TMEM211

LHFPL7
Identifiers
, bA9F11.1, transmembranprotein 211, Q6ICI0, LHFPL tetraspan subfamily member 7, TMEM211
External IDs
Ortologer
Arter Mänsklig Mus
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Plats (UCSC)
PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus
Människan TMEM211

Transmembranprotein 211 (TMEM211, bA9F11.1, Q6ICI0, LHFLP7) är ett tetraspan- membranprotein under LHFPL-underfamiljen. Det spelar främst en roll i uppfattningen av ljud men kan ha sekundära roller i insulinsignalering . Den kodas av TMEM211-genen och finns i nästan alla djur.

Uttryck och lokalisering

Humant TMEM211 RNA uttrycks i relativt låga nivåer, men visar tydliga toppar i vävnaderna i hjärnan, magen, lungorna, brösten, äggstockarna, prostatan, luftstrupen och spottkörtlarna . Hos fostret uttrycks TMEM211 RNA återigen i hjärnan och magen, men uttrycks också i tarmarna. TMEM211 är också känt för att uttryckas i hud, i betydligt större mängder i solexponerad hud än i icke-solexponerad hud, och överuttryckt i trippelnegativ bröstcancer. I ett kompendium av friska hundvävnader visade TMEM211 det högsta uttrycket i bukspottkörteln (Figur 1). Inom bukspottkörteln uppvisar TMEM211 starkt partisk överflöd i de Langerhanska öarna och är frånvarande från annan bukspottkörtelvävnad (Figur 2). TMEM211 är lokaliserad till plasmamembranet som ett resultat av dess fyra transmembranspiraler .

Trots proteinets lokalisering till livmodern, äggstockarna och bröstmjölken, ger oral administrering av östradiol till kvinnor i menopaus inte någon signifikant förändring i nivån av TMEM211-uttryck. Det minskade dock signifikant variationen av TMEM211 mellan prover, vilket indikerar att östrogen utövar en kontrollerande effekt på TMEM211, troligen genom en indirekt mekanism (Figur 3). TMEM211 visade sig också uttryckas i högre nivåer hos överviktiga individer (Figur 4). Detta resultat kan förklaras av upptäckten att fetma, särskilt icke-diabetisk fetma, är korrelerad med en ökning av både volymen och antalet Langerhanska öar. Alzheimerspatienter uppvisade likaså högre TMEM211-uttryck jämfört med icke-Alzheimers individer, liksom kvinnor jämfört med män (Figur 5).

  • Figure 1. TMEM211 RNA Compendium of normal tissues in Canis familiaris.

    Figur 1. TMEM211 RNA-kompendium av normala vävnader i Canis familiaris.

  • Figure 2. Immunohistochemical staining of TMEM211 in human pancreas shows strong positivity in islets of Langerhans. Samples were probed using a TMEM211 Polyclonal Antibody (Product # PA5-64290).

    Figur 2. Immunhistokemisk färgning av TMEM211 i human pankreas visar stark positivitet i Langerhanska öar. Prover undersöktes med användning av en TMEM211 polyklonal antikropp (produkt # PA5-64290).

  • Figure 3. Oral administration of estrogen caused an increase in the expression of TMEM211, but not significantly so (p=0.24). Estrogen reduced the variability in TMEM211 expression (p<0.01).

    Figur 3. Oral administrering av östrogen orsakade en ökning av uttrycket av TMEM211, men inte signifikant (p=0,24). Östrogen minskade variabiliteten i TMEM211-uttryck (p<0,01).

  • Figure 4. TMEM211 is expressed higher in those who are morbidly obese than those who are not (p=0.015).

    Figur 4. TMEM211 uttrycks högre hos de som är sjukligt feta än de som inte är det (p=0,015).

  • Figure 5. Alzheimer's patients express more TMEM211 than non-Alzheimer's individuals (p=0.051).

    Figur 5. Alzheimerspatienter uttrycker mer TMEM211 än icke-Alzheimers individer (p=0,051).

Översättningar och homologer

Figur 6. Kommenterad konceptuell översättning av mänskligt TMEM211. Gröna och röda markeringar indikerar start- respektive stoppkodon.

Figur 6 visar utvalda regioner av intresse för den humana TMEM211-proteinsekvensen. Mest anmärkningsvärt visar det platsen och närvaron av transmembranregionerna och exongränsen. RNA-transkriptet består av fyra exoner , men endast två av dessa exoner innehåller kodande sekvens . Det unika är att proteinet har två startkodon , som båda kan börja translation och leda till proteinprodukter. Detta är huvudorsaken till TMEM211 isoformer .

Ortholog utrymme

Figur 7. Ortholog Space för TMEM211.

TMEM211 finns i de flesta djurarter, men finns inte utanför djur (Figur 7). Den äldsta gruppen av organismer där genen finns allestädes närvarande är anemoner , som avvek från människor för 824 miljoner år sedan. Genen finns inte i organismer som divergerade för 934 miljoner år sedan, vilket indikerar att genen är mellan 824 och 934 miljoner år gammal. Efter evolutionen återfinns genen i fiskar, amfibier, reptiler, fåglar och däggdjur. Det finns dock en kladd med ett annat uttrycksmönster, leddjur . Genen finns lätt hos kräftdjur, men saknas hos alla andra leddjur. Av okända skäl bibehåller marina leddjur TMEM211-genen medan terrestra leddjur har förlorat den.

Det finns ett möjligt undantag från detta, den vita fjärilsparasiten. Den här genen hittas av BLAST när man letar efter humant TMEM211, och sökningen efter White Butterfly Parasites TMEM211-sekvens gav resultat i andra parasitgetingar, vilket indikerar att detta sannolikt inte var ett sekvenserings- eller kontamineringsfel. Denna lilla kladd kan ha bevarat genen medan resten av de landlevande leddjuren förlorade den. Emellertid är TMEM211-generna som finns inom denna kladd betydligt mindre lika än alla andra organismer med samma förfäders avstånd från människor. Även om genen kan vara en ortolog , kan den också fylla en ny funktion för denna grupp getingar, vilket är anledningen till att den här kladden behöll genen medan andra insekter förlorade den. Detta skulle också förklara den högre procentuella divergensen. På liknande sätt är det möjligt att denna grupp inte uttrycker genen, vilket skulle innebära att inga evolutionära krafter motverkar dess mutation, vilket gör att den kan förändras snabbare än i organismer där genen måste fungera som mall för ett funktionellt protein. Slutligen har det bevisats att larverten som denna grupp getingar förgriper sig på använder en entomopatogen försvarsmekanism. Detta virus orsakar inte sjukdom hos larven, men infekterar getingäggen och getinglarverna och har visat sig orsaka horisontell genöverföring . Det är lätt troligt att TMEM211-genen gavs till denna undergrupp av getingar av ett av dessa virus. Sedan, eftersom genen skapades artificiellt i genomet och inte tjänar ett verkligt syfte, muterar den fritt, vilket leder till den observerade divergensen som är högre än förväntat. Denna förklaring stöds av det faktum att intronet som skiljer de två halvorna av proteinet saknas. Alternativt kan BLAST-resultatet vara missvisande, och det som flaggas som TMEM211 är faktiskt en medlem av den paraloga LHFPL-familjen, som är känd för att finnas i både getingar och larver, och inkluderar medlemmar som inte delar TMEM211-intron.

Sekvensjusteringar

MSA för avlägsna ortologer belyser flera konserverade regioner (Figur 8). Men den mänskliga genen deltar inte i majoriteten av detta bevarande, och inte heller de andra däggdjuren. Detta överensstämmer med proteinets närvaro i bröstmjölk; icke-däggdjursarter har inte bröstmjölk, och därför kan proteinet ha lite olika funktioner hos däggdjur och icke-däggdjur. Mycket av proteinets identitet som visar sig matcha verkar spridd, men det finns en tydlig region med högsta bevarande . Hos människor sträcker sig denna region av aminosyrorna 132–150. De andra två regionerna med hög bevarande som delas av människor spänner över aminosyrorna 59-71 och 110-117. Det finns bara sex aminosyror med fullständigt bevarande över alla arter, Cys27, Gly 65, Gln100, Pro115, Cys127, Cys138. Hälften av de helt konserverade aminosyrorna är cystein , så cysteins sulfhydrylgrupp och förmåga att bilda disulfidbryggor och kovalenta bindningar kan vara viktiga för proteinets struktur och/eller funktion.

Sammantaget är aminosyrorna med högst bevarande med avseende på den mänskliga sekvensen tyrosin (81 %) och tryptofan (72 %). Dessa två aminosyror är viktiga för transmembranproteiner eftersom de kan interagera med både det hydrofoba membranet och den vattenhaltiga miljön inuti eller utanför cellen, och därför är det logiskt att dessa aminosyror är mycket konserverade. Om man tittar på däggdjurens inriktning är majoriteten av proteinet bevarat (Figur 9). Faktum är att varje protein som är helt okonserverat finns inbäddat i membranet, där exakt identitet sannolikt spelar mindre roll för proteinets funktion. Detta mönster förblir sant i den bredare MSA av ortologer, där regionerna med minst bevarande är mestadels inuti membranet. Samtidigt som TMEM211 har behållit detta bevarande har det utvecklats och muterats med organismerna som bär det. Divergensen av varje organisms gen följer normal fylogeni (Figur 10).

  • Figure 8. Multiple sequence alignment of TMEM211 orthologs.

    Figur 8. Multipelsekvensinriktning av TMEM211-ortologer.

