I eukaryoter måste intronerna i det transkriberade pre-mRNA först avlägsnas med spliceosom för att bilda ett moget mRNA. En spliceosom är sammansatt av små nukleära ribonukleoproteiner (snRNP) och små nukleära RNA (snRNA). Och splitsningsfaktorn kan delas in i snRNP- och icke-snRNP-proteiner. U2-hjälpfaktor (U2AF), som består av en stor och en liten subenhet, är ett icke-snRNP-protein som krävs för bindningen av U2 snRNP till pre-mRNA-grenplatsen . Denna gen kodar för den stora U2AF-subenheten, som innehåller en sekvensspecifik RNA-bindande region med 3 RNA-igenkänningsmotiv och en Arg/Ser-rik domän som är nödvändig för splitsning. Den stora subenheten binder till polypyrimidinkanalen hos introner tidigt under spliceosomsammansättningen . Flera alternativt splitsade transkriptvarianter har detekterats för denna gen, men fullängdsnaturerna för endast två har hittills bestämts.
Hos människor och andra tetrapoder har det visat sig att utan U2AF2 hämmas splitsningsprocessen. Men i zebrafisk och andra teleostar kan RNA -skarvningsprocessen fortfarande förekomma på vissa gener i frånvaro av U2AF2. Detta kan bero på att 10 % av generna har alternerande TG- och AC-baspar vid 3'-splitsningsstället (3's) respektive 5'-splitsningsstället (5's) på varje intron, vilket förändrar den sekundära strukturen av RNA och påverkar skarvningen.
Splitsningsfaktorn U2AF65 kan specifikt känna igen polypyrimidinkanalen (Py-kanalen), det beror på att U2AF65 består av 3 RNA-bindande domäner (RRMs), alla har en hög bindningsaffinitet till Py-kanalen på dess intilliggande 3'-splitsningsställe. RRM1 och RRM2 är tillräckliga för specifik RNA/proteinbindning, medan RRM3 är ansvarig för protein/proteininteraktioner. Till exempel bidrar C-Terminal RRM3 till att etablera protein-protein-kontakter med splitsningsfaktorer som UAP56, SAP155 och mBBP/SF1.
Lallena MJ, Martínez C, Valcárcel J, Correas I (juli 1998). "Funktionell association av nukleärt protein 4.1 med pre-mRNA splitsningsfaktorer". Journal of Cell Science . 111 (14): 1963–1971. doi : 10.1242/jcs.111.14.1963 . PMID 9645944 .
