Under den engelska fotbollssäsongen 1903–04 tävlade Brentford i Southern League First Division. Trots att han ledde divisionen i september 1903 ledde störningar bakom kulisserna och avstängningen av managern Dick Molyneux för säsongens sista månad till en 13:e plats.
Direkt efter slutet av den svåra säsongen 1902–03 , beslutade Brentford -kommittén att agera och utse en förstalagschef. Dick Molyneux blev den första officiella managern i klubbens historia och anlände till York Road efter att ha tjänstgjort som manager i Everton i 12 år, med ett CV med ett fotbollsliga First Division- mästerskap och två andra FA -cupmedaljer. En av de första stora förändringarna som Molyneux genomförde var att begära att styrelsen skaffade pengar för att betala adekvata sommarlöner för spelartruppen, vilket skulle sätta stopp för tidigare säsongers misslyckanden, när styrelsen väntade till nästan innan säsongens början att överföra spelare till, för att minska lönerna under lågsäsong. På grund av att majoriteten av klubbarna genomförde sina transferaffärer strax efter säsongens slut, innebar taktiken att Brentford alltid hade ont om transferalternativ, när de gjorde affärer nära början av nästa säsong. Styrelsen samlade in £330 i donationer (motsvarande £37 700 2023) och Molyneux började bygga en 16-manna all-professionell trupp som kunde tävla i Southern League First Division. Av föregående säsongs trupp behölls endast målvakten Tommy Spicer , invändigt vänster Percy Turner och yttervänster Tosher Underwood och i början av juni 1903 hade Molyneux skrivit på en nästan helt ny XI. Brentfords färger ändrades för första gången sedan mitten av 1890-talet, med den gamla röd och blå ersattes av ett kit bestående av guldskjortor med blå ränder, vita shorts och svarta strumpor.
Dick Molyneuxs lag började säsongen starkt och nådde topplaceringen i förstadivisionen efter fem matcher. Kraven på den lilla truppen ledde till att Brentford föll tillbaka till mitten av tabellen och en målvaktskris som drabbades i början av 1904 förvärrade problemet. Molyneux tog in den tidigare försöksmannen John Bishop och betalade honom pengar för att spela, ett olagligt drag eftersom Bishop var en tjänstgörande soldat med Scots Guards och därför en amatörspelare. Efter sitt tredje framträdande återvände Bishop sent till barackerna, rapporterades till sin befälhavare och gjorde sedan ett skriftligt uttalande om sin inblandning i Brentford. Uttalandet skickades vidare till FA , som bötfällde Brentford med 25 pund och stängde av regissören Bill Dodge i två år och managern Molyneux för säsongens sista månad. Med sekreterare William Lewis som vaktmästare tog bina en poäng från de återstående fem matcherna av säsongen för att sluta på 13:e plats.
Ett klubbrekord sattes under säsongen:
Flest oavgjorda oavgjorda bortamatcher i Southern League under en säsong: 5
Källa: rsssf.com Regler för klassificering: Systemet med att använda målgenomsnitt för att skilja två lag med oavgjort poäng användes fram till säsongen 1976-77. Poängsystemet: 2 poäng för vinst, 1 poäng för oavgjort och 0 poäng för förlust.