  • Figure 9. Multiple sequence alignment of mammalian TMEM211 protein sequences.

    Figur 9. Multipelsekvensinriktning av TMEM211-proteinsekvenser från däggdjur.

  • Figure 10. Unrooted phylogenetic tree based on TMEM211 orthologs.

    Figur 10. Orotat fylogenetiskt träd baserat på TMEM211-ortologer.

Bevarade regioner

Det finns bevis som tyder på att transmembransegmenten är konserverade i mindre grad än de andra segmenten av proteinet, en uppfattning som stöds av det frekventa utbytet av små, opolära aminosyror inom dessa regioner. För att testa denna hypotes beräknades Shannon Variabilitetsbitar för varje position inom proteinet (Figur 11). Även om denna korrelation verkligen observeras, är sambandet inte tillräckligt stort för att vara avgörande. Med hjälp av Shannon-bitarna omvandlar figur 12 den kommenterade konceptuella översättningen till en kommenterad representation som bättre framhäver närheten till de konserverade regionerna och aminosyrorna i tredimensionellt rymd. De första och tredje konserverade regionerna är belägna intill varandra på den extracellulära sidan av proteinet, vilket möjligen skapar ett aktivt ställe. Orienteringen av transmembrandomänerna för också flera cysteiner i närheten, vilket gör att de kan bilda disulfidbryggor.

Figur 11. Shannon-variabilitet för TMEM211-ortologer. Transmembrandomäner uppvisar en genomsnittlig variabilitet på 1,80 jämfört med en genomsnittlig variabilitet på 1,70 för andra segment, vilket inte är signifikant (p=0,19).
Figur 12. Representation av humant TMEM211

Paraloger

Figur 13. Global anpassning av human TMEM211 och human LHFPL3 isorform 2. Transmembranregioner av TMEM211 är markerade i blått.
Figur 14. Korrigerad procentuell divergens vs förfäders avstånd från människor för TMEM211, fibrinogen alfa och cytokrom C.

En BLAST-fråga av den humana TMEM211-sekvensen inom det mänskliga genomet ger inga resultat. Detta verkar tyda på att människor inte har någon paralog. Men att skicka in TMEM211-sekvenser från icke-däggdjur som frågor returnerar Homo sapiens Lipoma högrörlig grupp IC-proteinfusionspartnerliknande tetraspan subfamiljemedlem 3 protein isoform 2 (LHFPL3). Dessutom ger BLAST-förfrågningar av icke-däggdjurs TMEM211-sekvenser som söker inom dessa organismers genom många resultat inom LHFPL-familjen. Detta protein liknar TMEM211 i det faktum att det är ett tetraspan-membranprotein. För att utvärdera om dessa fyra transmembranregioner är orsaken till hög likhet skapades en global anpassning mellan mänskligt TMEM211 och mänskligt LHFPL3 (Figur 13). Likheten verkar inte vara begränsad till transmembranregionerna, vilket indikerar att dessa två proteiner kan vara paraloga. Dessutom är 4 av de 6 aminosyrorna som är fullständigt konserverade i TMEM211-ortologer anpassade mellan TMEM211 och LHFPL3, vilket ytterligare bevisar att dessa proteiner är paraloger (p<0,01).

LHFPL-familjen har känd funktion; familjemedlemmar hjälper proteinbindning i hjärnan och är avgörande för uppfattningen av ljud. Knockouts eller förlust av funktionsmutationer hos dessa familjemedlemmar orsakar fullständig eller partiell dövhet hos människor och möss som sedan ärvs i ett autosomalt recessivt mönster. Andra mutationer till LHFPL har kopplats till tumörer, autism, Alzheimers och andra neurologiska tillstånd. De konserverade cysteinresterna i TMEM211 indikerar att detta kan vara en möjlig funktion för TMEM211 också. De konserverade regionerna som ligger i linje i tredimensionellt utrymme kan bilda ett bindningsställe som använder de konserverade cysteinresterna för att känna igen och binda substrat. I likhet med TMEM211 visar LHFPL-familjens medlemmar ett partiskt uttryck i hjärnan och spottkörtlarna. LHFPL visade sig inte uttryckas i bukspottkörteln, men enligt ovannämnda diskussion skulle uteslutning av Langerhanska öar från pankreasprover leda till detta resultat. LHFPL RNA, liksom TMEM211, var närvarande i lägre nivåer i mag-tarmkanalen, njurarna, prostata, sköldkörteln och könsorgan. LHFPL-familjemedlemmar har studerats mer än TMEM211, och proteinöverflödsdata visar att varje familjemedlem, med undantag för LHFPL2, visar sin högsta förekomstnivå i friska vävnader i hjärnan. Även om det fortfarande finns i hjärnvävnad i högre koncentrationer än majoriteten av andra hjärnproteiner, visar LHFPL2 ett överflöd av blodplättar som är 60 gånger större, bland de översta 10 % av blodplättsproteinerna. Varje familjemedlem visade också ökat överflöd i lungcancercellinjer, liksom TMEM211. Flera LHFPL familjemedlemmar hittades också i bröstmjölk, men i mycket lägre mängder än TMEM211. Trots sambandet med hörsel och ljuduppfattning visar varken TMEM211 eller någon LHFPL-familjemedlem ett lokaliseringsmönster som är partiskt till thalamus, tinningloben eller hörselbarken.

Fibrinogen alfa förstås vara ett snabbt utvecklande protein, medan cytokrom C är en modell av ett långsamt utvecklande protein. Den linjära trendlinjen för den korrigerade divergensen för TMEM211 är närmare den för fibrinogen alfakedja än den för cytokrom C (Figur 14). Om man tittar på själva data, har TMEM211 och fibrinogen alfakedja divergerat i nästan exakt samma takt under de senaste 400 miljoner åren. Således är TMEM211 också ett snabbt föränderligt protein. Detta kan bero på mönster som observerats tidigare, där segmenten av proteinet inuti membranet tillåts förändras med stor frihet. Det är också möjligt att divergensen accelererade med uppkomsten av det första däggdjuret för 200 miljoner år sedan, förutsatt att proteinets existens i bröstmjölk tyder på en annan funktion. Slutligen delar den humana LHFPL3-genen 17,8% identitet med humant TMEM211, vilket motsvarar en korrigerad divergens på 173%. Denna divergens är i linje med anemonernas, den mest avlägsna mänskliga förfadern som delar TMEM211-genen, något som skulle förväntas om de två generna är paraloger födda från samma förfäders gen. Att använda trendlinjen för att förutsäga LHFPL:s datum för divergens resulterar i en uppskattning av 634-903 mya (95 % konfidensintervall). Detta överlappar det uppskattade intervallet för uppkomsten av TMEM211-genen för 824-934 miljoner år sedan, vilket stöder uppfattningen att de två är paraloger.

Transkription

Promotor

Figure 15. TMEM211 is under the GXP_6044388 promoter.
Figur 16. MSA för human GXP_6044388 sektion och ortologer. Röd markering indikerar början av mänsklig transkription. Gröna höjdpunkter visar regioner med hög bevarande.

TMEM211 anses vara under kontroll av GXP_6044388- promotom (Figur 15). GXP_6044388-promotorn finns i stor utsträckning över arter och upprätthåller distinkta bevaranderegioner (Figur 16). Hos människor finns det en överlappning på 40 baspar mellan denna promotor och den första exonen av TMEM211 RNA-transkriptet, även om denna exon inte direkt bidrar till den resulterande proteinsekvensen. Promotorn verkar inte vara tillräckligt nära andra gener för att påverka uttrycket av något annat än TMEM211. Ortologer för denna promotorsekvens finns före TMEM211-ortologer i en mängd arter. Det finns sekvenser med hög delad identitet med GXP_6044388-promotorsekvensen som finns på kromosomerna 5,6,7,13,14,15,16,17,18,19,20 och Y, även om många av dessa sekvenser inte finns i närheten av andra gener och får inte uttryckas. Intressant nog delar GXP_6044388 en genomsnittlig identitet på 43,83 % med LHFPL-familjemedlemmarnas 6 promotorer. Denna delade identitet är tillräckligt hög för att dra slutsatsen att dessa promotorer är homologa.

Transkriptionsfaktorer

FEZF1.02 och VDR_RXR.03 är de mest sannolika kandidaterna för att kontrollera TMEM211-genuttryck. FEZF1.02 valdes ut som en trolig kandidat eftersom det var den enda identifierade möjliga transkriptionsfaktorn som var specifik för hjärnan, där TMEM211 är känt för att uttryckas i höga kvantiteter i förhållande till andra uttrycksställen. FEZF1.02 ökar transkriptionen och binder mot VDR_RXR.03, en heterodimer transkriptionskoaktivator som är beroende av kalcitriol. Kalcitriol är en form av D-vitamin som delvis produceras i huden som svar på solljus, vilket skulle förklara TMEM211:s högre uttryck i solexponerad hud än i icke-solexponerad hud. Dessutom är den huvudsakliga platsen för kalcitriolproduktion njuren, som ska användas som ett hormon som signalerar sköldkörteln, och båda dessa platser var bland de högsta områdena av TMEM211-uttryck. Kalcitriol överförs också från ammande mödrar i bröstmjölk. Dessutom har oral administrering av östrogen visat sig öka biotillgängligheten av konsumerad kalcitriol och leder till högre nivåer av kalcitriol i cirkulationen. Således kan VDR_RXR.03 förklara effekterna av oral östrogenadministrering på TMEM211-uttryck. Kalcitriol är också en molekyl som lungorna litar på för korrekt funktion. Slutligen visade TMEM211 ett extremt mönster av lokalisering till de Langerhanska öarna i bukspottkörteln. Betaceller från bukspottkörteln är kända för att delta i signalering av kalcitriol, som svarar med en ökning av insulinutsöndringen från de Langerhanska öarna och en ökad motståndskraft mot cellulär stress. Sammantaget kan VDR_RXR.03 på egen hand förklara majoriteten av TMEM211-uttryck och lokalisering. Det är också av intresse att kalcitriolbehandling har visat sig öka uttrycket av LHFPL-RNA.

mRNA

Figur 17. Inriktning av TMEM211 5'UTR. Gult markerar bevarandeområden.

