Ferredoxin-tioredoxinreduktas

Ferredoxin tioredoxin reduktas variabel alfakedja
PDB 1dj7 EBI.jpg
kristallstruktur av ferredoxin tioredoxin reduktas
Identifierare
Symbol FeThRed_A
Pfam PF02941
InterPro IPR004207
SCOP2 1dj7 / SCOPe / SUPFAM
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning
Ferredoxin tioredoxin reduktas katalytisk beta kedja
PDB 1dj7 EBI.jpg
kristallstruktur av ferredoxin tioredoxin reduktas
Identifierare
Symbol FeThRed_B
Pfam PF02943
InterPro IPR004209
SCOP2 1dj7 / SCOPe / SUPFAM
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Ferredoxin-tioredoxinreduktas EC 1.8.7.2 , systematiskt namn ferredoxin:tioredoxindisulfidoxidoreduktas, är ett [4Fe-4S] -protein som spelar en viktig roll i den reglerande kedjan av ferredoxin / tioredoxin . Det katalyserar följande reaktion:

2 reducerat ferredoxin + tioredoxindisulfid 2 oxiderade ferredoxin + tioredoxin- tioler + 2 H +

Ferredoxin-tioredoxinreduktas (FTR) omvandlar en elektronsignal (fotoreducerat ferredoxin) till en tiolsignal (reducerat tioredoxin), vilket reglerar enzymer genom reduktion av specifika disulfidgrupper . Det katalyserar den ljusberoende aktiveringen av flera fotosyntesenzymer och utgör det första historiska exemplet på en tiol/disulfidutbyteskaskad för enzymreglering . Det är en heterodimer av subenhet alfa och subenhet beta. Subenhet alfa är den variabla subenheten och beta är den katalytiska kedjan. Strukturen - subenheten har bestämts och funnits vika sig runt FeS -klustret.

Biologisk funktion

Stora grupper av syreproducerande, fotosyntetiska organismer såsom cyanobakterier , alger , C4 , C3 och växter med syremetabolism (CAM) använder Ferredoxin-tioredoxinreduktas för reglering av kolfixering . FTR, som en del av ett större Ferredoxin-Thioredoxin-system, tillåter växter att ändra sin ämnesomsättning baserat på ljusintensitet. Specifikt kontrollerar Ferredoxin-Thioredoxin-systemet enzymer i Calvin-cykeln och pentosfosfatvägen - vilket tillåter växter att balansera kolhydratsyntes och nedbrytning baserat på tillgången på ljus. I ljuset utnyttjar fotosyntes ljusenergi och minskar Ferredoxin . Genom att använda FTR, reducerat Ferredoxin minskar sedan Thioredoxin . Tioredoxin, genom tiol/disulfid-utbyte , aktiverar sedan kolhydratsyntesenzymer såsom kloroplastfruktos -1,6-bisfosfatas , sedoheptulos-bisfosfatas och fosforibulokinas . Som ett resultat använder ljus FTR för att aktivera kolhydratbiosyntesen. I mörker förblir Ferredoxin oxiderat. Detta lämnar Thioredoxin inaktivt och tillåter nedbrytning av kolhydrater att dominera ämnesomsättningen.

Strukturera

Ferredoxin-tioredoxinreduktas är en α-β- heterodimer på cirka 30 kDa. FTR-struktur över olika växtarter inkluderar en konserverad katalytisk β-subenhet och en variabel α-subenhet. Strukturen för FTR från Synechocystis sp. PCC6803 har studerats i detalj och lösts vid 1,6 Å. FTR liknar en tunn konkav skiva, 10 Å tvärs över mitten där ett [4Fe-4S-kluster] finns. Ena sidan av klustercentret innehåller redoxaktiva disulfidbindningar som reducerar Thioredoxin medan den motsatta dockar med reducerat Ferredoxin. Denna tvåsidiga skivstruktur tillåter FTR att samtidigt interagera med Thioredoxin och Ferredoxin.

[4Fe-4S]-kluster i den katalytiska β-subenheten för Ferredoxin-tioredoxinreduktas är omgiven av flera cysteinrester.

Den variabla α-subenheten har en öppen β-cylinderstruktur gjord av fem antiparallella β-strängar . Dess interaktion med den katalytiska subenheten sker huvudsakligen med två slingor mellan β-strängar. Resterna i dessa två slingor är mestadels konserverade och tros stabilisera 4Fe-4S-klustret i den katalytiska subenheten. Strukturellt är a-subenheten mycket lik PsaE-proteinet, en subenhet av Photosystem I , även om likheten inte ses i deras sekvenser eller funktioner.

Den katalytiska β-subenheten har en generell α-helixstruktur med ett [4Fe-4S-centrum] . FeS-centret och redoxaktiva cysteinrester är belägna inom slingorna i dessa helixar. Cystein-55, 74, 76 och 85 är koordinerade till järnatomerna i klustret av kubansk typ .

Enzymatisk mekanism

FTR är unikt bland tioredoxinreduktaser eftersom det använder en Fe-S-klusterkofaktor snarare än flavoproteiner för att reducera disulfidbindningar. FTR-katalys börjar med dess interaktion med reducerat Ferredoxin. Detta fortsätter med attraktionen mellan FTR Lys-47 och Ferredoxin Glu-92. En elektron från Ferredoxin och en elektron från Fe-S-centret abstraheras för att bryta FTR:s Cys-87- och Cys-57-disulfidbindning, skapa en nukleofil Cys-57 och oxidera Fe-S-centret från [4Fe-4S] 2+ till [4Fe-4S] 3+ . Strukturen hos denna enelektron (från Ferredoxin) mellanprodukt är ifrågasatt: Staples et al. föreslår att Cys-87 är koordinerad till en svavel i Fe-S-centret medan Dai et al. hävdar att Cys-87 är koordinerad till ett järn. Därefter angriper den nukleofila Cys-57, uppmuntrad av en intilliggande histidinrest , en disulfidbrygga på Thioredoxin, vilket skapar en hetero-disulfid Thioredoxin-mellanprodukt. Slutligen levererar en nyligen dockad Ferredoxin-molekyl den slutliga elektronen till FeS-centret, reducerar den till sitt ursprungliga 2+-tillstånd, reformerar Cys-87, Cys-57-disulfiden och reducerar tioredoxin till två tioler .

Den här artikeln innehåller text från det offentliga området Pfam och InterPro : IPR004209
Den här artikeln innehåller text från det offentliga området Pfam och InterPro : IPR004207

externa länkar