FANCF

FANCF
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, FAF, Fanconi-anemikomplementeringsgrupp F, FA-komplementeringsgrupp F
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Fanconi anemi grupp F-protein är ett protein som hos människor kodas av FANCF -genen .

Interaktioner

FANCF har visat sig interagera med Fanconi-anemi, komplementgrupp C , FANCG , FANCA och FANCE .

Fungera

FANCF är ett adapterprotein som spelar en nyckelroll i den korrekta sammansättningen av FA-kärnkomplexet. FA-kärnkomplexet är sammansatt av åtta proteiner (FANCA, -B, -C, -E, -F, -G, -L och -M). FANCF stabiliserar interaktionen mellan FANCC/FANCE-subkomplexet och FANCA/FANCG-subkomplexet och låser hela FA-kärnkomplexet i en konformation som är väsentlig för att utföra sin funktion vid DNA-reparation.

FA-kärnkomplexet är ett nukleärt kärnkomplex som är väsentligt för monoubiquitinering av FANCD2 och denna modifierade form av FANCD2 kolokaliseras med BRCA1, RAD51 och PCNA i foci som också innehåller andra DNA-reparationsproteiner. Alla dessa proteiner fungerar tillsammans för att underlätta reparation av DNA-tvärbindning mellan strängar. De fungerar också i andra reparationsprocesser för DNA-skador, inklusive återhämtning och stabilisering av replikationsgafflar som har stannat. FoxF1-protein interagerar också med FA-proteinkärnan och inducerar dess bindning till kromatin för att främja DNA-reparation.

Cancer

DNA-skador verkar vara den primära bakomliggande orsaken till cancer, och brister i uttrycket av DNA-reparationsgener verkar ligga bakom många former av cancer. Om DNA-reparationen är bristfällig, tenderar DNA-skador att ackumuleras. Sådan överflödig DNA-skada kan öka mutationer på grund av felbenägen translesionssyntes . Överdriven DNA-skada kan också öka epigenetiska förändringar på grund av fel under DNA-reparation. Sådana mutationer och epigenetiska förändringar kan ge upphov till cancer .

Minskning av uttrycket av DNA-reparationsgener (vanligtvis orsakat av epigenetiska förändringar) är mycket vanliga i cancer och är oftast mycket vanligare än mutationsdefekter i DNA-reparationsgener i cancer. (Se även Frekvenser av epimutationer i DNA-reparationsgener .)

Metylering av promotorregionen av FANCF- genen orsakar minskat uttryck av FANCF-protein.

Frekvenserna av FANCF- promotormetylering i flera olika cancerformer anges i tabellen.

Frekvens av FANCF- promotormetylering i sporadiska cancerformer

Cancer	Frekvens	Ref.
Epitelisk äggstockscancer	32 %
Livmoderhalscancer	30 %
Äggstockscancer	21%-28%
Skivepitelcancer i huvud och hals	15 %
Icke-småcellig lungcancer	14 %
Manlig könscellstumör	6 %

Vid invasiv bröstcancer ökade mikroRNA -210 (miR-210) tillsammans med minskat uttryck av FANCF, där FANCF var ett av de troliga målen för miR-210.

Även om mutationer i FANCF vanligtvis inte observeras i humana tumörer, var en musmodell med brist på FANCF benägen att drabbas av äggstockscancer.

FANCF verkar vara en av cirka 26 DNA-reparationsgener som är epigenetiskt undertryckta i olika cancerformer (se Cancer epigenetik ) .

Infertilitet

Könskörtlarna hos FANCF-muterade möss fungerar onormalt och har försämrad follikelutveckling och spermatogenes , vilket har observerats i andra Fanconi-anemi -musmodeller och hos Fanconi-anemipatienter . Histologisk undersökning av testiklarna från möss med FANCF-brist visade att seminiferösa tubuli saknade könsceller . Vid 14 veckors ålder saknade honmöss med FANCF-brist nästan eller helt saknade primordiala folliklar . Man drog slutsatsen att möss med brist på FANCF uppvisar en snabb utarmning av primordiala folliklar vid ung ålder, vilket resulterar i långt framskridet åldrande av äggstockarna .