5'UTR för TMEM211 är konserverad i mindre grad än den kodande sekvensen (Figur 17) . 3'UTR är inte bevarad alls, till den grad att BLAST inte kan lokalisera andra ortologa sekvenser. Detta kan bero på att 3'UTR inte är termodynamiskt gynnsam och har många möjliga konformationer inom varje art. Således finns de enda strukturella beståndsdelarna i 5'UTR:n. Det finns en stabil, mycket konserverad stamslinga närvarande i mRNA som är belägen nära början av translationen som kan steriskt hindra translation, eller omvänt, kännas igen av initieringsfaktorer eller transportproteiner (Figur 18, vänster). Det finns ett strukturellt element som är bevarat över ortologer i både sekvens och struktur, ett par intilliggande, mycket stabila stamslingor (Figur 18, mitten). Denna struktur är belägen långt från andra platser längs den linjära sekvensen, men kan kännas igen av transportproteiner eller signalvägar. Slutligen finns det en mindre stabil stamslinga vid 5'-änden av 5'UTR (Figur 18, höger). Även om denna stam-loop är mindre stabil än de andra strukturella elementen, är sekvensen och strukturen av själva loopen helt bevarad över ortologerna, inklusive cytosinet som stöts ut från stammen. Detta tyder på att denna struktur känns igen och binds av något protein, där sedan den låga nivån av basparning längs stammen skulle tillåta att strukturen lätt kan ångras och tillåta mRNA att förbli bundet till proteinet. Faktum är att den konserverade och exponerade slingan känns igen som ett bindningsställe av MEIS1 .01, ett homeobox-protein involverat i neural crest-utveckling och neural differentiering. Dessutom orsakar MEIS1-brist hörselnedsättning hos möss, vilket också är resultatet som observeras när LHFPL-paraloger förlorar funktion.

Figur 18. Välj TMEM211-mRNA-strukturelement som förutspåtts av mfold. Strukturer valdes baserat på gynnsamma termodynamiska egenskaper och bevarande över ortologer. 3'-änden är där översättningen börjar.

Strukturera

Interna upprepningar

Figur 19. Punktmatris av humant TMEM211. Röda cirklar markerar de enda interna upprepningarna med positiva poäng. Den lokala anpassningen med högst poäng återfinns mellan 37:e och 83:e positionerna i proteinet, som fick poängen 6. Skapad med Dotlet.

Det finns bara två lokala anpassningar inom TMEM211 som ger positiva poäng (Figur 19). Ingen av dessa anpassningar är imponerande lika och är sannolikt resultatet av en slumpmässig slump. Detta avskedande stöds av det faktum att ingen av dessa upprepningar är bevarade hos andra djur.

Sammansättning

Figur 20. Sammansättningsanalys av humant TMEM211. Det finns inga signifikanta avvikelser från den genomsnittliga humana proteinsammansättningen.

Human TMEM211 har en molekylvikt på 20,4 KD och en isoelektrisk punkt på 9,64. Denna molekylvikt är mindre än det genomsnittliga humana proteinet, medan pI är mycket högre än det genomsnittliga pI för humana proteiner (6,5), men fortfarande inom det normala intervallet för ett transmembranprotein. Det finns inga kluster av laddning trots detta förhöjda pI. Proteinsekvensen avviker inte signifikant från genomsnittliga humana proteiner i dess aminosyrasammansättning (Figur 20).

Den mänskliga TMEM211-proteinsekvensen har analyserats av ett antal mjukvara för att leta efter strukturella element, domäner och lokaliseringsinformation. Närvaron av de fyra transmembrandomänerna bekräftades av PSORT II, ​​Eukaryotic Linear Motif och Interpro . Dessa program bekräftade också orienteringen av proteinet i membranet och dess lokalisering. identifierade PSORT II och PROSITE ett leucindragkedjemönster som börjar vid position 56. Framför allt identifierade MyHits Motif Scan en domän som delas med LHFPL-familjen som sträcker sig över positionerna 100–157. På liknande sätt rapporterade MotifFinder också en domän som delas mellan TMEM211 och LHFPL-familjen, även om den utökade denna delade region till att sträcka sig över positionerna 53–158. Denna expansion inkluderar nu det tidigare identifierade leucinblixtlåsmönstret.

Post-translationella modifieringar

Den humana TMEM211-proteinsekvensen har analyserats med flera program för att söka efter platser för post-translationell modifiering . Först identifierade verktyget Eukaryotic Linear Motif flera statistiskt signifikanta fosforyleringsställen och ett fästställe för glykosaminoglykan , men alla fanns inom transmembrandomäner där aminosyrasekvensen inte skulle exponeras för dessa faktorer. Dessutom är dessa platser inte bevarade över ortologer, inte ens hos andra däggdjur. Negativa resultat erhölls på liknande sätt från Marcoil, Sulfinator, PhosphoSitePlus , GPS-SUMO, NetNGlyc och NetOGlyc.

NetPhos förutspår mycket starkt att S93 skulle fosforyleras, men detta serin finns inte i ortologer utanför primater. Det är dock möjligt att detta är en del av en däggdjursspecifik funktion. Detta serin är på motsatt sida av membranet från det antagna aktiva stället , så det är osannolikt att det modulerar proteinaktivitet. Detta fosforyleringsställe kan vara en del av en signalväg som proteinet leder.

DiANNA hittar också resultat, som belyser den troliga bildningen av en disulfidbindning mellan C127 och C138. Andra resultat som involverade en bindning över cellmembranet avfärdades. Cysteinerna i den förutsagda bindningen är fullständigt bevarade över alla organismer i MSA, och därför är denna bindning sannolikt av avgörande betydelse för TMEM211:s struktur och resulterande funktion.

Kommenterad struktur

Figur 21. Representation av mänskligt TMEM211 annoterat med domäner av intresse och bevarande.

Identifierade domäner av intresse lades till den tidigare modellen av humant TMEM211 (Figur 21). Leucinblixtlåsmönstret förekommer över en mycket konserverad del av proteinet, som båda ingår i den utökade domänen som delas med LHFPL-familjen. Denna utökade domän täcker hela den förutsagda aktiva platsen, som alla också är mycket bevarade över arter. Den kortare delade domänen visas för tydlighetens skull, men även denna kortare domän överlappar majoriteten av den aktiva platsen och är mycket bevarad. Medan leucin blixtlås är bättre förstådda med avseende på intracellulära funktioner, har extracellulära leucin blixtlås visat sig hjälpa proteinbindning och vara funktionella komponenter i signalreceptorer. Dessa är båda identifierade funktioner i LHFPL-familjen och kan vara funktioner för TMEM211.

De transmembrana domänerna hålls var och en på plats av proteinets sekvens, modifieringar eller sekundära strukturer, förutom deras sammansättning av mestadels hydrofoba rester. Den första transmembrandomänen hålls på plats på den intracellulära sidan av positivt laddade argininrester som hindrar domänen från att glida in i membranet. Transmembrandomänerna 1 och 2 stabiliseras båda på den extracellulära sidan genom bildandet av beta-ark i sekvensen mellan dem. Denna struktur skulle inte kunna passera genom membranet. På den intracellulära sidan förhindras transmembrandomän 2 från att röra sig av laddade argininrester och polära serinrester. Dessa rester är också det förutsagda fosforyleringsstället, vilket ytterligare skulle hämma rörelsen av transmembrandomänen. Transmembrandomän 3 kan sannolikt flyttas vidare mot det extracellulära utrymmet, eftersom de sju aminosyror som föregår den är helt hydrofob. Kort efter skulle en treoninrest och en fullständigt konserverad glutaminrest hindra sekvensen från att röra sig längre in i membranet. Sju positioner är också vad som krävs för att den helt konserverade C127 på andra sidan av transmembrandomän 3 ska flytta ut ur membranet och bilda den förutsagda disulfidbindningen med c138. När den väl bildats skulle denna bindning förhindra att domänen glider tillbaka till sin ursprungliga position. Transmembrandomän 4 kan sannolikt skifta mer fritt, eftersom det oavsett position kommer att tvinga in en viss mängd laddade eller polära rester i membranet. Den kanske kan glida hela vägen tills den möter disulfidbindningen av c138, för denna positionering tvingar in det minsta antalet polära och laddade aminosyror i membranet. Denna region av polära och laddade rester inuti ett hydrofobt membran är ett av de minst konserverade områdena av proteinet, troligen för att det är instabilt och borta från det aktiva stället.

Tertiär struktur

Strukturen av TMEM211 kan förutsägas med mycket hög tillförsikt (Figur 22). Den enda regionen med låg konfidens är regionen som föregår C-terminalen , som är mycket icke-konserverad och instabil. Detta är också den enda större delen av proteinets struktur som varierar mellan olika arter. Som visas klungar de fyra transmembrandomänerna ihop, men rymdfyllande modeller visar tydligt att de inte bildar en framkomlig kanal.

