Vulcanisaeta

Vulcanisaeta
Vetenskaplig klassificering
Domän:	Archaea
Provins:	Termoproteota
Klass:	Termoprotein
Beställa:	Thermoproteales
Familj:	Thermoproteaceae
Släkte:	Vulcanisaeta Itoh, Suzuki & Nakase 2002
Typ art
Vulcanisaeta distributa Itoh, Suzuki & Nakase 2002
Arter
V. distributa " V. Moutnovskia " V. souniana V. thermophila

Inom taxonomi är Vulcanisaeta ett släkte av Thermoproteaceae .

Beskrivning och betydelse

Vulcanisaeta är en anaerob, heterotrof, hypertermofil arkeon som växer optimalt vid 85–90 °C och vid pH 4,0–4,5. Organismen är isolerad från prover som samlats in direkt från solfatariska fält eller rörledningar för varmt källvatten i östra Japan.

Genomets struktur

Flera Vulcanisaeta -genom har sekvenserats, se Lista över sekvenserade arkeala genom . G + C-innehållet i dess DNA, som är mellan 44 och 46 %, förutspås vara relativt lägre än andra medlemmar av Thermoproteaceae -släktet.

Cellstruktur och metabolism

Cellerna i Vulcanisaeta är raka till lätt böjda stavar, som varierar från 0,4 till 0,6 µm i bredd. I vissa fall är cellerna grenade eller bär sfäriska kroppar vid terminalerna. Arkeonen använder maltos, stärkelse, malat, jästextrakt, pepton, nötköttsextrakt, kasaminosyror och gelatin som kolkällor, kan inte använda D- arabinos , D- fruktos , laktos , sackaros , D- xylos , acetat , butyrat , fumarat , format . , propionat , pyruvat , succinat , metanol , formamid , metylamin eller trimetylamin . Som elektronacceptorer använder organismen svavel och tiosulfat. Till skillnad från några andra genetiskt liknande archaea som Thermocladium eller Caldivirga , växer Vulcanisaeta i frånvaro av vitaminblandning eller arkaeal cellextraktlösning i mediet.

Ekologi

Stammar av Vulcanisaeta hittades i varma källor i Japan. Trots att organismerna är den vanligaste stavformade crenarchaeoten bland isolat från varma källor i Japan, har den inte isolerats från andra länder. Detta står i kontrast till släktena Thermoproteus och Pyrobaculum , som är spridda över hela världen, inklusive Azorerna , Island , Indonesien , Italien, Japan, Filippinerna , Ryssland och USA. Därför är det möjligt att släktet Vulcanisaeta har en begränsad utbredning som inkluderar Japan.

Fylogeni

16S rRNA-baserad LTP_12_2021 av The All-Species Living Tree Project .	GTDB 07-RS207 av Genome Taxonomy Database .
Vulcanisaeta V. thermophila V. souniana V. distributa	Vulcanisaeta V. thermophila Yim et al. 2015 V. distributa Itoh, Suzuki & Nakase 2002 " V. moutnovskia " Gumerov et al. 2011 V. souniana Itoh, Suzuki & Nakase 2002

Vidare läsning

Vetenskapliga tidskrifter

•   Jay ZJ; JP. Stråle; MA. Kozubal; Rdem Jennings; DB. Rusch & Inskeep WP (december 2016). "Fördelningen, mångfalden och funktionen av dominerande Thermoproteales i högtemperaturmiljöer i Yellowstone National Park" . Miljömikrobiologi . 18 (12): 4755–4769. doi : 10.1111/1462-2920.13366 . PMID 27130276 .
•    Jay ZJ, Inskeep WP (juli 2015). "Fördelningen, mångfalden och betydelsen av 16S rRNA-genintroner i ordningen Thermoproteales" . Biologi direkt . 10 (35): 35. doi : 10.1186/s13062-015-0065-6 . PMC 4496867 . PMID 26156036 .
•    Mavromatis, Konstantinos (2010). "Fullständig genomsekvens av stam av Vulcanisaeta distributa-typ (IC-017(T))" . Standards in Genomic Sciences . 3 (2): 117–125. doi : 10.4056/sigs.1113067 . PMC 3035369 . PMID 21304741 .
•   Itoh T; Suzuki K; Nakase T (2002). "Vulcanisaeta distributa gen. nov., sp. nov., och Vulcanisaeta souniana sp. nov., hypertermofila, stavformade crenarchaeotes isolerade från varma källor i Japan". Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 52 (Pt 4): 1097–1104. doi : 10.1099/ijs.0.02152-0 . PMID 12148613 .
•   Burggraf S; Huber H; Stetter KO (1997). "Omklassificering av crenarchael-order och familjer i enlighet med 16S rRNA-sekvensdata" . Int. J. Syst. Bakteriol . 47 (3): 657–660. doi : 10.1099/00207713-47-3-657 . PMID 9226896 .
• Zillig W; Stetter KO; Schafer W; Janekovic D; Wunderl S; Holz I; Palm P (1981). "Thermoproteales: en ny typ av extremt termoacidofila anaeroba arkaebakterier isolerade från isländska solfataras". Zentralbl. Mikrobiol. Parasitenkd. Infektionskr. Hyg. Abt. 1 Orig . C2 : 205-227.