Bromidperoxidas
Bromidperoxidase | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifierare | |||||||||
EG nr. | 1.11.1.18 | ||||||||
Databaser | |||||||||
IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
KEGG | KEGG inträde | ||||||||
MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
PRIAM | profil | ||||||||
PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
|
Bromidperoxidas ( EC 1.11.1.18 , bromperoxidas , haloperoxidas (tvetydigt) , eosinofil peroxidas ) är en familj av enzymer med det systematiska namnet bromid:väteperoxidoxidoreduktas . Dessa enzymer katalyserar följande kemiska reaktion :
- HBr + H 2 O 2 HOBr + H 2 O
HOBr är ett potent bromeringsmedel. De många organobrominföreningar som observeras i marina miljöer är produkter av reaktion med denna oxiderade form av brom.
Bromperoxidaser av röda och bruna marina alger ( Rhodophyta och Phaeophyta ) innehåller vanadat ( vanadinbromperoxidas ) . Annars är vanadin en ovanlig kofaktor inom biologin. Tack vare denna familj av enzymer har en mängd bromerade naturprodukter isolerats från marina källor.
Besläktade klorperoxidasenzymer påverkar klorering. I nomenklaturen för haloperoxidas är bromperoxidaser klassiskt oförmögna att oxidera klorid alls. Till exempel eosinofilperoxidas föredra bromid framför klorid, men anses inte vara ett bromperoxidas eftersom det kan använda klorid.
Muricidae (var Murex ) spp. sniglar har ett bromperoxidas som används för att producera Tyrian-lila färgämne. Enzymet är mycket specifikt för bromid och fysikaliskt stabilt, men har inte karakteriserats med avseende på dess aktiva metall. Från och med 2019 har ingen specifik gen tilldelats ett sådant enzym i snigelgenomet. En sådan aktivitet tillhandahålls troligen av symbiotiska Bacillus- bakterier istället. Det identifierade enzymet tillhör superfamiljen alfa/beta-hydrolas ; en struktur för ett liknande bromperoxidas finns tillgänglig som . Den körs på en katalytisk triad av Ser 99, Asp 229 och His 258 och kräver inga metallkofaktorer.
Ytterligare läsning
- De Boer, E.; Tromp, MGM; Plat, H.; Krenn, GE; Wever, R (1986). "Vanadium(v) som ett väsentligt element för haloperoxidasaktivitet i marina brunalger - rening och karakterisering av ett vanadin(V)-innehållande bromperoxidas från Laminaria saccharina ". Biochim. Biophys. Acta . 872 (1–2): 104–115. doi : 10.1016/0167-4838(86)90153-6 .
- Tromp MG, Olafsson G, Krenn BE, Wever R (september 1990). "Några strukturella aspekter av vanadinbromperoxidas från Ascophyllum nodosum". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteinstruktur och molekylär enzymologi . 1040 (2): 192–8. doi : 10.1016/0167-4838(90)90075-q . PMID 2400770 .
- Isupov MN, Dalby AR, Brindley AA, Izumi Y, Tanabe T, Murshudov GN, Littlechild JA (juni 2000). "Kristallstruktur av dodecameriskt vanadinberoende bromoperoxidas från den röda algen Corallina officinalis". Journal of Molecular Biology . 299 (4): 1035–49. doi : 10.1006/jmbi.2000.3806 . PMID 10843856 .
- Carter-Franklin JN, Butler A (november 2004). "Vanadium bromoperoxidas-katalyserad biosyntes av halogenerade marina naturprodukter". Journal of the American Chemical Society . 126 (46): 15060–6. doi : 10.1021/ja047925p . PMID 15548002 .
- Ohshiro T, Littlechild J, Garcia-Rodriguez E, Isupov MN, Iida Y, Kobayashi T, Izumi Y (juni 2004). "Modifiering av halogenspecificitet för ett vanadinberoende bromperoxidas" . Proteinvetenskap . 13 (6): 1566–71. doi : 10.1110/ps.03496004 . PMC 2279980 . PMID 15133166 .
externa länkar
- Bromid+peroxidas vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)