Figur 22. Human TMEM211. Konfidenserna varierar från mycket hög (blå, >90%) till mycket låg (orange, <70%)

Även om inga kluster av laddning detekterades i den linjära TMEM211-sekvensen, finns det ett tydligt kluster av laddning, positivt och negativt, beläget inuti bindningsstället ( Figur 23). Detta skulle tillåta det aktiva stället för TMEM211 att joniskt interagera med dess ligand , samt ge proteinet ytterligare substratspecificitet än strukturen ensam. Viktigt är att det förutsagda bindningsstället för TMEM211 är tillgängligt för lösningsmedel , mer än resten av proteinet (Figur 23). Denna tillgänglighet kommer att tillåta liganden att komma in i och interagera med proteinet. Kombinationen av laddningar, struktur och konserverade cysteinrester hjälper sannolikt alla TMEM211 att binda till en ligand. Bindningsställena för LHFPL-familjemedlemmar binder andra proteiner, men inga funktionella protein-proteininteraktioner har upptäckts för TMEM211. Den enda interaktion som har observerats är mellan TMEM211 och P29996 av Hepatit Delta . Men P29996 är känt för att interagera med 156 andra mänskliga proteiner av olika typer, och TMEM211 är sannolikt fångad i denna promiskuitet och inte riktad till någon specifik funktionell roll.

Figur 23. Human TMEM211 med laddade rester. Positiva laddningar är färgade blå medan negativa laddningar är färgade röda.
Figur 24. Extracellulär vy som tittar in i det aktiva stället för TMEM211. Rester är färgade baserat på procentandelen av lösningsmedelstillgänglig yta, blå färg anger mindre än 45 % tillgänglighet, medan rött anger mer än 45 % tillgänglighet. Proteinets bindningsficka är den region som är mest tillgänglig för lösningsmedel.

Variation

Figur 25. Human TMEM211-representation kommenterad med domäner av intresse, konserverade regioner och kända SNP:er.

Exklusive tysta mutationer finns det 7 SNP som är kända för att förekomma med heterozygositet i den mänskliga populationen av TMEM211-gener. Dessa mutationer lades till representationen av TMEM211 (Figur 25). Mutation W67R uppvisar 50 % heterozygositet, vilket indikerar att denna mutation sannolikt har liten eller ingen effekt på proteinfunktionen. Men flera andra variationer har signifikanta korrelationer med fenotyper . Variationer till G140, som blir R eller A, är associerade med mönster i BMI . Om dessa förändringar påverkar proteinets funktion, som man vet finns i de Langerhanska öarna, kan det påverka BMI genom förändringar av nivåerna av utsöndrat insulin. Variation M145I är associerad med en ökad risk för Alzheimers, vilket stämmer överens med kända variationer av LHFPL som också ökar risken för Alzheimers. Mest anmärkningsvärt är variation C127W förknippad med dövhet och hörselnedsättning. C127 finns i bindningsfickan och förutsägs bilda en disulfidbindning med C138. Tryptofan skulle inte kunna engagera sig i en disulfidbindning och skulle sannolikt förändra den funktionella förmågan hos bindningsstället. C127W är sannolikt en förlust av funktionsmutation, som då exakt speglar den kända resulterande dövhet och hörselnedsättning från förlust av funktionsmutationer hos LHFPL-familjemedlemmar. För att främja likheten är detta par av cysteiner helt bevarat över LHFPL-familjen.

Det förekom inga mutationer inom bindningsställena för möjliga transkriptionsfaktorer eller inom mRNA-strukturelementen, men det fanns inte tillräckligt med tillgängliga data för att dra slutsatsen att detta beror på nödvändig bevarande av dessa sekvenser.

Fungera

För närvarande finns det ingen känd funktion för TMEM211. Ett informativt experiment skulle vara ett knockout-experiment på möss, där TMEM211-genen tas bort eller ersätts med CRISPR . Förutsatt att proteinet fyller någon funktion, kommer musen då att vara bristfällig i någon aspekt. Särskild uppmärksamhet bör ägnas åt musens uppfattning av ljud, eftersom detta är resultatet av knockout-experiment på LHFPL-familjemedlemmar. Även om detta experiment sannolikt inte skulle bevisa specifika funktioner hos TMEM211, kan det identifiera regioner eller vägar att fokusera på i framtida experiment. Detta skulle begränsa fältet för möjliga funktioner som föreslås av proteinets överflöd i bukspottkörteln, bröst, hjärna och könsorganvävnad.

Insulin är en viktig aspekt av cellulärt glukosupptag och behövs av de flesta celler i människokroppen. Det frisätts som svar på höga blodsockernivåer. Antikroppsfärgning har visat att TMEM211 uppvisar en extrem bias för lokalisering till de insulinutsöndrande öarna i Langerhans i pankreasvävnad, och en föreslagen funktion för TMEM211 och LHFPL-familjen är signalrelä. Således kan en möjlig funktion av TMEM211:s extracellulära bindningsställe vara att binda till glukos och vidarebefordra en signal om att glukos finns i blodomloppet. Detta är den kända funktionen av en adenosintrifosfatkänslig K+-kanal, men signalvägar är ofta överflödiga och det skulle vara logiskt att människokroppen har utvecklat redundans för en process som är livsviktig. För att testa denna hypotes bör ett ytplasmonresonansexperiment utföras med hjälp av stabiliserad TMEM211 och glukoslösning. Denna metod för experiment är effektiv för att bedöma bindning mellan små ligander och membranproteiner. Om den bestämda bindningshastigheten inte är noll, binder glukos sannolikt till det aktiva stället. Om bindningshastigheten är noll, bör experimentet upprepas med icke-glukos näringsämnen som påverkar insulinutsöndringen, nämligen fria fettsyror och fria aminosyror, och upprepas med hormoner som påverkar insulinutsöndringen, inklusive melatonin, östrogen, leptin, tillväxthormon. och glukagonliknande peptid-1. Om någon av dessa resulterar i en bindningshastighet som inte är noll, kan ett experiment sedan utföras för att avgöra om den interaktionen är ansvarig för att signalera insulinfrisättning. Det är också möjligt att, till skillnad från glukosvägen, bindningen av TMEM211 och den resulterande signalen undertrycker insulinfrisättning. Resultaten av detta experiment kan sedan tillämpas någon annanstans. Många andra celler och vävnader med TMEM211 svarar också på glukos eller hormoner, och även om signalen kan orsaka ett annat svar i varje celltyp, bör det extracellulära bindningsstället behålla sin specificitet för sin ligand oavsett vävnadstyp. Till exempel producerar spottkörteln extra saliv i närvaro av glukos och har högt uttryck av TMEM211. Om resultat från bukspottkörtelexperiment visar att TMEM211 detekterar och signalerar glukosnivåer, kan det antas att TMEM211 modulerar salivproduktionen i spottkörteln.

Slutligen visade varken TMEM211 eller någon LHFPL-familjemedlem ett partiskt överflöd för de delar av hjärnan som är associerade med auditiv bearbetning, men mutationer påverkar en organisms förmåga att höra. Emellertid är 5'UTR av TMEM211 mRNA mycket konserverad och är bunden av MEIS1.01, ett embryonalt protein involverat i neural differentiering. Det är möjligt att mutationer i dessa gener inte orsakar dövhet eller förlust av hörsel genom att bryta vägen för uppfattningen av ljud, utan genom att förhindra lämplig utveckling av strukturer som behövs för att bearbeta hörselsignaler. Mutationerna kan förhindra att någon aspekt av hörselvägen sätts ihop eller differentierar sig korrekt under utvecklingen. Detta är den mekanism genom vilken mutation till andra transmembranproteiner i innerörat orsakar dövhet. Dessa mutationer kan induceras i möss, vilket möjliggör undersökning av skillnader i struktur och ljudbehandling mellan möss som har TMEM211-mutationer, möss med LHFPL-mutationer och kontrollmöss. fMRI skulle tillåta forskare att observera var i den auditiva processvägen defekten inträffade. För att separera dessa mekanismer bör de experimentella mössen födas upp med vildtypsmöss för att skapa en generation av möss som är heterozygota för mutationen. Dessa möss skulle fortfarande visa vissa aspekter av auditiv bearbetning och kan leda forskare till den specifika nedbrytningen i vägen som orsakas av mutationen. Inkluderat i denna studie bör den fysiska undersökningen av innerörat vara.

Funktionen i hörselvägen förklarar också de mönster som observerats i vilka organismer har genen. Cnidaria var de första djuren som kunde upptäcka vibrationer i vätskan som omgav deras kroppar. Anemone använder till och med hårliknande strukturer som liknar det mänskliga inre örat, en struktur som sannolikt gav upphov till moderna öron. Ryggradsdjur och leddjur är de enda djuren som har vad som skulle betecknas som öron, men många ryggradslösa djur använder fortfarande strukturer som liknar anemonens. Detta förklarar punkten på divergensgrafen där genen snabbt börjar förändras, vilket exakt överensstämmer med uppkomsten av landlevande djur. Genen började förändras snabbare när organismer började anpassa sig till ljuduppfattning i luft i motsats till i vatten. Detta förklarar också varför amfibierna visar mycket lägre identitet med mänskligt TMEM211 än vad som förväntas baserat på deras datum för divergens; deras protein behövde inte förändras så mycket som de stannade kvar i vattenmiljöer. Landlevande leddjur har inte TMEM211, även om de har öron. Landlevande ryggradsdjur och landlevande leddjur delar dock inte en landlevande förfader. Ryggradsdjur utvecklades för att bebo land som tetrapoder, som anpassade TMEM211-genen så att de kunde bearbeta ljud i luften. Landlevande leddjur uppstod från de marina leddjuren, och även om de utvecklade något märkt som ett öra, är det produkten av konvergent evolution , inte delad härkomst. Leddjurens utveckling av öron kunde ha slutat använda TMEM211-genen eftersom de hittade en alternativ väg för att uppfatta ljud i luft.

