PRDX5

PRDX5
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, ACR1, AOEB166, B166, HEL-S-55, PLP, PMP20, PRDX6, PRXV, prx-V, SBBI10, peroxiredoxin 5
externa ID :n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS n/a
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Peroxiredoxin-5 (PRDX5), mitokondrie är ett protein som hos människor kodas av PRDX5 -genen , som ligger på kromosom 11.

Denna gen kodar för en medlem av den sex-lediga peroxiredoxinfamiljen av antioxidantenzymer . Liksom de andra fem medlemmarna uttrycks PRDX5 brett i vävnader men skiljer sig genom sin stora subcellulära distribution. I mänskliga celler har det visats att PRDX5 kan lokaliseras till mitokondrier , peroxisomer , cytosolen och kärnan . Human PRDX5 identifieras i kraft av sekvenshomologierna med jäst peroxisomalt antioxidantenzym PMP20.

Biokemiskt är PRDX5 ett peroxidas som kan använda cytosoliska eller mitokondriella tioredoxiner för att reducera alkylhydroperoxider eller peroxinitrit med höga hastighetskonstanter i intervallet 10 ⁶ till 10 ⁷ M ⁻¹ s ⁻¹ , medan dess reaktion med väteperoxid är mer blygsam, i 10 ⁵ M ⁻¹ s ⁻¹ räckvidd. Hittills har PRDX5 visat sig vara ett cytoskyddande antioxidantenzym som hämmar endogen eller exogen peroxidackumulering .

Strukturera

Enligt dess aminosyrasekvens är detta 2-Cys-peroxiredoxin, PRDX5, den mest divergerande isoformen bland däggdjursperoxiredoxiner, och bearbetar endast 28 % till 30 % sekvensidentitet med typiska 2-Cys- och 1-Cys-peroxiredoxiner. Den divergerande aminosyrasekvensen för detta atypiska peroxiredoxin återspeglas i dess unika kristallstruktur. Det typiska peroxiredoxinet är sammansatt av en tioredoxindomän och en C-terminal, medan PRDX5 har en N-terminal domän och en unik alfahelix ersätter en loopstruktur i den typiska tioredoxindomänen. Dessutom är typiska 2-Cys- eller 1-Cys-peroxiredoxiner associerade som antiparallella dimerer via länkning av två beta-7-strängar, medan en PRDX5-dimer bildas genom nära kontakt mellan en alfa-3-helix av en molekyl och en alfa-5-helix från den andra molekylen.

Fungera

Som ett peroxiredoxin har PRDX5 antioxidativa och cytoprotektiva funktioner under oxidativ stress. Överuttryck av human PRDX5 har visat sig hämma peroxidackumulering inducerad av TNF-alfa , PDGF och p53 i NIH3T3- och HeLa -celler och minska celldöd genom exogen peroxid i multipla organeller av CHO , HT-22 och humana senceller. Samtidigt inducerar minskat uttryck av PRDX5 cellkänslighet för oxidativ skada och etoposid , doxorubicin , MPP ⁺ och peroxidinducerad apoptos . Att uttrycka mänsklig PRDX5 i andra organismer eller vävnader som jäst, mushjärna och Xenopus-embryon leder dessutom till skydd mot oxidativ stress. PRDX5 i Drosophila melanogaster har visat sig främja livslängd förutom antioxidantaktivitet.

Klinisk signifikans

Genom att undersöka 98 strokepatienter har Kunze et al. visade en omvänd korrelation mellan strokeprogression och PRDX5-koncentration, vilket tyder på att plasma PRDX5 kan vara en potentiell biomarkör för inflammation vid akut stroke. I mänskliga bröstcancerceller ledde nedbrytningen av transkriptionsfaktorn, GATA1 , till ökat uttryck av PRDX5 och hämning av apoptos. En betydande ökning av PRDX5-uttryck har observerats i astrocyter vid multipel skleros lesion . PRDX5 har också identifierats som en kandidatriskgen för den inflammatoriska sjukdomen sarkoidos .

Interaktioner

Transkriptionsfaktor GATA-bindande protein 1 kan binda till PRDX5-genen och leda till ökat uttryck av PRDX5. PRDX5 har visat sig interagera fysiskt med PRDX1, PRDX2, PRDX6, SOD1 och PARK7 i minst två oberoende proteomanalyser med hög genomströmning.

