Xi River virus

Xi River virus
Virusklassificering
(orankad):	Virus
Rike :	Riboviria
Rike:	Orthornavirae
Provins:	Duplornaviricota
Klass:	Resentoviricetes
Beställa:	Reovirales
Familj:	Reoviridae
Släkte:	Ortoreovirus
Arter:	incertae sedis
Virus:	Xi River virus

Xi River virus ( XRV ) är ett förmodat nytt fladdermusvirus i släktet Orthoreovirus isolerat från fruktfladdermöss i Guangdong-provinsen i södra Kina . Det är det första fladdermus -reoviruset som isolerats i Kina.

Virologi

Genom

Endast en partiell sekvens av XRV isolerades från fruktfladdermusen, men baserat på dess öppna läsram identifierades den som ett reovirus. XRV har samma morfologi och höga sekvensidentitet som Nelson Bay-virus (NBV), och ett 10-segmenterat dubbelsträngat RNA-genom, såväl som hög sekvensidentitet till NBV-medlemmar.

Reovirus är icke-hölje, dubbelsträngade RNA-virus. De har en ikosaedrisk kapsid (T-13) som består av ett yttre och ett inre proteinskal. Genomet innehåller 10–12 segment grupperade i tre kategorier efter storlek: L (stor), M (medium) och S (liten). Segment varierar från ~ 3,9 kbp – 1 kbp och varje segment kodar för 1–3 proteiner. Reoviridae-proteiner betecknas med den grekiska karaktären som motsvarar segmentet det översattes från (L-segmentet kodar för λ-proteiner, M-segmentet kodar för μ-proteiner och S-segmentet kodar för σ-proteiner).

Se även

externa länkar

"Översättning och öppna läsramar" .
NCBI ORF finder – Ett webbaserat interaktivt verktyg för att förutsäga och analysera ORF från nukleotidsekvenser.