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000206069 - Ensembl , maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000066964 - Ensembl , maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Referens:" . National Center for Biotechnology Information, US National Library of Medicine .
  4. ^ "Mouse PubMed Referens:" . National Center for Biotechnology Information, US National Library of Medicine .
  5. ^ a b c d    Jumper, John; Evans, Richard; Pritzel, Alexander; Green, Tim; Figurnov, Michael; Ronneberger, Olaf; Tunyasuvunakool, Kathryn; Bates, Russ; Žídek, Augustin; Potapenko, Anna; Bridgland, Alex; Meyer, Clemens; Kohl, Simon AA; Ballard, Andrew J.; Cowie, Andrew; Romera-Paredes, Bernardino; Nikolov, Stanislav; Jain, Rishub; Adler, Jonas; Tillbaka, Trevor; Petersen, Stig; Reiman, David; Clancy, Ellen; Zielinski, Michal; Steinegger, Martin; Pacholska, Michalina; Berghammer, Tamas; Bodenstein, Sebastian; Silver, David; Vinyals, Oriol; Senior, Andrew W.; Kavukcuoglu, Koray; Kohli, Pushmeet; Hassabis, Demis (26 augusti 2021). "Mycket exakt proteinstrukturförutsägelse med AlphaFold" . Naturen . 596 (7873): 583–589. Bibcode : 2021Natur.596..583J . doi : 10.1038/s41586-021-03819-2 . PMC 8371605 . PMID 34265844 .
  6. ^   Navarini, Alexander A.; Simpson, Michael A.; Weale, Michael; Riddare, Jo; Carlavan, Isabelle; Reiniche, Pascale; Burden, David A.; Layton, Alison; Bataille, Veronique; Allen, Michael; Snälla, Robert; Rosa, Andrew; Creamer, Daniel; engelska, John; Munn, Stephanie; Walton, Shernaz; Willis, Carolyn; Déret, Sophie; Voegel, Johannes J.; Spector, Tim; Smith, Catherine H.; Trembath, Richard C.; Barker, Jonathan N.; Barker, JN (september 2014). "Genomomfattande associationsstudie identifierar tre nya mottaglighetsställen för svår akne vulgaris" . Naturkommunikation . 5 (1): 4020. Bibcode : 2014NatCo...5.4020. . doi : 10.1038/ncomms5020 . PMID 24927181 .
  7. ^    Harrington, John J.; Shef, Bruce; Rundlett, Stephen; Jackson, P. David; Perry, Rob; Cain, Scott; Leventhal, Christina; Thornton, Mark; Ramachandran, Rakesh; Whittington, Jessica; Lerner, Laura; Costanzo, Dana; McElligott, Karen; Boozer, Sherry; Mays, Robert; Smith, Emery; Veloso, Neil; Klika, Alison; Hess, Jennifer; Cothren, Kevin; Lo, Kalok; Offenbacher, Jason; Danzig, Joel; Ducar, Matt (maj 2001). "Skapande av genomomfattande proteinuttrycksbibliotek med slumpmässig aktivering av genuttryck". Natur Bioteknik . 19 (5): 440–445. doi : 10.1038/88107 . PMID 11329013 . S2CID 25064683 .
  8. ^    Rose, Jed E.; Behm, Frédérique M.; Drgon, Tomas; Johnson, Catherine; Uhl, George R. (juli 2010). "Personligt rökavvänjning: Interaktioner mellan nikotindos, beroende och genotypresultat för sluta framgång" . Molekylär medicin . 16 (7–8): 247–253. doi : 10.2119/molmed.2009.00159 . PMC 2896464 . PMID 20379614 .
  9. ^    Programlag för däggdjursgensamling (MGC); et al. (24 december 2002). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 99 (26): 16899–16903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
  10. ^    Collins, John E; Wright, Charmain L; Edwards, Carol A; Davis, Matthew P; Grinham, James A; Cole, Charlotte G; Goward, Melanie E; Aguado, Begoña; Mallya, Meera; Mokrab, Younes; Huckle, Elizabeth J; Beare, David M; Dunham, Ian (2004). "En genomannoteringsdriven metod för att klona det mänskliga ORFeome" . Genombiologi . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
  11. ^    Eswaran, Jeyanthy; Cyanam, Dinesh; Mudvari, Prakriti; Reddy, Sirigiri Divijendra Natha; Pakala, Suresh B.; Nair, Sujit S.; Florea, Liliana; Fuqua, Suzanne AW; Godbole, Sucheta; Kumar, Rakesh (december 2012). "Transkriptomiskt landskap av bröstcancer genom mRNA-sekvensering" . Vetenskapliga rapporter . 2 (1): 264. Bibcode : 2012NatSR...2E.264E . doi : 10.1038/srep00264 . PMC 3278922 . PMID 22355776 .
  12. ^ "TMEM211 - Kompendium av normala vävnader." 81313044 - GEO-profiler - NCBI. (2021). https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geoprofiles/81313044
  13. ^ a b Anti-TMEM211-antikropp (HPA066784) - Atlas-antikroppar. https://www.atlasantibodies.com/products/antibodies/primary-antibodies/triple-a-polyclonals/tmem211-antibody-hpa066784/
  14. ^   Almagro Armenteros, José Juan; Sønderby, Casper Kaae; Sønderby, Søren Kaae; Nielsen, Henrik; Winther, Ole (1 november 2017). "DeepLoc: förutsägelse av protein subcellulär lokalisering med hjälp av djupinlärning" . Bioinformatik . 33 (21): 3387–3395. doi : 10.1093/bioinformatics/btx431 . PMID 29036616 .
  15. ^ a b c    Barrett, Tanya; Wilhite, Stephen E.; Ledoux, Pierre; Evangelista, Carlos; Kim, Irene F.; Tomashevsky, Maxim; Marshall, Kimberly A.; Phillippy, Katherine H.; Sherman, Patti M.; Holko, Michelle; Jefanov, Andrey; Lee, Hyeseung; Zhang, Naigong; Robertson, Cynthia L.; Serova, Nadezhda; Davis, Sean; Soboleva, Alexandra (26 november 2012). "NCBI GEO: arkiv för funktionella genomikdatauppsättningar - uppdatering" . Nukleinsyraforskning . 41 (D1): D991–D995. doi : 10.1093/nar/gks1193 . PMC 3531084 . PMID 23193258 .
  16. ^    Guardado-Mendoza, R; Jimenez-Ceja, L; Majluf-Cruz, A; Kamath, S; Fiorentino, TV; Casiraghi, F; Velazquez, AOC; DeFronzo, RA; Dick, E; Davalli, A; Folli, F (augusti 2013). "Inverkan av svårighetsgrad och varaktighet av fetma på bukspottkörtelns β- och α-celldynamik hos normoglykemiska icke-mänskliga primater" . International Journal of Obesity . 37 (8): 1071-1078. doi : 10.1038/ijo.2012.205 . PMC 3906680 . PMID 23229736 .
  17. ^    Linnemann, Amelia K.; Baan, Mieke; Davis, Dawn Belt (1 maj 2014). "Pankreatisk β-cellsproliferation vid fetma1,2" . Framsteg inom nutrition . 5 (3): 278–288. doi : 10.3945/an.113.005488 . PMC 4013180 . PMID 24829474 .
  18. ^    Kent, W. James (april 2002). "BLAT—Det BLAST-liknande inriktningsverktyget" . Genomforskning . 12 (4): 656–664. doi : 10.1101/gr.229202 . PMC 187518 . PMID 11932250 .
  19. ^ a b c    Hedges, S. Blair; Marin, Julie; Suleski, Michael; Paymer, Madeline; Kumar, Sudhir (april 2015). "Livets träd avslöjar klockliknande arter och diversifiering" . Molekylärbiologi och evolution . 32 (4): 835–845. doi : 10.1093/molbev/msv037 . PMC 4379413 . PMID 25739733 .
  20. ^ a b c d e f g h i    Altschul, Stephen F.; Gish, Warren; Miller, Webb; Myers, Eugene W.; Lipman, David J. (oktober 1990). "Grundläggande sökverktyg för lokal anpassning". Journal of Molecular Biology . 215 (3): 403–410. doi : 10.1016/S0022-2836(05)80360-2 . PMID 2231712 . S2CID 14441902 .
  21. ^ a b c d e f g h i    Madeira, Fábio; Park, Young mi; Lee, Joon; Buso, Nicola; Gur, Tamer; Madhusoodanan, Nandana; Basutkar, Prasad; Tivey, Adrian RN; Potter, Simon C; Finn, Robert D; Lopez, Rodrigo (2 juli 2019). "EMBL-EBI-sök- och sekvensanalysverktygens API:er under 2019" . Nukleinsyraforskning . 47 (W1): W636–W641. doi : 10.1093/nar/gkz268 . PMC 6602479 . PMID 30976793 .
