Pikromycin

Pikromycin
Pikromycin.svg
Namn
IUPAC namn
(3R , 5R , 6S , 7S , 9R , 11E , 13S , 14R ) -14-etyl-13-hydroxi-3,5,7,9,13-pentametyl-6-[3 ,4,6-trideoxi-3-(dimetylamino)-p- D - xylo - hexopyranosyloxi]-1-oxacyklotetradek-11-en-2,4,10-trion
Föredraget IUPAC-namn
(3R , 5R , 6S , 7S , 9R , 11E , 13S , 14R ) -6-{[(2S , 3R , 4S , 6R ) -4-(dimetylamino)- 3-hydroxi-6-metyloxan-2-yl]oxi}-14-etyl-13-hydroxi-3,5,7,9,13-pentametyl-1-oxacyklotetradek-11-en-2,4,10-trion
Andra namn
Pikromycin
Identifierare
3D-modell ( JSmol )
ChEBI
ChemSpider
UNII
  • InChI=1S/C28H47NO8/c1-10-22-28(7,34)12-11-21(30)15(2)13-16(3)25(18(5)23(31)19(6) 26(33)36-22)37-27-24(32)20(29(8)9)14-17(4)35-27/h11-12,15-20,22,24-25,27, 32,34H,10,13-14H2,1-9H3/b12-11+/t15-,16+,17-,18+,19-,20+,22-,24-,25+,27+,28 +/m1/s1  check Y
    Nyckel: UZQBOFAUUTZOQE-VSLWXVDYSA-N  check Y
  • InChI=1S/C28H47NO8/c1-10-22-28(7,34)12-11-21(30)15(2)13-16(3)25(18(5)23(31)19(6) 26(33)36-22)37-27-24(32)20(29(8)9)14-17(4)35-27/h11-12,15-20,22,24-25,27, 32,34H,10,13-14H2,1-9H3/b12-11+/t15-,16+,17-,18+,19-,20+,22-,24-,25+,27+,28 +/m1/s1
  • O=C2[C@H]([C@H](O[C@H]1O[C@H](C[C@H](N(C)C)[C@H] 10)C)[C@H](C)C[C@H](C(=O)/C=C/[C@@](O)(C)[C@H](OC(= O)[C@H]2C)CC)C)C
Egenskaper
C28H47NO8 _ _ _ _ _ _
Molar massa 525,683 g·mol -1
Om inte annat anges ges data för material i standardtillstånd (vid 25 °C [77 °F], 100 kPa).
☒  N ( vad är check☒ Y N ?)

Pikromycin studerades av Brokmann och Hekel 1951 och var den första antibiotikamakroliden som isolerades. Pikromycin syntetiseras genom ett typ I- polyketidsyntassystem i Streptomyces venezuelae , en art av grampositiva bakterier i släktet Streptomyces . Pikromycin härrör från narbonolid, en 14-ledad ringmakrolid. Tillsammans med narbonolidryggraden inkluderar pikromycin ett desosaminsocker och en hydroxylgrupp. Även om pikromycin inte är ett kliniskt användbart antibiotikum, kan det användas som ett råmaterial för att syntetisera antibiotiska ketolidföreningar såsom ertytromyciner och nya epotiloner .

Biosyntes

Pikromycinpolyketidsyntaset från Streptomyces venezuelae innehåller fyra polypeptider: PikAI, PikAII, PikAIII och PikAIV. Dessa polypeptider innehåller en laddningsmodul, sex förlängningsmolekyler och en tioesterasdomän som avslutade den biosyntetiska proceduren. Nyligen har elektronkryo-mikroskopi använts för att bestämma tredimensionella rekonstruktioner med subnanometerupplösning av en fullängds PKS-modul från bakterien Streptomyces venezuelae som avslöjade en oväntat annorlunda arkitektur. I figur 1 motsvarar varje cirkel ett PKS mutilifuctionellt protein, där ACP är acylbärarprotein , KS är keto-ACP-syntas, KSQ är en keto-ACP-syntasliknande domän, AT är acyltransferas, KR är keto-ACP-reduktas, KR med kors. är inaktivt KR, DH är hydroxyltioesterdehydratas, ER är enoylreduktas, TEI är tioesterasdomän I, TEII är typ II tioesteras. Des motsvarar de enzymer som används vid desosaminbiosyntes och överföring, som inkluderar DesI-DesVIII. [ citat behövs ]

Figur 2 representerar biosyntesvägen för desosamin-deoxiaminosocker. DesI-DesVI (des locus av pikromycin PKS) kodar för alla enzymer som behövs för att erhålla TDP-desoamin från TDP-glukos. DesVII- och DesVIII-aktiviteter överför desoamin till narbonolid och narbomycin erhålls. PikC cytokrom P450 hydrolas katalyserar hydroxyleringen av narbomycin för att erhålla pikromycin.

Figur 1: Domänorganisation av PKS för Narbonolide, en föregångare till Pikromycin
Figur 2: Pikromycinbildning genom biosyntesvägen för desosamin-deoxiaminosocker

Se även

  1. ^ Brockmann, H. & Henkel, W. (1951). "Pikromycin, ein bitter schmeckendes Antibioticum aus Actinomyceten". ntibiotica aus Actinomyceten . 84 : 184–288. doi : 10.1002/cber.19510840306 .
  2. ^ a b Y. Xue & D. Sherman (2001). "Biosyntes och kombinatorisk biosyntes av Pikromycin-relaterade makrolider i Streptomyces venezuelae". Metabolisk teknik . 3 :15–26. doi : 10.1006/mben.2000.0167 .
  3. ^   Maezawa, T. Hori, A. Kinumaki och M. Suzuki (1973). "Biologisk omvandling av narbonolid till pikromycin" . Journal of Antibiotics . 26 : 771-775. doi : 10.7164/antibiotika.26.771 . PMID 4792390 . {{ citera tidskrift }} : CS1 underhåll: flera namn: lista över författare ( länk )
  4. ^    JD Kittendorf & DH Sherman (2009). "The Metymycin/Pikromycin Biosynthetic Pathway: A Model for Metabolic Diversity in Natural Product" . Bioorg Med Chem . 17 : 2137–2146. doi : 10.1016/j.bmc.2008.10.082 . PMC 2843759 . PMID 19027305 .
  5. ^    S. Guptaa; V. Lakshmanan; BS Kima; R. Fecik & KA Reynolds (2008). "Generering av nya Pikromycin-antibiotikaprodukter genom Mutasyntes" . ChemBioChem . 10 : 1609–1616. doi : 10.1002/cbic.200700635 . PMC 2614871 . PMID 18512859 .
  6. ^    S. Dutta; JR Whicher; DA Hansen; WA Hale; JA Chemler; GR Congdon; ARH Narayan; K. Håkansson; DH Sherman; JL Smith; G. Skiniotis (2014). "Struktur av amodulärt polyketidsyntas" . Naturen . 510 : 512–517. doi : 10.1038/nature13423 . PMC 4278352 . PMID 24965652 .
  7. ^   DL Akey; JD Kittendorf; JW Giraldes; RA Fecik; DH Sherman & JL Smith (2006). "Strukturell grund för makrolaktonisering av pikromycintioesteraset". Naturens kemiska biologi . 2 : 537-542. doi : 10.1038/nchembio824 . PMID 16969372 .
Hämtad från " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Pikromycin&oldid=1143588592 "