Biliverdin reduktas B
| BLVRB | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identifierare | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , BVRB, FLR, HEL-S-10, SDR43U1, Biliverdinreduktas B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Externa ID: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| n EG-nummer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biliverdinreduktas B är ett protein som hos människor kodas av BLVRB- genen .
Strukturera
BLVRB-genen var lokaliserad till kromosom 19, den specifika regionen var 19q13.13 till q13.2; detta gjordes med användning av fluorescens in situ hybridisering.
BLVRB kodar för ett protein som är ett monomert enzym med 206 rester. Strukturen för BVR-B har en endomänarkitektur som består av ett centralt parallellt betaark med alfa-helixer på vardera sidan. Denna karakteristiska dinukleotidbindande veck innefattar, i detta fall, ett sju-strängat parallellt beta-ark ytterligare förlängt med en antiparallell sträng. Förutom de sju långa strängarna i det veckade huvudarket, bildas ett kort parallellt beta-ark (strängarna 6a och 6c) i öglan som förbinder sträng 6 och alfa-helix F. Det centrala beta-arket och de två grupperna av spiraler hålls samman huvudsakligen genom hydrofoba interaktioner. En grupp av helixar består av alfa-helixarna C, D och E. Den andra gruppen består av alfa-helixarna A och F och inkluderar en kort 310-helix mellan strängarna beta2 och beta3, i motsats till typiska dinukleotidbindande proteiner där en vanlig alfa-helix flankerar dessa beta-strängar. Den mest flexibla slingan i strukturen motsvarar slingan 120, mellan sträng 5 och alfa-helix E, som innehåller rester med de högsta B-faktorerna i huvudkedjan, med undantag för den N-terminala regionen.
Fungera
Det sista steget i hemmetabolism hos däggdjur katalyseras av de cytosoliska biliverdinreduktasenzymerna A och B (EC 1.3.1.24). Ur funktionell synvinkel har det antagits att BLRVB är identisk med flavinreduktas (FR), ett enzym som katalyserar den NADPH-beroende reduktionen av FMN och metylenblått och, i närvaro av redoxkopplare, reduktionen av methemoglobin.
Det har funnits två isoformer av BLVRB, I och II, som har isolerats och karakteriserats. De renade enzymerna var monomerer med en molekylvikt på cirka 21 000, och de använde NADPH och NADH som elektrondonatorer för reduktion av biliverdin. De identifierade Km-värdena för isozym I och II för NADPH är 35,9 respektive 13,1 μM , medan de för NADH är 5,6 och 8,2, vilket indikerar att NADPH snarare än NADH fungerar som den fysiologiska elektrondonatorn i reaktionen. De NADPH-beroende enzymaktiviteterna hämmas av substratkoncentrationer över 3-4 μM. Det optimala pH-värdet för reaktionen med NADPH för isozym I och II är 8,2. Flavinreduktas/biliverdin-IXbeta-reduktas har också visat sig uppvisa ferri-reduktasaktivitet, med en skenbar K(m) på 2,5 μM för ferrijärnet. Ferri-reduktasreaktionen kräver NAD(P)H och FMN. Denna aktivitet är spännande, eftersom hemklyvning hos fostret producerar icke-alfa-isomerer av biliverdin och ferrijärn, som båda är substrat för flavinreduktas/biliverdin-IXbeta-reduktas.
Klinisk signifikans
Eftersom BLVRB är ett promiskuöst enzym som katalyserar den pyridinnukleotidberoende reduktionen av en mängd olika flaviner, biliverdiner, PQQ (pyrrolokinolinkinon) och ferrijoner. Mekanistiskt är det en bra modell för BVR-A (biliverdin-IXalfa-reduktas), ett potentiellt farmakologiskt mål för neonatal gulsot, och även ett potentiellt mål för tilläggsbehandling för att upprätthålla skyddande nivåer av biliverdin-IXalfa under organtransplantation.
Interaktioner
BLVRB binder till humant hemoxygenas-1 (hHO-1) i kombination med cytokrom p450-reduktas för att katalysera den NADPH-cytokrom P450-reduktasberoende oxidationen av hem till biliverdin, CO och fritt järn.
externa länkar
- Human BLVRB- genomplacering och BLVRB- geninformationssida i UCSC Genome Browser .
- Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : P30043 (Flavinreduktas (NADPH)) i PDBe-KB .
Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .