SF1 (gen)

SF1
Tillgängliga strukturer PDB Human UniProt-sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, BBP, D11S636, MBBP, ZCCHC25, ZFM1, ZNF162, splitsningsfaktor 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa

Splicing factor 1 även känd som zinkfingerprotein 162 ( ZFM162 ) är ett protein som hos människor kodas av SF1 -genen .

Splitsningsfaktor SF1 är involverad i den ATP-beroende bildningen av splitsosomkomplexet . SF1-genen är nödvändig för att göra den bipotentiella gonaden; men medan SF1-nivåerna sjunker i könsryggen hos XX-musembryon, stannar SF1-genen på testiklarna under utveckling. SF 1 (transkriptionsfaktor) verkar vara aktiv i att maskulinera både Leydig-celler och Sertoli-celler. I Sertoli-celler med SOX9-proteinet höjer det nivån av AMH-transkription. I Leydig-celler aktiveras genen som kodar för enzymet som gör testosteronhormon.

Interaktioner

SF1 (gen) har visat sig interagera med Ewing sarkom brytpunkt region 1 , U2AF2 , Testis bestämmande faktor , och transkriptionsförlängning regulator 1 .

Vidare läsning

•    Krämer A (1992). "Rening av splitsningsfaktor SF1, ett värmestabilt protein som fungerar i sammansättningen av ett försplitsningskomplex" . Mol. Cell. Biol . 12 (10): 4545–52. doi : 10.1128/MCB.12.10.4545 . PMC 360381 . PMID 1406644 .
•    Naumovski L, Cleary ML (1996). "Det p53-bindande proteinet 53BP2 interagerar också med Bc12 och hindrar cellcykelprogression vid G2/M" . Mol. Cell. Biol . 16 (7): 3884–92. doi : 10.1128/MCB.16.7.3884 . PMC 231385 . PMID 8668206 .
•    Arning S, Grüter P, Bilbe G, Krämer A (1996). "Däggdjurssplitsningsfaktor SF1 kodas av varianter av cDNA och binder till RNA" . RNA . 2 (8): 794–810. PMC 1369416 . PMID 8752089 .
•    Abovich N, Rosbash M (1997). "Cross-intron bryggande interaktioner i jästförpliktelsekomplexet bevaras i däggdjur" . Cell . 89 (3): 403–12. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80221-4 . PMID 9150140 . S2CID 18466775 .
•   Caslini C, Spinelli O, Cazzaniga G, et al. (1997). "Identifiering av två nya isoformer av ZNF162-genen: en växande familj av signaltransduktion och aktivator av RNA-proteiner". Genomik . 42 (2): 268–77. doi : 10.1006/geno.1997.4705 . PMID 9192847 .
•   Zhang D, Childs G (1998). "Humant ZFM1-protein är en transkriptionsrepressor som interagerar med transkriptionsaktiveringsdomänen för stegspecifikt aktivatorprotein. " J. Biol. Chem . 273 (12): 6868–77. doi : 10.1074/jbc.273.12.6868 . PMID 9506990 .
•    Berglund JA, Abovich N, Rosbash M (1998). "En samverkande interaktion mellan U2AF65 och mBBP/SF1 underlättar igenkänning av grenpunktsregioner" . Genes Dev . 12 (6): 858–67. doi : 10.1101/gad.12.6.858 . PMC 316625 . PMID 9512519 .
•   Zhang D, Paley AJ, Childs G (1998). "Transkriptionsrepressorn ZFM1 interagerar med och modulerar förmågan hos EWS att aktivera transkription. " J. Biol. Chem . 273 (29): 18086–91. doi : 10.1074/jbc.273.29.18086 . PMID 9660765 .
•    Neubauer G, King A, Rappsilber J, et al. (1998). "Masspektrometri och EST-databassökning möjliggör karakterisering av multi-protein spliceosomkomplexet". Nat. Genet . 20 (1): 46–50. doi : 10.1038/1700 . PMID 9731529 . S2CID 585778 .
•    Wang X, Bruderer S, Rafi Z, et al. (1999). "Fosforylering av splitsningsfaktor SF1 på Ser20 av cGMP-beroende proteinkinas reglerar spliceosomsammansättning" . EMBO J . 18 (16): 4549–59. doi : 10.1093/emboj/18.16.4549 . PMC 1171529 . PMID 10449420 .
•   Lapteva N, Nieda M, Ando Y, et al. (2001). "Uttryck av gener i renin-angiotensin-system i omogna och mogna dendritiska celler identifierade med hjälp av human cDNA-mikroarray". Biochem. Biophys. Res. Commun . 285 (4): 1059–65. doi : 10.1006/bbrc.2001.5215 . PMID 11467860 .
•    Goldstrohm AC, Albrecht TR, Suñé C, et al. (2001). "Transkriptionsförlängningsfaktorn CA150 interagerar med RNA-polymeras II och pre-mRNA-splitsningsfaktorn SF1" . Mol. Cell. Biol . 21 (22): 7617–28. doi : 10.1128/MCB.21.22.7617-7628.2001 . PMC 99933 . PMID 11604498 .
•    Liu Z, Luyten I, Bottomley MJ, et al. (2001). "Strukturell grund för igenkänning av introngrenställets RNA genom splitsningsfaktor 1" . Vetenskap . 294 (5544): 1098–102. Bibcode : 2001Sci...294.1098L . doi : 10.1126/science.1064719 . PMID 11691992 . S2CID 21402023 .
•    Rappsilber J, Ryder U, Lamond AI, Mann M (2002). "Storskalig proteomisk analys av den mänskliga spliceosomen" . Genome Res . 12 (8): 1231–45. doi : 10.1101/gr.473902 . PMC 186633 . PMID 12176931 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds-cDNA-sekvenser för människor och mus" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•   Selenko P, Gregorovic G, Sprangers R, et al. (2003). "Strukturell grund för molekylär igenkänning mellan mänskliga splitsningsfaktorer U2AF65 och SF1/mBBP" . Mol. Cell . 11 (4): 965–76. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00115-1 . PMID 12718882 .
•    Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
•    Lin KT, Lu RM, Tarn WY (2004). "De WW-domäninnehållande proteinerna interagerar med den tidiga spliceosomen och deltar i pre-mRNA-splitsning in vivo" . Mol. Cell. Biol . 24 (20): 9176–85. doi : 10.1128/MCB.24.20.9176-9185.2004 . PMC 517884 . PMID 15456888 .