Vidare läsning

•   Wood ZA, Schröder E, Robin Harris J, Poole LB (januari 2003). "Struktur, mekanism och reglering av peroxiredoxiner". Trender inom biokemiska vetenskaper . 28 (1): 32–40. doi : 10.1016/S0968-0004(02)00003-8 . PMID 12517450 .
•    Hochstrasser DF, Frutiger S, Paquet N, Bairoch A, Ravier F, Pasquali C, Sanchez JC, Tissot JD, Bjellqvist B, Vargas R (december 1992). "Mänsklig leverproteinkarta: en referensdatabas upprättad genom mikrosekvensering och geljämförelse". Elektrofores . 13 (12): 992–1001. doi : 10.1002/elps.11501301201 . PMID 1286669 . S2CID 23518983 .
•   Kropotov A, Sedova V, Ivanov V, Sazeeva N, Tomilin A, Krutilina R, Oei SL, Griesenbeck J, Buchlow G, Tomilin N (mars 1999). "Ett nytt humant DNA-bindande protein med sekvenslikhet med en underfamilj av redoxproteiner som kan undertrycka RNA-polymeras-III-driven transkription av Alu-familjens retroposoner in vitro" . European Journal of Biochemistry . 260 (2): 336–46. doi : 10.1046/j.1432-1327.1999.00162.x . PMID 10095767 .
•    Wattiez R, Hermans C, Bernard A, Lesur O, Falmagne P (juni 1999). "Human bronkoalveolär sköljvätska: tvådimensionell gelelektrofores, aminosyramikrosekvensering och identifiering av stora proteiner". Elektrofores . 20 (7): 1634–45. doi : 10.1002/(SICI)1522-2683(19990601)20:7<1634::AID-ELPS1634>3.0.CO;2-J . PMID 10424490 . S2CID 485171 .
•   Zhou Y, Kok KH, Chun AC, Wong CM, Wu HW, Lin MC, Fung PC, Kung H, Jin DY (februari 2000). "Peroxiredoxin V från mus är ett tioredoxinperoxidas som hämmar p53-inducerad apoptos". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 268 (3): 921–7. doi : 10.1006/bbrc.2000.2231 . PMID 10679306 .
•   Seo MS, Kang SW, Kim K, Baines IC, Lee TH, Rhee SG (juli 2000). "Identifiering av en ny typ av däggdjursperoxiredoxin som bildar en intramolekylär disulfid som en reaktionsintermediär" . Journal of Biological Chemistry . 275 (27): 20346–54. doi : 10.1074/jbc.M001943200 . PMID 10751410 .
•     Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R , Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (augusti 2000). "Genuttrycksprofilering i den mänskliga hypotalamus-hypofys-binjureaxeln och cDNA-kloning i full längd" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (17): 9543–8. Bibcode : 2000PNAS...97.9543H . doi : 10.1073/pnas.160270997 . JSTOR 123500 . PMC 16901 . PMID 10931946 .
•    Declercq JP, Evrard C, Clippe A, Stricht DV, Bernard A, Knoops B (augusti 2001). "Kristallstruktur av humant peroxiredoxin 5, en ny typ av däggdjursperoxiredoxin vid 1,5 A upplösning" . Journal of Molecular Biology . 311 (4): 751–759. CiteSeerX 10.1.1.897.4685 . doi : 10.1006/jmbi.2001.4853 . PMID 11518528 .
•   Rouhier N, Gelhaye E, Jacquot JP (april 2002). "Glutaredoxinberoende peroxiredoxin från poppel: protein-proteininteraktion och katalytisk mekanism" . Journal of Biological Chemistry . 277 (16): 13609–14. doi : 10.1074/jbc.M111489200 . PMID 11832487 .
•    Wang MX, Wei A, Yuan J, Trickett A, Knoops B, Murrell GA (november 2002). "Uttryck och reglering av peroxiredoxin 5 i human artros" . FEBS Bokstäver . 531 (2): 359–62. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03511-1 . PMID 12417342 . S2CID 35182875 .
•   Leyens G, Donnay I, Knoops B (december 2003). "Kloning av bovina peroxiredoxiner-genuttryck i bovina vävnader och aminosyrasekvensjämförelse med rått-, mus- och primatperoxiredoxiner". Jämförande biokemi och fysiologi. Del B, Biokemi & molekylärbiologi . 136 (4): 943–55. doi : 10.1016/S1096-4959(03)00290-2 . PMID 14662316 .
•   Banmeyer I, Marchand C, Verhaeghe C, Vucic B, Rees JF, Knoops B (januari 2004). "Överuttryck av humant peroxiredoxin 5 i subcellulära fack i äggstocksceller från kinesisk hamster: effekter på cytotoxicitet och DNA-skador orsakade av peroxider". Fri radikal biologi och medicin . 36 (1): 65–77. doi : 10.1016/j.freeradbiomed.2003.10.019 . PMID 14732291 .
•   Salmon M, Dedessus Le Moutier J, Wenders F, Chiarizia S, Eliaers F, Remacle J, Royer V, Pascal T, Toussaint O (januari 2004). "Roll av den PLA2-oberoende peroxiredoxin VI-aktiviteten i överlevnaden av odödliga fibroblaster exponerade för cytotoxisk oxidativ stress" . FEBS Bokstäver . 557 (1–3): 26–32. doi : 10.1016/S0014-5793(03)01437-6 . PMID 14741336 .
•   Evrard C, Capron A, Marchand C, Clippe A, Wattiez R, Soumillion P, Knoops B, Declercq JP (april 2004). "Kristallstruktur av en dimer oxiderad form av humant peroxiredoxin 5" . Journal of Molecular Biology . 337 (5): 1079–90. doi : 10.1016/j.jmb.2004.02.017 . hdl : 2268/64083 . PMID 15046979 .
•   Yuan J, Murrell GA, Trickett A, Landtmeters M, Knoops B, Wang MX (juli 2004). "Överuttryck av antioxidantenzym peroxiredoxin 5 skyddar mänskliga senceller mot apoptos och förlust av cellulär funktion under oxidativ stress" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research . 1693 (1): 37–45. doi : 10.1016/j.bbamcr.2004.04.006 . PMID 15276323 .
•    Dubuisson M, Vander Stricht D, Clippe A, Etienne F, Nauser T, Kissner R, Koppenol WH, Rees JF, Knoops B (juli 2004). "Humant peroxiredoxin 5 är ett peroxinitritreduktas" . FEBS Bokstäver . 571 (1–3): 161–5. doi : 10.1016/j.febslet.2004.06.080 . PMID 15280035 . S2CID 29085993 .