  22. ^    Gasmi, Laila; Sieminska, Edyta; Okuno, Shohei; Ohta, Rie; Coutu, Cathy; Vatanparast, Mohammad; Harris, Stephanie; Baldwin, Doug; Hegedus, Dwayne D.; Theilmann, David A.; Kida, Aki; Kawabata, Mio; Sagawa, Shiori; Takatsuka, Jun; Tateishi, Ken; Watanabe, Kazuyo; Inoue, Maki N.; Kunimi, Yasuhisa; Kim, Yonggyun; Erlandson, Martin A.; Herrero, Salvador; Nakai, Madoka (30 juli 2021). "Horisontellt överförd parasitoid dödande faktor formar insektsförsvar mot parasitoider". Vetenskap . 373 (6554): 535–541. Bibcode : 2021Sci...373..535G . doi : 10.1126/science.abb6396 . PMID 34326235 . S2CID 236501934 .
  23. ^ a b   Oshimura, E.; Sakamoto, K. (2017). "Aminosyror, peptider och proteiner". Kosmetisk vetenskap och teknik . s. 285–303. doi : 10.1016/B978-0-12-802005-0.00019-7 . ISBN 978-0-12-802005-0 .
  24. ^    Dereeper, A.; Guignon, V.; Blanc, G.; Audic, S.; Buffet, S.; Chevenet, F.; Dufayard, J.-F.; Guindon, S.; Lefort, V.; Lescot, M.; Claverie, J.-M.; Gascuel, O. (19 maj 2008). "Phylogeny.fr: robust fylogenetisk analys för icke-specialisten" . Nukleinsyraforskning . 36 (webbserver): W465–W469. doi : 10.1093/nar/gkn180 . PMC 2447785 . PMID 18424797 .
  25. ^    Garcia-Boronat, M.; Diez-Rivero, CM; Reinherz, EL; Reche, PA (19 maj 2008). "PVS: en webbserver för analys av proteinsekvensvariabilitet anpassad för att underlätta upptäckt av konserverad epitop" . Nukleinsyraforskning . 36 (webbserver): W35–W41. doi : 10.1093/nar/gkn211 . PMC 2447719 . PMID 18442995 .
  26. ^    Tur, Katja; Kim, Dae-Kyum; Lambourne, Luke; Spirohn, Kerstin; Begg, Bridget E.; Bian, Wenting; Brignall, Ruth; Cafarelli, Tiziana; Campos-Laborie, Francisco J.; Charloteaux, Benoit; Choi, Dongsic; Coté, Atina G.; Daley, Meaghan; Deimling, Steven; Desbuleux, Alice; Dricot, Amélie; Gebbia, Marinella; Hardy, Madeleine F.; Kishore, Nishka; Knapp, Jennifer J.; Kovács, István A.; Lemmens, Irma; Mee, Miles W.; Mellor, Joseph C.; Pollis, Carl; Pons, Carles; Richardson, Aaron D.; Schlabach, Sadie; Teeking, Bridget; Yadav, Anupama; Babor, Mariana; Balcha, Dawit; Basha, Omer; Bowman-Colin, Christian; Haka, Suet-Feung; Choi, snart gäng; Colabella, Claudia; Coppin, Georges; D'Amata, Cassandra; De Ridder, David; De Rouck, Steffi; Duran-Frigola, Miquel; Ennajdaoui, Hanane; Goebels, Florian; Goehring, Liana; Gopal, Anjali; Haddad, Ghazal; Hatchi, Elodie; Helmy, Mohamed; Jacob, Yves; Kassa, Yoseph; Landini, Serena; Li, Roujia; van Lieshout, Natascha; MacWilliams, Andrew; Markey, Dylan; Paulson, Joseph N.; Rangarajan, Sudharshan; Rasla, John; Rayhan, Ashyad; Rolland, Thomas; San-Miguel, Adriana; Shen, Yun; Sheykhkarimli, Dayag; Sheynkman, Gloria M.; Simonovsky, Eyal; Taşan, Murat; Tejeda, Alexander; Tropepe, Vincent; Twizere, Jean-Claude; Wang, Yang; Weatheritt, Robert J.; Weile, Jochen; Xia, Yu; Yang, Xinping; Yeger-Lotem, Esti; Zhong, Quan; Aloy, Patrick; Bader, Gary D.; De Las Rivas, Javier; Gaudet, Suzanne; Hao, Tong; Rak, Janusz; Tavernier, Jan; Hill, David E.; Vidal, Marc; Roth, Frederick P.; Calderwood, Michael A. (16 april 2020). "En referenskarta över den humana binära proteininteraktomen" . Naturen . 580 (7803): 402–408. Bibcode : 2020Natur.580..402L . doi : 10.1038/s41586-020-2188-x . PMC 7169983 . PMID 32296183 .
  27. ^    Gaudet, P.; Livstone, MS; Lewis, SE; Thomas, PD (1 september 2011). "Fylogenetisk-baserad spridning av funktionella kommentarer inom Gene Ontology-konsortiet" . Genomgångar i bioinformatik . 12 (5): 449–462. doi : 10.1093/bib/bbr042 . PMC 3178059 . PMID 21873635 .
  28. ^    Kalay, Ersan; Li, Yun; Uzumcu, Abdullah; Uyguner, Oya; Collin, Rob W.; Caylan, Refik; Ulubil-Emiroglu, Melike; Kersten, Ferry FJ; Hafiz, Gunter; van Wijk, Erwin; Kayserili, Hulya; Rohmann, Edyta; Wagenstaller, Janine; Hoefsloot, Lies H.; Ström, Tim M.; Nürnberg, Gudrun; Baserer, Nermin; den Hollander, Anneke I.; Cremers, Frans PM; Cremers, Cor WRJ; Becker, Christian; Brunner, Han G.; Nürnberg, Peter; Karaguzel, Ahmet; Basaran, Seher; Kubisch, Christian; Kremer, Hannie; Wollnik, Bernd (juli 2006). "Mutationer i genen lipoma HMGIC fusion partner-like 5 (LHFPL5) orsakar autosomal recessiv icke-syndromisk hörselnedsättning". Mänsklig mutation . 27 (7): 633–639. doi : 10.1002/humu.20368 . PMID 16752389 . S2CID 39197978 .
  29. ^    Mansouri, Mahmoud Reza; Carlsson, Birgit; Davey, Edward; Nordenskjöld, Agneta; Wester, Tomas; Annerén, Göran; Läckgren, Göran; Dahl, Niklas (mars 2006). "Molekylärgenetisk analys av en de novo balanserad translokation t(6;17)(p21.31;q11.2) associerad med hypospadi och anorektal missbildning". Human Genetik . 119 (1–2): 162–168. doi : 10.1007/s00439-005-0122-9 . PMID 16395596 . S2CID 31515889 .
  30. ^    Huang, Chaoqun; Guo, Jinhu; Liu, Shen; Shan, Yuxi; Wu, Shiliang; Cai, Yongping; Yu, Long (januari 2004). "Isolering, vävnadsdistribution och prokaryot uttryck av en ny mänsklig X-länkad gen LHFPL1". DNA-sekvens . 15 (4): 299–302. doi : 10.1080/10425170412331279620 . PMID 15620218 . S2CID 22859348 .
  31. ^    Fagerberg, Linn; Hallström, Björn M.; Oksvold, Per; Kampf, Caroline; Djureinovic, Dijana; Odeberg, Jacob; Habuka, Masato; Tahmasebpoor, Simin; Danielsson, Angelika; Edlund, Karolina; Asplund, Anna; Sjöstedt, Evelina; Lundberg, Emma; Szigyarto, Cristina Al-Khalili; Skogs, Marie; Takanen, Jenny Ottosson; Berling, Holger; Tegel, Hanna; Mulder, Jan; Nilsson, Peter; Schwenk, Jochen M.; Lindskog, Cecilia; Danielsson, Frida; Mardinoglu, Adil; Sivertsson, Åsa; von Feilitzen, Kalle; Forsberg, Mattias; Zwahlen, Martin; Olsson, IngMarie; Navani, Sanjay; Huss, Mikael; Nielsen, Jens; Ponten, Fredrik; Uhlén, Mathias (februari 2014). "Analys av det mänskliga vävnadsspecifika uttrycket genom genomomfattande integration av transkriptomik och antikroppsbaserad proteomik" . Molekylär och cellulär proteomik . 13 (2): 397–406. doi : 10.1074/mcp.M113.035600 . PMC 3916642 . PMID 24309898 .
  32. ^ a b c d    Wang, Mingcong; Herrmann, Christina J.; Simonovic, Milano; Szklarczyk, Damian; Mering, Christian (september 2015). "Version 4.0 av PaxDb: Proteinöverflödsdata, integrerade över modellorganismer, vävnader och cellinjer" . Proteomik . 15 (18): 3163–3168. doi : 10.1002/pmic.201400441 . PMC 6680238 . PMID 25656970 .
  33. ^ a b Sammanfattning av TMEM211-proteinuttryck - den mänskliga proteinatlasen. (2021). Hämtad från https://www.proteinatlas.org/ENSG00000206069-TMEM211
  34. ^ a b Allen institut för hjärnvetenskap (2004). Allen hjärnatlas.
  35. ^ a b c d e Genomatix Software: Understanding Gene Regulation (RRID:SCR_008036)
  36. ^ a b    Rangwala, Sanjida H.; Kuznetsov, Anatoliy; Ananiev, Victor; Asztalos, Andrea; Borodin, Evgeny; Evgeniev, Vladislav; Joukov, Victor; Lotov, Vadim; Pannu, Ravinder; Rudnev, Dmitry; Shkeda, Andrew; Weitz, Eric M.; Schneider, Valerie A. (januari 2021). "Åtkomst till NCBI-data med hjälp av NCBI Sequence Viewer och Genome Data Viewer (GDV)" . Genomforskning . 31 (1): 159–169. doi : 10.1101/gr.266932.120 . PMC 7849379 . PMID 33239395 .
