PCrA
PcrA , som står för plasmid copy reducerad är en helikas som ursprungligen upptäcktes i en screening för kromosomalt kodade gener som påverkas i plasmidens rullande cirkelreplikation i den Gram-positiva patogenen Staphylococcus aureus .
Biologiska funktioner
Genetiska och biokemiska studier har visat att helikaset är väsentligt för replikering av plasmidens rullande cirkel och reparation av DNA-skador orsakade av exponering för ultraviolett strålning. Det katalyserar avvecklingen av dubbelsträngat plasmid-DNA som har hackats vid replikationsursprunget av replikationsinitieringsproteinet. Genetiska och biokemiska studier har också visat att helikaset spelar en viktig roll i cellöverlevnad genom att reglera nivåerna av RecA-medierad rekombination i grampositiva bakterier.
Biokemiska egenskaper
Helikaset är ett monomert translokas och använder ATP för att avveckla DNA. De föredragna substraten är enkelsträngat DNA innehållande 3'-överhäng. Processiviteten hos PcrA ökas i närvaro av plasmidreplikationsinitieringsprotein.
Kristallstruktur
Helikasens struktur har lösts med hög upplösning och indikerar "inchworming" som mekanismen för translokation på enkelsträngat DNA. En mexikansk vågmodell har föreslagits baserat på förändringarna i konformationen av helikasen som observerats i produkten kontra substratkomplexet.
Klassificering
PcrA tillhör SF1-superfamiljen av helikaser, som även inkluderar E. coli -helikaserna UvrD och Rep och den eukaryota helikasen Srs2.
Litteratur
- Iordanescu, S (okt 1993). "Karakterisering av Staphylococcus aureus kromosomal gen pcrA, identifierad av mutationer som påverkar plasmid pT181 replikation". Mol Gen Genet . 241 (1–2): 185–92. doi : 10.1007/BF00280216 . PMID 8232203 . S2CID 685186 .
- Petit, MA; Dervyn, E; Rose, M; Entian, KD; McGovern, S; Ehrlich, SD; Bruand, C (juli 1998). "PcrA är en viktig DNA-helikas av Bacillus subtilis som fyller funktioner både i reparation och replikering av rullande cirkel. " Mol Microbiol . 29 (1): 261–73. doi : 10.1046/j.1365-2958.1998.00927.x . PMID 9701819 . S2CID 39193812 .
- Petit, MA; Ehrlich, D (juni 2002). "Nödvändiga bakteriehelikaser som motverkar toxiciteten hos rekombinationsproteiner" . EMBO J . 21 (12): 3137–47. doi : 10.1093/emboj/cdf317 . PMC 126070 . PMID 12065426 .
- Chang, TL; Naqvi, A; Anand, SP; Kramer, MG; Munshi, R; Khan, SA (november 2002). "Biokemisk karakterisering av Staphylococcus aureus PcrA-helikas och dess roll i plasmidens rullande cirkelreplikation" . J Biol Chem . 277 (48): 45880–6. doi : 10.1074/jbc.m207383200 . PMID 12244110 .
- Anand, SP; Zheng, H; Bianco, PR; Leuba, SH; Khan, SA (juni 2007). "DNA-helikasaktivitet av PcrA krävs inte för ersättning av RecA-protein från DNA eller hämning av RecA-medierat strängbyte" . J Bacteriol . 189 (12): 4502–9. doi : 10.1128/jb.00376-07 . PMC 1913354 . PMID 17449621 .
- Soultanas, P; Dillingham, MS; Papadopoulos, F; Phillips, SE; Thomas, CD; Wigley, DB (mars 1999). "Plasmidreplikationsinitiatorprotein RepD ökar processiviteten hos PcrA DNA-helikas" . Nucleic Acids Res . 27 (6): 1421–8. doi : 10.1093/nar/27.6.1421 . PMC 148333 . PMID 10037801 .
- Velankar, SS; Soultanas, P; Dillingham, MS; Subramanya, HS; Wigley, DB (april 1999). "Kristallstrukturer av komplex av PcrA DNA-helikas med ett DNA-substrat indikerar en tummaskmekanism" . Cell . 97 (1): 75–84. doi : 10.1016/s0092-8674(00)80716-3 . PMID 10199404 .