CHKB (gen)

CHKB
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CHETK, CHKL, CK, CKB, CKEKB, EK, EKB, MDCMC, kolinkinas beta
Externa ID :n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Kolinkinas beta (CK) , även känd som etanolaminkinas (EK) , kolinkinasliknande protein , kolin/etanolaminkinas beta (CKEKB) eller Kolin/etanolaminkinas är ett protein som kodas av CHKB - genen . Denna gen finns på kromosom 22 hos människor. kodade proteinet spelar en nyckelroll i fosfolipidbiosyntesen . Kolinkinas (CK) och etanolaminkinas (EK) katalyserar det första steget i fosfatidyletanolaminbiosyntesen . Genomläsningstranskript uttrycks från detta lokus som inkluderar exoner från nedströms CPT1B -lokuset.

Strukturera

CHKB - genen är lokaliserad på q-armen av kromosom 22 i position 13,3 och den spänner över 4 041 baspar. CHKB - genen producerar ett 7 kDa-protein som består av 60 aminosyror . Strukturen av proteinet har visat sig vara en homodimer och bildar en heterodimer med CHKA -proteinet. Det har också visat sig innehålla flera högkonserverade domäner , såsom en Brenner-fosfotransferaskonsensussekvens som är väsentlig för katalytisk funktion .

Fungera

CHKB - genen kodar för ett nyckelprotein i fosfolipidbiosyntesen . Kolinkinas- (CK)- och etanolaminkinas- (EK)-proteinerna, som kodas av CHKB- genen, katalyserar fosforyleringen av kolin/etanolamin in vitro till fosfokolin / fosfoetanolamin . Katalysen kontrolleras av ATP i närvaro av magnesium och ADP , och binder kolin till den enzymatiska vägen för biosyntes av fosfatidylkolin . Detta är det första steget i biosyntesen av fosfokolin / fosfoetanolamin i alla djurceller, och görs av Kennedy-vägen. De höggradigt renade kolinkinaserna från däggdjurskällor och deras rekombinanta genprodukter har också visat sig ha etanolaminkinasaktivitet , vilket indikerar att båda aktiviteterna ligger på samma protein. Det har emellertid visats att proteinet har högre aktivitet med etanolamin och kanske inte signifikant bidrar till fosfatidylkolinbiosyntes in vivo . Det kolinkinasliknande proteinet som kodas av CHKB tillhör familjen kolin/etanolaminkinas ; dess exakta funktion är dock inte känd. Minst två transkriptvarianter som kodar för två olika isoformer har hittats för denna gen, och en av transkripten är bicistronisk.

Klinisk signifikans

Mutationer i CHKB har visat sig resultera i mitokondriella brister och associerade störningar. Nedbrytning av genen har varit känd för att resultera i minskad kolinkinas- och fosfatidylkolinaktivitet . Denna försämring av aktiviteten kan leda till en modifierad sammansättning av fosfolipidsammansättningen i mitokondriernas membran vilket resulterar i allvarliga störningar i mitokondriernas funktion och struktur . Större störningar inkluderar som megakoniell medfödd muskeldystrofi (MDCMC) och narkolepsi .

Megakonial medfödd muskeldystrofi (MDCMC)

CHKB- mutationer har huvudsakligen associerats med Megakonial Kongenital Muskeldystrofi (MDCMC). Megakonial medfödd muskeldystrofi (MDCMC) är en autosomal recessiv medfödd muskeldystrofi som kännetecknas av muskelbiopsiresultat som visar förstorade mitokondrier som är vanliga i fibrernas periferi men knappa runt mitten.

Vanliga kliniska manifestationer av MDCMC inkluderar:

• tidig hypotoni
• muskelförtvining
• lätt förhöjda serumkreatinkinasnivåer (CK) .
• grav intellektuell funktionsnedsättning utan strukturella avvikelser i hjärnan
• Gowers tecken
• utvecklingsstörd
• dödlig kardiomyopati

Symtom som neurogen atrofi , förstorade mitokondrier i fibrernas periferi och komplex I -brist visades hos en spansk patient med en homozygot mutation av c.810T>A. En annan patient med en homozygot mutation (p.E292X) i CHKB -genen uppvisade rytmiska armryckningar, vilka karakteriserades som muskelspasmer . Slutligen visade en patient med en homozygot c.810T>A tecken på Gowers tecken , hypotoni och proximal muskelsvaghet .

Narkolepsi

Narkolepsi är en neurologisk invalidiserande sömnstörning som kännetecknas av överdriven sömnighet under dagen , sömnfragmentering, symtom på onormal sömn för snabba ögonrörelser (REM), kataplexi , hypnagogiska hallucinationer och sömnförlamning . Kataplexi är en plötslig förlust av muskeltonus som utlöses av känslor, vilket är den mest värdefulla kliniska egenskapen som används för att diagnostisera narkolepsi. Mänsklig narkolepsi är i första hand en sporadiskt förekommande störning men familjär klustring har observerats.

Interaktioner

CHKB har visat sig ha protein-protein-interaktioner med följande.

• ALBA
• Humant serumalbumin

externa länkar

• Human CHKB- genomplacering och CHKB- geninformationssida i UCSC Genome Browser .
• Mänskligt CKB- genomplacering och CKB- geninformationssida i UCSC Genome Browser .

Vidare läsning

•   Aoyama C, Liao H, Ishidate K (2004). "Struktur och funktion av kolinkinasisoformer i däggdjursceller". Prog. Lipid Res . 43 (3): 266–81. doi : 10.1016/j.plipres.2003.12.001 . PMID 15003397 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•    Collins JE, Wright CL, Edwards CA, et al. (2005). "En genomannoteringsdriven metod för att klona det mänskliga ORFeome" . Genome Biol . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
•   Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•   Hirosawa M, Nagase T, Murahashi Y, et al. (2001). "Identifiering av nya transkriberade sekvenser på human kromosom 22 genom mappning av uttryckt sekvenstagg" . DNA Res . 8 (1): 1–9. doi : 10.1093/dnares/8.1.1 . PMID 11258795 .
•   Yamazaki N, Shinohara Y, Kajimoto K, et al. (2000). "Nytt uttryck för tvetydiga meddelanden som innehåller båda regionerna av kolin/etanolaminkinas och muskeltyp karnitinpalitoyltransferas I" . J. Biol. Chem . 275 (41): 31739–46. doi : 10.1074/jbc.M006322200 . PMID 10918069 .
•   Loftus BJ, Kim UJ, Sneddon VP, et al. (1999). "Genomdupliceringar och andra egenskaper i 12 Mb DNA-sekvens från human kromosom 16p och 16q". Genomik . 60 (3): 295–308. doi : 10.1006/geno.1999.5927 . PMID 10493829 .
•   Aoyama C, Nakashima K, Matsui M, Ishidate K (1998). "Komplementär DNA-sekvens för ett 42 kDa råttnjurekolin/etanolaminkinas". Biochim. Biophys. Acta . 1390 (1): 1–7. doi : 10.1016/s0005-2760(97)00177-x . PMID 9487136 .
•   Yamazaki N, Yamanaka Y, Hashimoto Y, et al. (1997). "Strukturella egenskaper hos genen som kodar för karnitinpalmitoyltransferas I av human muskeltyp" . FEBS Lett . 409 (3): 401–6. doi : 10.1016/S0014-5793(97)00561-9 . PMID 9224698 .

Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .