Pseudonokardiaceae
| Pseudonocardiaceae | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | Bakterie |
| Provins: | Actinomycetota |
| Klass: | Actinomycetia |
| Beställa: |
Pseudonocardiales Labeda och Goodfellow 2015 |
| Familj: |
Pseudonocardiaceae Embley et al. 1989 |
| Genera | |
|
Se text. |
|
| Synonymer | |
|
|
Pseudonocardiaceae är en familj av bakterier i ordningen Actinomycetales och den enda medlemmen av underordningen Pseudonocardineae .
Genomik
Arterna inom familjen Pseudonocardiaceae bildar en distinkt kladd i fylogenetiska träd baserat på sammanlänkade proteinsekvenser. Dessutom Nakamurella multipartite , för närvarande en del av ordningen Frankiales , också en klad med Pseudonocardiaceae-arterna i 100 % av de fylogenetiska trädens bootstrap -replikationer. En bevarad signaturindel har identifierats som finns i N. multipartite och alla utom en av Pseudonocardiaceae-arterna. Denna en-aminosyrainsättning i UMP-kinas tjänar både till att tillhandahålla en molekylär markör för nästan alla Pseudonocardiaceae och antyder att N. multipartite är nära besläktad med denna grupp. Vissa bevis tyder också på att beställningarna Pseudonocardiales och Corynebacteriales är nära besläktade. Flera konserverade signaturindelar har identifierats som finns i både Pseudonocardiales och Corynebacteriales, inklusive en insättning av tre aminosyror i en konserverad region av UDP-galaktopyranosmutas . Denna insättning finns också i N. multipartite och Geodermatophilus obscurus , en annan medlem av Frankiales. Dessutom har fem konserverade signaturproteiner identifierats som endast finns i ordningarna Pseudonocardiales och Corynebacterialess. Homologer av proteinerna finns i allmänhet i N. multipartite och G. obscurus , vilket ger ytterligare bevis på att dessa två arter är nära besläktade med ordningarna Pseudonocardiales och Corynebacteriales.
Genera
Pseudonocardiaceae omfattar följande släkten:
- Actinoalloteichus Tamura et al. 2000
- Actinocrispum Hatano et al. 2016
- Actinokineospora Hasegawa 1988
- Actinomycetospora Jiang et al. 2008
- Actinophytocola Indananda et al. 2010
- Actinopolyspora Gochnauer et al. 1975 (Godkända listor 1980)
- Actinorectispora Quadri et al. 2016
- Actinosynnema Hasegawa et al. 1978 (Godkända listor 1980)
- Allokutzneria Labeda och Kroppenstedt 2008
- Allosaccharopolyspora Teo et al. 2021
- Amycolatopsis Lechevalier et al. 1986
- Bounagaea Meklat et al. 2015
- Crossiella Labeda 2001
- Gandjariella Ningsih et al. 2019
- Goodfellowiella Labeda et al. 2008
- Haloactinomyces Lai et al. 2017
- Haloechinothrix Tang et al. 2010
- Halopolyspora Lai et al. 2014
- Halosaccharopolyspora Teo et al. 2021
- Herbihabitans Zhang et al. 2016
- Kibdelosporangium Shearer et al. 1986
- Kutzneria Stackebrandt et al. 1994
- Labedaea Lee 2012
- Lentzea Yassin et al. 1995
- Longimycelium Xia et al. 2013
- Prauserella Kim och Goodfellow 1999
- Pseudonocardia Henssen 1957 (godkända listor 1980)
- Qaidamihabitans Tian et al. 2022
- Saccharomonospora Nonomura och Ohara 1971 (godkända listor 1980)
- Saccharopolyspora Lacey and Goodfellow 1975 (godkända listor 1980)
- Saccharothrix Labeda et al. 1984
- Salinifilum Moshtaghi Nikou et al. 2017
- Sciscionella Tian et al. 2009
- Solihabitans Jin et al. 2022
- Streptoalloteichus ( fd Tomita et al. 1978) Tomita et al. 1987
- Tamaricihabitans Qin et al. 2015
- Thermocrispum Korn-Wendisch et al. 1995
- Thermotunica Wu et al. 2014
- Umezawaea Labeda och Kroppenstedt 2007
Fylogeni
Den för närvarande accepterade taxonomin är baserad på listan över prokaryota namn med stående i nomenklaturen ( LPSN). Filogenin är baserad på analys av hela genomet.
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||