  37. ^    Pearson, William R. (juni 2013). "En introduktion till sekvenslikhet ('homologi') sökning" . Aktuella protokoll inom bioinformatik . 42 (1): 3.1.1–3.1.8. doi : 10.1002/0471250953.bi0301s42 . PMC 3820096 . PMID 23749753 .
  38. ^   Bettoun, David J.; Burris, Thomas P.; Houck, Keith A.; Buck, Donald W.; Stayrook, Keith R.; Khalifa, Berket; Lu, Jianfen; Chin, William W.; Nagpal, Sunil (1 november 2003). "Retinoid X-receptorn är en icke-silent viktig bidragsgivare till vitamin D-receptormedierad transkriptionsaktivering" . Molekylär endokrinologi . 17 (11): 2320–2328. doi : 10.1210/me.2003-0148 . PMID 12893883 .
  39. ^    Cheema, C; Grant, BF; Marcus, R (1 februari 1989). "Effekter av östrogen på cirkulerande 'fritt' och totalt 1,25-dihydroxivitamin D och på bisköldkörteln-vitamin D-axeln hos postmenopausala kvinnor. " Journal of Clinical Investigation . 83 (2): 537–542. doi : 10.1172/JCI113915 . PMC 303712 . PMID 2492309 .
  40. ^    Gilbert, Christopher R; Arum, Seth M; Smith, Cecilia M (2009). "D-vitaminbrist och kronisk lungsjukdom" . Canadian Respiratory Journal . 16 (3): 75–80. doi : 10.1155/2009/829130 . PMC 2706673 . PMID 19557213 .
  41. ^   Wang, Yubin; Han, Dawei; Ni, Chengpei; Zhou, Huiying; Wu, Shuyan; Xue, Zhimou; Zhou, Zhengyu (september 2016). "D-vitamin inducerar autofagi av bukspottkörtelns β-celler och ökar insulinutsöndringen" . Molekylärmedicinska rapporter . 14 (3): 2644–2650. doi : 10.3892/mmr.2016.5531 . PMID 27430408 ​​.
  42. ^    Wolden-Kirk, Heidi; Overbergh, Lut; Christesen, Henrik Thybo; Brusgaard, Klaus; Mathieu, Chantal (december 2011). "D-vitamin och diabetes: dess betydelse för betaceller och immunförsvar". Molekylär och cellulär endokrinologi . 347 (1–2): 106–120. doi : 10.1016/j.mce.2011.08.016 . PMID 21889571 . S2CID 26147600 .
  43. ^    Wang, Wei-Lin W; Chatterjee, Namita; Chittur, Sridar V; walesiska, JoEllen; Tenniswood, Martin P (december 2011). "Effekter av 1α,25-dihydroxivitamin D3 och testosteron på miRNA- och mRNA-uttryck i LNCaP-celler" . Molekylär cancer . 10 (1): 58. doi : 10.1186/1476-4598-10-58 . PMC 3112430 . PMID 21592394 .
  44. ^ a b    Zuker, M. (1 juli 2003). "Mfold webbserver för nukleinsyraveckning och hybridiseringsförutsägelse" . Nukleinsyraforskning . 31 (13): 3406–3415. doi : 10.1093/nar/gkg595 . PMC 169194 . PMID 12824337 .
  45. ^    Maeda, Ryu; Humör, Kathleen; Jones, Teri L; Aruga, Jun; Buchberg, Arthur M; Daar, Ira O (mars 2001). "Xmeis1, en protoonkogen involverad i att specificera neural crest cell öde i Xenopus embryon" . Onkogen . 20 (11): 1329–1342. doi : 10.1038/sj.onc.1204250 . PMID 11313877 . S2CID 20089168 .
  46. ^   Schulte, Eva C.; Winkelmann, Juliane (2015). "Klinisk fenotyp och genetik för Restless Legs Syndrome". Rörelsestörningar . s. 1145–1162. doi : 10.1016/B978-0-12-405195-9.00076-7 . ISBN 9780124051959 .
  47. ^    Salminen, Aaro V.; Garrett, Lillian; Schormair, Barbara; Rozman, Jan; Giesert, Florian; Niedermeier, Kristina M.; Becker, Lore; Rathkolb, Birgit; Rácz, Ildikó; Klingenspor, Martin; Klopstock, Thomas; Wolf, Eckhard; Zimmer, Andreas; Gailus-Durner, Valérie; Torres, Miguel; Fuchs, Helmut; de Angelis, Martin Hrabě; Wurst, Wolfgang; Hölter, Sabine M.; Winkelmann, Juliane (1 januari 2017). "Meis1 effekter på motoriska fenotyper och det sensorimotoriska systemet hos möss" . Sjukdomsmodeller och mekanismer . 10 (8): 981-991. doi : 10.1242/dmm.030080 . PMC 5560065 . PMID 28645892 .
  48. ^ a b   Junier, T.; Pagni, M. (1 februari 2000). "Dotlet: diagonala diagram i en webbläsare" . Bioinformatik . 16 (2): 178–179. doi : 10.1093/bioinformatics/16.2.178 . PMID 10842741 .
  49. ^    Loell, Kaiser; Nanda, Vikas (13 november 2018). "Marginell proteinstabilitet driver subcellulär proteoms isoelektriska punkt" . Proceedings of the National Academy of Sciences . 115 (46): 11778–11783. doi : 10.1073/pnas.1809098115 . PMC 6243250 . PMID 30385634 .
  50. ^    Kurotani, Atsushi; Tokmakov, Alexander A.; Sato, Ken-Ichi; Stefanov, Vasily E.; Yamada, Yutaka; Sakurai, Tetsuya (december 2019). "Lokaliseringsspecifika distributioner av protein pI i humant proteom styrs av lokalt pH och membranladdning" . BMC Molecular and Cell Biology . 20 (1): 36. doi : 10.1186/s12860-019-0221-4 . PMC 6701068 . PMID 31429701 .
  51. ^   Nakai, Kenta; Horton, Paul (januari 1999). "PSORT: ett program för att detektera sorteringssignaler i proteiner och förutsäga deras subcellulära lokalisering". Trender inom biokemiska vetenskaper . 24 (1): 34–35. doi : 10.1016/s0968-0004(98)01336-x . PMID 10087920 .
  52. ^    Blum, Matthias; Chang, Hsin-Yu; Chuguransky, Sara; Grego, Tiago; Kandasaamy, Swaathi; Mitchell, Alex; Nuka, Gåva; Paysan-Lafosse, Typhaine; Qureshi, Matloob; Raj, Shriya; Richardson, Lorna; Salazar, Gustavo A; Williams, Lowri; Bork, Peer; Bridge, Alan; Gough, Julian; Haft, Daniel H; Letunic, Ivica; Marchler-Bauer, Aron; Mi, Huaiyu; Natale, Darren A; Necci, Marco; Orengo, Christine A; Pandurangan, Arun P; Rivoire, Catherine; Sigrist, Christian JA; Sillitoe, Ian; Tack, Narmada; Thomas, Paul D; Tosatto, Silvio CE; Wu, Cathy H; Bateman, Alex; Finn, Robert D (8 januari 2021). "InterPro proteinfamiljer och domändatabasen: 20 år senare" . Nukleinsyraforskning . 49 (D1): D344–D354. doi : 10.1093/nar/gkaa977 . PMC 7778928 . PMID 33156333 .
  53. ^    Sigrist, Christian JA; de Castro, Edouard; Cerutti, Lorenzo; Cuche, Béatrice A.; Hulo, Nicolas; Bridge, Alan; Bougueleret, Lydie; Xenarios, Ioannis (17 november 2012). "Ny och pågående utveckling på PROSITE" . Nukleinsyraforskning . 41 (D1): D344–D347. doi : 10.1093/nar/gks1067 . PMC 3531220 . PMID 23161676 .
  54. ^    Pagni, M.; Ioannidis, V.; Cerutti, L.; Zahn-Zabal, M.; Jongeneel, CV; Hau, J.; Martin, O.; Kuznetsov, D.; Falquet, L. (8 maj 2007). "MyHits: förbättringar av en interaktiv resurs för att analysera proteinsekvenser" . Nukleinsyraforskning . 35 (webbserver): W433–W437. doi : 10.1093/nar/gkm352 . PMC 1933190 . PMID 17545200 .
  55. ^    Caldonazzo Garbelini, Jader M.; Kashiwabara, André Y.; Sanches, Danilo S. (december 2018). "Sekvensmotivsökare med memetisk algoritm" . BMC Bioinformatik . 19 (1): 4. doi : 10.1186/s12859-017-2005-1 . PMC 5751424 . PMID 29298679 .
  56. ^   Delorenzi, M.; Speed, T. (1 april 2002). "En HMM-modell för spolade domäner och en jämförelse med PSSM-baserade förutsägelser" . Bioinformatik . 18 (4): 617–625. doi : 10.1093/bioinformatics/18.4.617 . PMID 12016059 .
  57. ^   Monigatti, F.; Gasteiger, E.; Bairoch, A.; Jung, E. (1 maj 2002). "The Sulfinator: förutsäga tyrosinsulfateringsställen i proteinsekvenser" . Bioinformatik . 18 (5): 769–770. doi : 10.1093/bioinformatics/18.5.769 . PMID 12050077 .
