Fervidobacterium islandicum

Fervidobacterium islandicum
Vetenskaplig klassificering
Domän:	Bakterie
Provins:	Termotogota
Klass:	Thermotogae
Beställa:	Thermotogales
Familj:	Thermotogaceae
Släkte:	Fervidobacterium
Arter:	F. islandicum
Binomialt namn
	Fervidobacterium islandicum; Huber et al. 1991

Fervidobacterium islandicum är en art av extremt termofila anaeroba bakterier, först isolerad från en isländsk varm källa.

Biologi och biokemi

Morfologi

F. islandicum - celler är gramnegativa rörliga stavar, ca 1,8 μm långa och 0,6 μm breda som förekommer ensamma eller i par. Cirka 50 % av cellerna bildar stora sfäroider i ena änden, känd som en " toga" som vanligtvis finns i medlemmar av phylum Thermotogota (tidigare Thermotogae )

Fysiologi

F. islandicum isolat H21 växer i ett pH -område från 6,0 till 8,0 med ett optimum runt 7,2. Tillväxt observeras vid ett temperaturområde mellan 40 °C och 80 °C, med ett optimum på 70 °C. Vid en temperatur på 65 °C har stam H21 en fördubblingstid på 150 minuter.

Kulturtillväxt

Tillväxt av isolat H21 kräver låga mängder (0,3%) av jästextrakt . När detta används som en enda kol- och energikälla är den slutliga cellkoncentrationen 1x107 ^celler /ml. Tillväxten förbättras kraftigt genom tillsats av 0,2 % pyruvat , ribos , glukos , maltos , raffinos , stärkelse och, mindre effektivt, cellulosa . Slutliga cellkoncentrationer med dessa tillsatser kan variera från 2 till 5x10 ⁸ . I närvaro av glukos F. islandicum följande slutprodukter: L(+) laktat , acetat , etanol , H ₂ och CO ₂ . Isolat H21 visar känslighet för vanliga antibiotika, dess tillväxt hämmas genom tillsats av vankomycin , streptomycin , ampicillin , kloramfenikol och rifampicin vid 10 $\mu$ g/ml.

Genomik

F. islandicum -stam AW-1 har en total genomstorlek på 2,4 miljoner baspar , vilket är något större än genomen från andra Fervidobacterium -stammar. Den har en G + C-halt på 40,7 %. Den innehåller 2 184 proteinkodande gener i totalt 2 248 gener.

Miljö

F. islandicum isolerades ursprungligen från en isländsk varm källa på stranden av floden Varma nära Hverager $\eth$ i , Island. De anaeroba proverna togs från hett vatten och lera. Här låg temperaturerna mellan 70 °C och 102 °C och pH mellan 1,5 och 9.

Biotekniska tillämpningar

F. islandicum AW-1 är kapabel till fullständig fjädernedbrytning vid 70 °C och ett pH på 7. Fjäderkeratin har ett mycket högt cysteininnehåll, vilket gör det mycket stelt och svårt att smälta. 5 miljoner ton kycklingfjädrar genereras av fjäderfäindustrin varje år, vilket gör kycklingfjädrar till ett allvarligt problem med fast avfall. Därför F. islandicums förmåga att degradera inhemska kycklingfjädrar mycket tilltalande. ^{[ citat behövs ]}

Vidare läsning

Ravot, Gilles, et al. "L-Alaninproduktion från glukosfermentering av hypertermofila medlemmar av domänerna Bacteria och Archaea: en rest av en förfäders metabolism?" Applied and Environmental Microbiology 62.7 (1996): 2657-2659.
Dworkin, Martin och Stanley Falkow, red. The Prokaryotes: Vol. 7: Proteobakterier: Delta- och Epsilon-underklasser. Djupt rotande bakterier. Vol. 7. Springer, 2006.
Gödde C, Sahm K, Brouns SJ, Kluskens LD, van der Oost J, de Vos WM, et al. (2005). "Klonning och uttryck av islandisin, ett nytt termostabilt subtilisin från Fervidobacterium islandicum, i Escherichia coli" . Appl Environ Microbiol . 71 (7): 3951–8. doi : 10.1128/AEM.71.7.3951-3958.2005 . PMC 1168981 . PMID 16000809 .
Nam GW, Lee DW, Lee HS, Lee NJ, Kim BC, Choe EA, et al. (2002). "Native-feather degradering av Fervidobacterium islandicum AW-1, en nyligen isolerad keratinas-producerande termofil anaerob". Arch Microbiol . 178 (6): 538–47. doi : 10.1007/s00203-002-0489-0 . PMID 12420177 . S2CID 39043722 .
Jabbour, Dina; Klippel, Barbara; Antranikian, Garabed (2011). "Ett nytt termostabilt och glukostolerant β-glukosidas från Fervidobacterium islandicum". Tillämpad mikrobiologi och bioteknik . 93 (5): 1947–1956. doi : 10.1007/s00253-011-3406-0 . ISSN 0175-7598 . PMID 22146852 . S2CID 18254613 .
de la Tour, Claire Bouthier; Portemer, Christiane; Forterre, Patrick; Huber, Robert; Duguet, Michel (1993). "ATP-oberoende DNA-topoisomeras från Fervidobacterium islandicum". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Genstruktur och uttryck . 1216 (2): 213–220. doi : 10.1016/0167-4781(93)90147-6 . ISSN 0167-4781 . PMID 8241262 .

externa länkar