FANCE

Ej att förväxla med Frankrike .

FANCE
Tillgängliga strukturer PDB Human UniProt-sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, FACE, FAE, Fanconi-anemikomplementeringsgrupp E, FA-komplementeringsgrupp E
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Fanconi-anemi, komplementgrupp E-protein är ett protein som hos människor kodas av FANCE -genen . Fanconi-anemikomplementeringsgruppen (FANC) inkluderar för närvarande FANCA , FANCB , FANCC , FANCD1 (även kallad BRCA2), FANCD2 , FANCE, FANCF , FANCG och FANCL . Fanconi-anemi är en genetiskt heterogen recessiv sjukdom som kännetecknas av cytogenetisk instabilitet, överkänslighet mot DNA-tvärbindningsmedel, ökat kromosombrott och defekt DNA-reparation. Medlemmarna i Fanconis anemikomplementeringsgrupp delar inte sekvenslikhet; de är besläktade genom sin sammansättning till ett gemensamt nukleärt proteinkomplex. Denna gen kodar för proteinet för komplementeringsgroufcrp E.

Ett nukleärt komplex som innehåller FANCE-protein (liksom FANCC , FANCF och FANCG ) är väsentligt för aktiveringen av FANCD2 -proteinet till den mono-ubiquitinerade isoformen. I normala, icke-mutanta celler mono-ubikineras FANCD2 som svar på DNA-skada. FANCE tillsammans med FANCC fungerar som substratadaptern för denna reaktion. Aktiverat FANCD2-protein samlokaliseras med BRCA1 (bröstcancerkänslighetsprotein) vid joniserande strålningsinducerade foci och i synaptonemala komplex av meiotiska kromosomer. Aktiverat FANCD2-protein kan fungera före initieringen av meiotisk rekombination , kanske för att förbereda kromosomer för synapser eller för att reglera efterföljande rekombinationshändelser.

Genexpression

FANCE uppges ha uttryckts i 151 organ med den högsta nivån i kvinnliga könskörtlar.

Kromosomalt läge

Genens placering är i 6p21.31, där p är den korta armen av kromosom 6 i position 21.31

Platsen på molekylär nivå är i baspar 35 452 339 till 35 467 106 på kromosom 6 (Homo sapiens Annotation Release 109, GRCh38.p12)

Proteinegenskaper

Huvudkomplexet av FA innehåller ett nukleärt multi-subenhetskomplex av särskilt 8 FA-proteiner. Detta lägger till en enda ubiquiterande kedja till FANCD2 efter DNA-skada eller duplikativt tryck.

För insamlingen av FANCC är FANCE viktig i kärnan och samlingen av kärnkomplexet. Några egenskaper hos FANCE är att den kan sätta sig själv med ubiquitinerade FANCD2, BRCA2 och konstruerade kärnhärdar. Dessutom, eftersom det är den enda medlemmen som visar direkt förening med FANCD2 och ger de nödvändiga länkarna mellan FA kärnkomplex och FANCD2.

Strukturen hos FANCE har en epitop på sin yta som har visat sig vara viktig för dess bindning med FANCD2. Förekomsten av återkommande spiralformade motiv var inte klart när analys av aminosyror gjordes.

Proteinstruktur

Den består av 13 α-helixar, 1 3 ₁₀ -helix och ingen β-sträng. Långformad, icke-klotformad form och 70 Å n storlek. Bredd 30 Å och tjocklek 20 Å. Proteinet viker sig kontinuerligt på högerhänt sätt från N- till C-terminal. Att identifiera det är lätt på grund av dess spiraler i slutet av C-änden.

Fungera

Det återställer DNA-tvärbindningar och behövs för nukleär ackumulering av FANCC, vilket ger en kritisk brygga mellan FA-komplex och FANCD2.

FANCE-bristade möss uppvisar ett minskat antal oocyter och störningar av profas I av meios , vilket indikerar att FANCE har en väsentlig roll i meios.

Ansökningar

• FANCE har sin tillämpning i Western Blot och IHC-P (Immunohistokemi) där den förutsagda molekylvikten var 58 kDa i Western blot och antigenåtervinning med citratbuffert pH6 gjordes innan IHC-P började.

• FANCE används också i Gene Mapping , här homozygosity mapping , där det fusioneras med 3 DNA-celler som hjälper till att beräkna känsligheten för kompositer av Mitomycin C, ett DNA-tvärbindningsmedel (Sigma). Den undersöker sedan också användningen av mikrosatellitmarkörer D6S422 och D6S1610, för länkning. Från detta är en kromosomregion på kromosom 6p lokaliserad för FANCE.
• Immunoblotting visade att FANCE-L348M och FANCE-E263K mutanter visade en uppdelning i kärnmembranet av FA-E EUFA409 LCL, vilket indikerar att oavsett om FANCE har förmodade nukleära lokaliseringssignaler, begränsar det primärt till kärnan.

Interaktioner

FANCE har visat sig interagera med:

• FANCA ,
• FANCD2 ,
• FANCF
• FANCG , och
• FANCC .

