CDK5RAP2
| CDK5RAP2- | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , C48, Cep215, MCPH3, CDK5 regulatorisk underenhetsassocierat protein 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Externa ID:n | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CDK5 regulatorisk subenhetsassocierat protein 2 är ett protein som hos människor kodas av CDK5RAP2 -genen . Det har nödvändiga roller i bildandet och stabiliteten av mikrotubuli från centrosomen och har visat sig vara kopplat till mänskliga hjärnstorleksvariationer hos män. Flera transkriptvarianter finns för denna gen, men fullängdsnaturen för endast två har bestämts.
CDK5RAP2 är homolog med Drosophila -proteinet centrosomin (cnn) och paralog med myomegalin , som hos däggdjur innehåller en Olduvai-domän , en domän som är inblandad i mänsklig hjärnstorleksutveckling.
Fungera
CDK5RAP2 är nödvändigt för korrekt bildning , förankring och orientering av mikrotubuli från centrosomen . Det binder till γ-tubulinringkomplexet ( γTuRC), och detta krävs för att γTuRC ska fästa vid centrosomen . CDK5RAP2 binder också till p25, en form av CDK5R1 som fungerar som den aktiverande subenheten av CDK5 , som är involverad i regleringen av neuronal differentiering . CDK5RAP2 har därför en roll i neuronal differentiering. CDK5RAP2 är också nödvändigt som ett ställningsprotein i den centrosomala koronan hos Dictyostelium .
Klinisk signifikans
Variation i mänsklig hjärnstorlek
En MRT- studie har visat ett samband mellan vanlig mänsklig variation i CDK5RAP2-genen och hjärnans struktur. Mer specifikt hittades samband mellan flera enkelnukleotidpolymorfismer (SNP) och hjärnbarkytan och total hjärnvolym. Dessa associationer hittades uteslutande hos manliga försökspersoner, och alla SNP: er var lokaliserade antingen i de sista 7 intronerna eller nedströms genen. Den funktionella betydelsen av dessa loci är ännu inte känd. Men med tanke på deras placering nära regulatoriska element är det möjligt att de är involverade i genreglering , vilket tyder på att vanlig varians i hjärnans struktur kan vara associerad med skillnader i genreglering snarare än proteinstruktur, i överensstämmelse med fynd i andra komplexa mänskliga egenskaper . CDK5RAP2 är en paralog av myomegalin , som hos däggdjur innehåller en Olduvai-domän , en domän med människospecifika duplikationer som har varit inblandade i utvecklingen av mänsklig hjärnstorlek.
Autosomal recessiv primär mikrocefali
Mutationer i CDK5RAP2 orsakar autosomal recessiv primär mikrocefali typ 3.
Interaktioner
CDK5RAP2 har visats interagera med CDK5R1 och pericentrin (PCTN).
Historia
Genen upptäcktes 2000 och karakteriserades första gången 2007.
Vidare läsning
- Moynihan L, Jackson AP, Roberts E, Karbani G, Lewis I, Corry P, et al. (februari 2000). "Ett tredje nytt lokus för primär autosomal recessiv mikrocefali mappar till kromosom 9q34" . American Journal of Human Genetics . 66 (2): 724–7. doi : 10.1086/302777 . PMC 1288125 . PMID 10677332 .
- Wang X, Ching YP, Lam WH, Qi Z, Zhang M, Wang JH (oktober 2000). "Identifiering av en gemensam proteinassociationsregion i den neuronala Cdk5-aktivatorn" . Journal of Biological Chemistry . 275 (41): 31763–9. doi : 10.1074/jbc.M004358200 . PMID 10915792 .
- Nagase T, Kikuno R, Nakayama M, Hirosawa M, Ohara O (augusti 2000). "Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade mänskliga gener. XVIII. De fullständiga sekvenserna av 100 nya cDNA-kloner från hjärnan som kodar för stora proteiner in vitro" . DNA-forskning . 7 (4): 273–81. doi : 10.1093/dnares/7.4.271 . PMID 10997877 .
- Ching YP, Pang AS, Lam WH, Qi RZ, Wang JH (maj 2002). "Identifiering av ett neuronalt Cdk5-aktivatorbindande protein som Cdk5-hämmare" . Journal of Biological Chemistry . 277 (18): 15237–40. doi : 10.1074/jbc.C200032200 . PMID 11882646 .
- Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (november 2002). "Protein-proteininteraktioner mellan stora proteiner: tvåhybridscreening med ett funktionellt klassificerat bibliotek bestående av långa cDNA. " Genomforskning . 12 (11): 1773–84. doi : 10.1101/gr.406902 . PMC 187542 . PMID 12421765 .
- Andersen JS, Wilkinson CJ, Mayor T, Mortensen P, Nigg EA, Mann M (december 2003). "Proteomisk karakterisering av den mänskliga centrosomen genom proteinkorrelationsprofilering". Naturen . 426 (6966): 570–4. Bibcode : 2003Natur.426..570A . doi : 10.1038/nature02166 . PMID 14654843 . S2CID 4427303 .
- Bond J, Roberts E, Springell K, Lizarraga SB, Lizarraga S, Scott S, et al. (april 2005). "En centrosomal mekanism som involverar CDK5RAP2 och CENPJ styr hjärnans storlek". Naturgenetik . 37 (4): 353–5. doi : 10.1038/ng1539 . PMID 15793586 . S2CID 1763877 .
- Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (april 2006). "Fosfoproteomanalys av den mänskliga mitotiska spindeln" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 103 (14): 5391–6. Bibcode : 2006PNAS..103.5391N . doi : 10.1073/pnas.0507066103 . PMC 1459365 . PMID 16565220 .
- Evans PD, Vallender EJ, Lahn BT (juni 2006). "Molekylär utveckling av hjärnstorleksregulatorgenerna CDK5RAP2 och CENPJ". Gene . 375 : 75–9. doi : 10.1016/j.gene.2006.02.019 . PMID 16631324 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (november 2006). "Global, in vivo och platsspecifik fosforyleringsdynamik i signalnätverk" . Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
externa länkar
- Humant CDK5RAP2- genomplacering och CDK5RAP2- geninformationssida i UCSC Genome Browser .