Ruegeria

Ruegeria
Vetenskaplig klassificering
Domän:	Bakterie
Provins:	Pseudomonadota
Klass:	Alfaproteobakterier
Beställa:	Rhodobacterales
Familj:	Rhodobacteraceae
Släkte:	Ruegeria Uchino et al . 1999
Typart
Ruegeria atlantica (Rüger och Höfle 1992) Uchino et al . 1999
Art
Ruegeria arenilitoris Park och Yoon 2013 Ruegeria atlantica (Rüger och Höfle 1992) Uchino et al . 1999 Ruegeria conchae Lee et al . 2012 Ruegeria denitrificans Arahal et al . 2018 Ruegeria faecimaris Oh et al . 2011 " Ruegeria haliotis " Cao et al . 2021 Ruegeria halocynthiae Kim et al . 2012 Ruegeria intermedia Kämpfer et al . 2013 Ruegeria lacuscaerulensis (Petursdottir och Kristjansson 1999) Yi et al . 2007 Ruegeria litorea (Lucena et al . 2014) Wirth och Whitman 2018 Ruegeria marina Huo et al . 2011 Ruegeria marisrubri Zhang et al . 2017 Ruegeria mediterranea (Lucena et al . 2014) Wirth och Whitman 2018 Ruegeria meonggei Kim et al . 2014 Ruegeria meteori (Rüger och Höfle 1992) Hördt et al . 2020 Ruegeria pomeroyi (González et al . 2003) Yi et al . 2007 Ruegeria profundi Zhang et al . 2017 Ruegeria sediminis Baek et al . 2020
Synonymer
Silicibacter Petursdottir och Kristjansson 1999

Inom taxonomi är Ruegeria ett släkte av Rhodobacteraceae . Detta släkte var tidigare känt som den marina Agrobacterium innan de omklassificerades 1998. Det bär faktiskt namnet Hans-Jürgen Rüger, en tysk mikrobiolog, för hans bidrag till taxonomin för marina arter av Agrobacterium .

Egenskaper

Släktet kännetecknas av medlemmar som är:

• Gram-negativ (som alla proteobakterier)
• äggformade till stavformade celler 0,6–1,6 × 1,0–4,0 µm
• rörlig av polära flageller, eller icke-rörlig
• icke-sporebildare
• aerob
• oxidas och katalas positiva
• är oförmögna till fotosyntetisk tillväxt
• bakterioklorofyll a saknas
• major kinon är ubiquinone 10
• mol% G+C av DNA är 55–59
• medlem av familjen Rhodobacteraceae , som är fenotypiskt, metaboliskt, ekologiskt mångfaldig och definierad baserat på 16S-sekvensdata

Fylogenetiskt är det mycket nära släktet Silicibacter , men de två förblir separata arter på grund av fenotypiska skillnader - två arter för vilka detta är problematiskt är Ruegeria lacuscaerulensis och Ruegeria pomeroyi .

Två arter som har tagits bort från släktet är Marinovum algicola (Ruegeria algicola) och Thalassobius gelatinovorus (Ruegeria gelatinovora). ^{[och referenser däri]}

Små icke-kodande RNA

Mycket rikliga bakteriella små RNA har visat sig vara närvarande i bakterierna som utsätts för kronisk näringsbegränsning. I Ruegeria pomeroyi identifierade RNAseq-analys 99 förmodade sRNA. De bakteriella sRNA-regleringsmekanismerna är vanligtvis baserade på direkt RNA-RNA-interaktion med ett mål-mRNA. Målgengrupperna identifierade av Rivers et al. var gener involverade i transport, gener som förmedlar cell-cell-interaktioner, signaltransduktion och transkriptionsreglering.

Vidare läsning

Vetenskapliga tidskrifter

•   Martens T, Heidorn T, Pukall R, Simon M, Tindall BJ, Brinkhoff T (2006). "Omklassificering av Roseobacter gallaeciensis Ruiz-Ponte et al. 1998 som Phaeobacter gallaeciensis gen. nov., comb. nov., beskrivning av Phaeobacter inhibens sp. nov., antibiotikaproducerande medlemmar av Roseobacter-kladen, omklassificering av Ruegeria algi etcola (Laegeria algi etcola) al. 1995) Uchino et al. 1998 som Marinovum algicola gen. nov., comb. nov., och ändrade beskrivningar av släktena Roseobacter, Ruegeria och Leisingera" . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 56 (Pt 6): 1293–1304. doi : 10.1099/ijs.0.63724-0 . PMID 16738106 .

Vetenskapliga böcker

•   Garrity GM, Holt JG (2001). "Taxonomisk översikt av arkéerna och bakterierna" . I DR Boone, RW Castenholz (red.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria ( 2nd ed.). New York: Springer Verlag. s. 155–166 . ISBN 978-0-387-98771-2 .