  58. ^    Hornbeck, PV; Kornhauser, JM; Tkachev, S.; Zhang, B.; Skrzypek, E.; Murray, B.; Latham, V.; Sullivan, M. (1 januari 2012). "PhosphoSitePlus: en omfattande resurs för att undersöka strukturen och funktionen av experimentellt bestämda post-translationella modifieringar hos människa och mus" . Nukleinsyraforskning . 40 (D1): D261–D270. doi : 10.1093/nar/gkr1122 . PMC 3245126 . PMID 22135298 .
  59. ^    Zhao, Qi; Xie, Yubin; Zheng, Yueyuan; Jiang, Shuai; Liu, Wenzhong; Mu, Weiping; Liu, Zexian; Zhao, Yong; Xue, Yu; Ren, Jian (1 juli 2014). "GPS-SUMO: ett verktyg för förutsägelse av sumoyleringsplatser och SUMO-interaktionsmotiv" . Nukleinsyraforskning . 42 (W1): W325–W330. doi : 10.1093/nar/gku383 . PMC 4086084 . PMID 24880689 .
  60. ^   Gupta, R; Brunak, S (2002). "Förutsägelse av glykosylering över det mänskliga proteomet och korrelationen till proteinfunktion". Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing : 310–22. PMID 11928486 .
  61. ^    Steentoft, Catharina; Vakhrushev, Sergey Y; Joshi, Hiren J; Kong, Yun; Vester-Christensen, Malene B; Schjoldager, Katrine TB G; Lavrsen, Kirstine; Dabelsteen, Sally; Pedersen, Nis B; Marcos-Silva, Lara; Gupta, Ramneek; Paul Bennett, Eric; Mandel, Ulla; Brunak, Søren; Wandall, Hans H; Levery, Steven B; Clausen, Henrik (12 april 2013). "Precisionskartläggning av det mänskliga O-GalNAc-glykoproteomet genom SimpleCell-teknologi" . EMBO Journal . 32 (10): 1478–1488. doi : 10.1038/emboj.2013.79 . PMC 3655468 . PMID 23584533 .
  62. ^   Blom, Nikolaj; Gammeltoft, Steen; Brunak, Søren (december 1999). "Sekvens- och strukturbaserad förutsägelse av eukaryota proteinfosforyleringsställen". Journal of Molecular Biology . 294 (5): 1351–1362. doi : 10.1006/jmbi.1999.3310 . PMID 10600390 .
  63. ^    Ardito, Fatima; Giuliani, Michele; Perrone, Donatella; Troiano, Giuseppe; Muzio, Lorenzo Lo (augusti 2017). "Den avgörande rollen för proteinfosforylering i cellsignalering och dess användning som riktad terapi (Review)" . International Journal of Molecular Medicine . 40 (2): 271–280. doi : 10.3892/ijmm.2017.3036 . PMC 5500920 . PMID 28656226 .
  64. ^    Ferre, F.; Clote, P. (1 juli 2005). "DiANNA: en webbserver för förutsägelse av disulfidanslutning" . Nukleinsyraforskning . 33 (webbserver): W230–W232. doi : 10.1093/nar/gki412 . PMC 1160173 . PMID 15980459 .
  65. ^   Noordeen, Nafeesa A.; Carafoli, Federico; Hohenester, Erhard; Horton, Michael A.; Leitinger, Birgit (augusti 2006). "En transmembranleucindragkedja krävs för aktivering av den dimeriska receptorn tyrosinkinas DDR1" . Journal of Biological Chemistry . 281 (32): 22744–22751. doi : 10.1074/jbc.M603233200 . PMID 16774916 .
  66. ^   Patel, Neela; Herrman, Jean M.; Timans, Jackie C.; Kastelein, Robert A. (november 1996). "Funktionellt ersättning av cytokinreceptorextracellulära domäner med leucindragkedjor" . Journal of Biological Chemistry . 271 (48): 30386–30391. doi : 10.1074/jbc.271.48.30386 . PMID 8940001 .
  67. ^   Behncken, Stuart N.; Billestrup, Nils; Brown, Richard; Amstrup, Jan; Conway-Campbell, Becky; Waters, Michael J. (juni 2000). "Tillväxthormon (GH)-oberoende dimerisering av GH-receptorn med en leucin-dragkedja resulterar i konstitutiv aktivering" . Journal of Biological Chemistry . 275 (22): 17000–17007. doi : 10.1074/jbc.275.22.17000 . PMID 10828073 .
  68. ^ a b c    Wang, Jiyao; Youkharibache, Philippe; Zhang, Dachuan; Lanczycki, Christopher J; Geer, Renata C; Madej, Thomas; Phan, Lon; Ward, Minghong; Lu, Shennan; Marchler, Gabriele H; Wang, Yanli; Bryant, Stephen H; Geer, Lewis Y; Marchler-Bauer, Aron (1 januari 2020). "iCn3D, en webbaserad 3D-visare för att dela 1D/2D/3D-representationer av biomolekylära strukturer" . Bioinformatik . 36 (1): 131–135. doi : 10.1093/bioinformatics/btz502 . PMC 6956771 . PMID 31218344 .
  69. ^ a b c    Sherry, Stephen T.; Ward, Minghong; Sirotkin, Karl (1 augusti 1999). "dbSNP—Databas för enstaka nukleotidpolymorfier och andra klasser av mindre genetisk variation" . Genomforskning . 9 (8): 677–679. doi : 10.1101/gr.9.8.677 . PMID 10447503 . S2CID 10775908 .
  70. ^    Coppola, Antonietta; Moshé, Solomon L. (2012). "Djurmodeller". Epilepsi . Handbok i klinisk neurologi. Vol. 107. s. 63–98. doi : 10.1016/b978-0-444-52898-8.00004-5 . ISBN 978-0-444-52898-8 . PMID 22938964 .
  71. ^    Komatsu, Mitsuhisa; Takei, Masahiro; Ishii, Hiroaki; Sato, Yoshihiko (november 2013). "Glukosstimulerad insulinsekretion: ett nyare perspektiv" . Journal of Diabetes Investigation . 4 (6): 511–516. doi : 10.1111/jdi.12094 . PMC 4020243 . PMID 24843702 .
  72. ^    Du, Xing; Li, Yi; Xia, Yuan-Ling; Ai, Shi-Meng; Liang, Jing; Sang, Peng; Ji, Xing-Lai; Liu, Shu-Qun (26 januari 2016). "Insikter i protein-ligand-interaktioner: mekanismer, modeller och metoder" . International Journal of Molecular Sciences . 17 (2): 144. doi : 10.3390/ijms17020144 . PMC 4783878 . PMID 26821017 .
  73. ^   Patching, Simon G. (januari 2014). "Ytplasmonresonansspektroskopi för karakterisering av membranprotein-ligandinteraktioner och dess potential för läkemedelsupptäckt" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembraner . 1838 (1): 43–55. doi : 10.1016/j.bbamem.2013.04.028 . PMID 23665295 .
  74. ^    Maynard, Jennifer A. ; Lindquist, Nathan C.; Sutherland, Jamie N.; Lesuffleur, Antoine; Warrington, Arthur E.; Rodriguez, Moses; Åh, Sang-Hyun (november 2009). "Ytplasmonresonans för ligandscreening med hög genomströmning av membranbundna proteiner" . Bioteknologisk tidskrift . 4 (11): 1542–1558. doi : 10.1002/biot.200900195 . PMC 2790208 . PMID 19918786 .
  75. ^    Fu, Zhuo; Gilbert, Elizabeth R.; Liu, Dongmin (1 januari 2013). "Reglering av insulinsyntes och -sekretion och pankreatisk beta-cellsdysfunktion vid diabetes" . Aktuella diabetesrecensioner . 9 (1): 25–53. doi : 10.2174/157339913804143225 . PMC 3934755 . PMID 22974359 .
  76. ^    Kusakabe, Yuko; Shindo, Yumiko; Kawai, Takayuki; Maeda‐Yamamoto, Mari; Wada, Yuji (februari 2021). "Släktskap mellan svaret från den söta smakreceptorn, salivutsöndring mot sötningsmedel och sötmansintensitet" . Matvetenskap & Nutrition . 9 (2): 719–727. doi : 10.1002/fsn3.2036 . PMC 7866590 . PMID 33598157 .
  77. ^    Shen Yu-Chi; Jeyabalan, Anandhi K.; Wu, Karen L.; Hunker, Kristina L.; Kohrman, David C.; Thompson, Deborah L.; Liu, Dong; Barald, Kate F. (april 2008). "Genen för det transmembrana innerörat (tmie) bidrar till utveckling och funktion av vestibulära och laterala linjer hos zebrafisken (Danio rerio)" . Utvecklingsdynamik . 237 (4): 941–952. doi : 10.1002/dvdy.21486 . PMC 3082740 . PMID 18330929 .
  78. ^    Christie, Kevin W.; Eberl, Daniel F. (oktober 2014). "Bullerinducerad hörselnedsättning: nya djurmodeller" . Aktuell åsikt inom Otolaryngology & Head and Neck Surgery . 22 (5): 374–383. doi : 10.1097/MOO.00000000000000086 . PMC 4289668 . PMID 25111054 .
Hämtad från " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=TMEM211&oldid=1142820562 "