf Virus (RDV), har studerats omfattande genom elektronkryomikroskopi och röntgenkristallografi . Från dessa analyser har atommodeller av kapsidproteinerna och en rimlig modell för kapsidsammansättning härletts. Medan de strukturella proteinerna i RDV inte delar någon sekvenslikhet med andra proteiner, liknar deras veck och den övergripande kapsidstrukturen de hos andra reovirus.
Fytoreovirus är unika bland reovirus genom att det finns 12 dsRNA-segment i varje virus. Liksom alla andra reovirus innehåller de sitt eget RNA-beroende RNA-polymeras , vilket möjliggör endogen syntes av viralt mRNA i viruset. Även om de är mindre väl studerade än ortoreovirus och orbivirus , har avsevärda strukturella och biokemiska studier genomförts för att karakterisera fytoreovirus, som i allmänhet infekterar växter. Det finns tre kända fytoreovirus: sårtumörvirus (WTV), risdvärgvirus (RDV) och risgalldvärgvirus (RGDV). Möjliga ytterligare familjemedlemmar inkluderar tobacco leaf enation virus (TLEF), rice bunchy stunt virus och sötpotatisvirus (ICTV, VIDE). Det finns också flera RDV-isolat, som alla delar över 90 % sekvensidentitet. Av dessa fytoreovirus har RDV studerats omfattande och är den bäst karakteriserade medlemmen. Det mesta av vår kunskap om fytoreovirus sammansättning och struktur är baserad på strukturella data ackumulerade i RDV-studier.
Taxonomi
Följande tre arter tilldelas släktet:
- Risdvärgvirus
- Risgalldvärgvirus
- Sårtumörvirus
Strukturera
Virus i Phytoreovirus är icke-hölje, med icosaedriska geometrier och T=13, T=2 symmetri. Diametern är cirka 70 nm. Genom är linjära och segmenterade. Segment varierar i storlek från 1066 till 4423 baspar, vilket resulterar i en total genomlängd på cirka 26kb. Genomet kodar för 15 proteiner och har 4 öppna läsramar.
| Släkte | Strukturera | Symmetri | Capsid | Genomiskt arrangemang | Genomisk segmentering |
|---|---|---|---|---|---|
| Fytoreovirus | Icosahedral | T=13, T=2 | Ej kuverterade | Linjär | Segmenterad |
Livscykel
Viral replikation är cytoplasmatisk. Inträde i värdcellen uppnås genom penetration in i värdcellen. Replikationen följer den dubbelsträngade RNA-virusreplikationsmodellen. Dubbelsträngad RNA-virustranskription är metoden för transkription. Viruset lämnar värdcellen genom monopartit icke-tubulistyrd viral rörelse. Oryza sativa för rdv och rgdv och tvåhjärtbladiga för wtv fungerar som den naturliga värden. Viruset överförs via en vektor (mekanisk inokulering av insekter i växt av bladhoppare). Överföringsvägar är vektor och mekaniska.
| Släkte | Värdinformation | Vävnadstropism | Inträdesuppgifter | Releaseinformation | Replikeringsplats | Monteringsplats | Överföring |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Fytoreovirus | Oryza sativa; lövhoppare | Floem | Viral rörelse; mekanisk ympning | Celldöd | Cytoplasma | Cytoplasma | Lövhoppare |