Troligt ATP-beroende RNA-helikas DHX36 även känt som DEAH boxprotein 36 (DHX36) eller MLE-liknande protein 1 (MLEL1) eller G4 resolvas 1 (G4R1) eller RNA-helikas associerat med AU-rika element ( RHAU ) är ett enzym som i människor kodas av DHX36 -genen .
Strukturellt är DHX36 ett 1008 aminosyror långt modulärt protein som har kristalliserats i ett komplex med ett DNA G-quadruplex. Den består av en ~440-aminosyror helikaskärna som omfattar alla signaturmotiv av DEAH/RHA-familjen av helikaser med N- och C-terminala flankerande regioner på ~180 respektive ~380 aminosyror. En del av den N-terminala flankerande regionen bildar en alfa-helix som kallas det DHX36-specifika motivet, som känner igen den 5'-mest G-quadruplex-kvartetten. Den OB-faldiga domänen binder till sockerfosfatryggraden längst 3' i G-kanalen. Liksom alla DEAH/RHA-helikaser är den helikasassocierade domänen belägen intill helikaskärnregionen och upptar 75 % av den C-terminala regionen.
Fungera
DEAH/RHA-proteiner är RNA- och DNA-helikaser som typiskt kännetecknas av translokation med låg processivitet på substrat och förmågan att binda/avveckla icke-kanoniska sekundära nukleinsyrastrukturer. De är inblandade i ett antal cellulära processer som involverar förändring av RNAs sekundära struktur, såsom translationsinitiering, nukleär och mitokondriell splitsning och ribosom- och spliceosomsammansättning . Baserat på deras distributionsmönster, tros vissa medlemmar av denna DEAH/RHA-proteinfamilj vara involverade i embryogenes , spermatogenes och cellulär tillväxt och delning.
DHX36 uppvisar en unik ATP-beroende guanin-quadruplex (G4) resolvasaktivitet och specificitet för sitt substrat in vitro . DHX36 visar repetitiv avlindningsaktivitet som en funktion av den termiska stabiliteten hos G-quadruplex-substratet, karakteristiskt för ett antal andra G-quadruplex-resolvaser såsom BLM/WRN-helikaser. DHX36 binder G4-nukleinsyra med subnanomolär affinitet och lindar upp G4-strukturer mycket mer effektivt än dubbelsträngad nukleinsyra. I enlighet med dessa biokemiska observationer identifierades DHX36 också som huvudkällan till tetramolekylär RNA-upplösande aktivitet i HeLa-cellysat.
Tidigare arbete visade att DHX36 associerar med mRNA och återlokaliserar till stressgranuler (SGs) vid translationsstopp inducerad av olika miljöpåfrestningar. En region av de första 105 aminosyrorna visade sig vara kritisk för RNA-bindning och omlokalisering till SGs.
Fu JJ, Li LY, Lu GX (september 2002). "Molekylär kloning och karakterisering av mänskliga DDX36 och mus Ddx36 gener, nya medlemmar av DEAD/H box superfamiljen". Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao Acta Biochimica och Biophysica Sinica . 34 (5): 655–61. PMID 12198572 .
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (maj 2004). "Robust fosfoproteomisk profilering av tyrosinfosforyleringsställen från mänskliga T-celler med hjälp av immobiliserad metallaffinitetskromatografi och tandemmasspektrometri". Analytisk kemi . 76 (10): 2763–72. doi : 10.1021/ac035352d . PMID 15144186 .