Vidare läsning

•    Wegner RD, Henrichs I, Joenje H, Schroeder-Kurth T (december 1996). "Fanconi-anemikomplementeringsgrupp E: kliniska och cytogenetiska data från den första patienten". Klinisk genetik . 50 (6): 479–82. doi : 10.1111/j.1399-0004.1996.tb02716.x . PMID 9147877 . S2CID 23242981 .
•    Joenje H, Oostra AB, Wijker M, di Summa FM, van Berkel CG, Rooimans MA, Ebell W, van Weel M, Pronk JC, Buchwald M, Arwert F (oktober 1997). "Bevis för minst åtta Fanconi-anemigener" . American Journal of Human Genetics . 61 (4): 940–4. doi : 10.1086/514881 . PMC 1715980 . PMID 9382107 .
•    Waisfisz Q, Saar K, Morgan NV, Altay C, Leegwater PA, de Winter JP, Komatsu K, Evans GR, Wegner RD, Reis A, Joenje H, Arwert F, Mathew CG, Pronk JC, Digweed M (maj 1999). "Fanconi anemi grupp E-genen, FANCE, mappar till kromosom 6p" . American Journal of Human Genetics . 64 (5): 1400–5. doi : 10.1086/302385 . PMC 1377877 . PMID 10205272 .
•   Medhurst AL, Huber PA, Waisfisz Q, de Winter JP, Mathew CG (februari 2001). "Direkta interaktioner mellan de fem kända Fanconi-anemiproteinerna tyder på en gemensam funktionell väg" . Human molekylär genetik . 10 (4): 423–9. doi : 10.1093/hmg/10.4.423 . PMID 11157805 .
•    Pace P, Johnson M, Tan WM, Mosedale G, Sng C, Hoatlin M, de Winter J, Joenje H, Gergely F, Patel KJ (juli 2002). "FANCE: kopplingen mellan Fanconi anemi komplex montering och aktivitet" . EMBO Journal . 21 (13): 3414–23. doi : 10.1093/emboj/cdf355 . PMC 125396 . PMID 12093742 .
•   Taniguchi T, D'Andrea AD (oktober 2002). "Fanconis anemiprotein, FANCE, främjar kärnansamlingen av FANCC" . Blod . 100 (7): 2457–62. doi : 10.1182/blood-2002-03-0860 . PMID 12239156 .
•   Gordon SM, Buchwald M (juli 2003). "Fanconi anemi proteinkomplex: kartläggning av proteininteraktioner i jäst 2- och 3-hybridsystemen" . Blod . 102 (1): 136–41. doi : 10.1182/blood-2002-11-3517 . PMID 12649160 .
•    Meetei AR, Sechi S, Wallisch M, Yang D, Young MK, Joenje H, Hoatlin ME, Wang W (maj 2003). "Ett multiprotein nukleärt komplex förbinder Fanconi-anemi och Blooms syndrom" . Molekylär och cellulär biologi . 23 (10): 3417–26. doi : 10.1128/MCB.23.10.3417-3426.2003 . PMC 164758 . PMID 12724401 .
•    Meetei AR, de Winter JP, Medhurst AL, Wallisch M, Waisfisz Q, van de Vrugt HJ, Oostra AB, Yan Z, Ling C, Bishop CE, Hoatlin ME, Joenje H, Wang W (oktober 2003). "Ett nytt ubiquitinligas är bristfälligt vid Fanconi-anemi". Naturgenetik . 35 (2): 165–70. doi : 10.1038/ng1241 . PMID 12973351 . S2CID 10149290 .
•   Hussain S, Wilson JB, Medhurst AL, Hejna J, Witt E, Ananth S, Davies A, Masson JY, Moses R, West SC, de Winter JP, Ashworth A, Jones NJ, Mathew CG (juni 2004). "Direkt interaktion av FANCD2 med BRCA2 i DNA-skada svarsvägar" . Human molekylär genetik . 13 (12): 1241–8. doi : 10.1093/hmg/ddh135 . PMID 15115758 .
•    Wang X, Andreassen PR, D'Andrea AD (juli 2004). "Funktionell interaktion av monoubikitinerad FANCD2 och BRCA2/FANCD1 i kromatin" . Molekylär och cellulär biologi . 24 (13): 5850–62. doi : 10.1128/MCB.24.13.5850-5862.2004 . PMC 480901 . PMID 15199141 .
•   Meetei AR, Levitus M, Xue Y, Medhurst AL, Zwaan M, Ling C, Rooimans MA, Bier P, Hoatlin M, Pals G, de Winter JP, Wang W, Joenje H (november 2004). "X-länkat arv av Fanconi-anemikomplementeringsgrupp B" . Naturgenetik . 36 (11): 1219–24. doi : 10.1038/ng1458 . PMID 15502827 .
•    Meetei AR, Medhurst AL, Ling C, Xue Y, Singh TR, Bier P, Steltenpool J, Stone S, Dokal I, Mathew CG, Hoatlin M, Joenje H, de Winter JP, Wang W (september 2005). "En mänsklig ortolog av arkealt DNA-reparationsprotein Hef är defekt i Fanconi-anemikomplementeringsgrupp M" . Naturgenetik . 37 (9): 958–63. doi : 10.1038/ng1626 . PMC 2704909 . PMID 16116422 .
•   Gordon SM, Alon N, Buchwald M (oktober 2005). "FANCC, FANCE och FANCD2 bildar ett ternärt komplex som är väsentligt för integriteten hos Fanconis anemi-DNA-skada-responsväg" . Journal of Biological Chemistry . 280 (43): 36118–25. doi : 10.1074/jbc.M507758200 . PMID 16127171 .

externa länkar

• Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : Q9HB96 (Fanconi anemi group E protein) vid PDBe-KB .