Vidare läsning

•   Maruyama K, Sugano S (januari 1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
•   Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (oktober 1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
•    de Winter JP, Rooimans MA, van Der Weel L, van Berkel CG, Alon N, Bosnoyan-Collins L, de Groot J, Zhi Y, Waisfisz Q, Pronk JC, Arwert F, Mathew CG, Scheper RJ, Hoatlin ME, Buchwald M, Joenje H (januari 2000). "Fanconis anemi-gen FANCF kodar för ett nytt protein med homologi med ROM". Naturgenetik . 24 (1): 15–6. doi : 10.1038/71626 . PMID 10615118 . S2CID 26394122 .
•   de Winter JP, van der Weel L, de Groot J, Stone S, Waisfisz Q, Arwert F, Scheper RJ, Kruyt FA, Hoatlin ME, Joenje H (november 2000). "Fanconi-anemiproteinet FANCF bildar ett nukleärt komplex med FANCA, FANCC och FANCG" . Human molekylär genetik . 9 (18): 2665–74. doi : 10.1093/hmg/9.18.2665 . PMID 11063725 .
•   Medhurst AL, Huber PA, Waisfisz Q, de Winter JP, Mathew CG (februari 2001). "Direkta interaktioner mellan de fem kända Fanconi-anemiproteinerna tyder på en gemensam funktionell väg" . Human molekylär genetik . 10 (4): 423–9. doi : 10.1093/hmg/10.4.423 . PMID 11157805 .
•    Pace P, Johnson M, Tan WM, Mosedale G, Sng C, Hoatlin M, de Winter J, Joenje H, Gergely F, Patel KJ (juli 2002). "FANCE: kopplingen mellan Fanconi anemi komplex montering och aktivitet" . EMBO Journal . 21 (13): 3414–23. doi : 10.1093/emboj/cdf355 . PMC 125396 . PMID 12093742 .
•   Taniguchi T, D'Andrea AD (oktober 2002). "Fanconis anemiprotein, FANCE, främjar kärnansamlingen av FANCC" . Blod . 100 (7): 2457–62. doi : 10.1182/blood-2002-03-0860 . PMID 12239156 .
•   Gordon SM, Buchwald M (juli 2003). "Fanconi anemi proteinkomplex: kartläggning av proteininteraktioner i jäst 2- och 3-hybridsystemen". Blod . 102 (1): 136–41. doi : 10.1182/blood-2002-11-3517 . PMID 12649160 .
•    Meetei AR, Sechi S, Wallisch M, Yang D, Young MK, Joenje H, Hoatlin ME, Wang W (maj 2003). "Ett multiprotein nukleärt komplex förbinder Fanconi-anemi och Blooms syndrom" . Molekylär och cellulär biologi . 23 (10): 3417–26. doi : 10.1128/MCB.23.10.3417-3426.2003 . PMC 164758 . PMID 12724401 .
•    Meetei AR, de Winter JP, Medhurst AL, Wallisch M, Waisfisz Q, van de Vrugt HJ, Oostra AB, Yan Z, Ling C, Bishop CE, Hoatlin ME, Joenje H, Wang W (oktober 2003). "Ett nytt ubiquitinligas är bristfälligt vid Fanconi-anemi". Naturgenetik . 35 (2): 165–70. doi : 10.1038/ng1241 . PMID 12973351 . S2CID 10149290 .
•   Marsit CJ, Liu M, Nelson HH, Posner M, Suzuki M, Kelsey KT (januari 2004). "Inaktivering av Fanconi-anemi/BRCA-vägen i lungcancer och oral cancer: konsekvenser för behandling och överlevnad" . Onkogen . 23 (4): 1000–4. doi : 10.1038/sj.onc.1207256 . PMID 14647419 .
•    Tsutsumi S, Kamata N, Vokes TJ, Maruoka Y, Nakakuki K, Enomoto S, Omura K, Amagasa T, Nagayama M, Saito-Ohara F, Inazawa J, Moritani M, Yamaoka T, Inoue H, Itakura M (juni 2004) . "Den nya genen som kodar för ett förmodat transmembranprotein är muterad i gnathodiaphyseal dysplasia (GDD)" . American Journal of Human Genetics . 74 (6): 1255–61. doi : 10.1086/421527 . PMC 1182089 . PMID 15124103 .
•   Narayan G, Arias-Pulido H, Nandula SV, Basso K, Sugirtharaj DD, Vargas H, Mansukhani M, Villella J, Meyer L, Schneider A, Gissmann L, Dürst M, Pothuri B, Murty VV (maj 2004). "Promotor hypermetylering av FANCF: störning av Fanconi Anemia-BRCA-vägen i livmoderhalscancer" . Cancerforskning . 64 (9): 2994–7. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-04-0245 . PMID 15126331 .
•   Léveillé F, Blom E, Medhurst AL, Bier P, Laghmani el H, Johnson M, Rooimans MA, Sobeck A, Waisfisz Q, Arwert F, Patel KJ, Hoatlin ME, Joenje H, de Winter JP (september 2004). "Fanconis anemi-genprodukt FANCF är ett flexibelt adapterprotein" . Journal of Biological Chemistry . 279 (38): 39421–30. doi : 10.1074/jbc.M407034200 . PMID 15262960 .
•   Meetei AR, Levitus M, Xue Y, Medhurst AL, Zwaan M, Ling C, Rooimans MA, Bier P, Hoatlin M, Pals G, de Winter JP, Wang W, Joenje H (november 2004). "X-länkat arv av Fanconi-anemikomplementeringsgrupp B" . Naturgenetik . 36 (11): 1219–24. doi : 10.1038/ng1458 . PMID 15502827 .
•    Meetei AR, Medhurst AL, Ling C, Xue Y, Singh TR, Bier P, Steltenpool J, Stone S, Dokal I, Mathew CG, Hoatlin M, Joenje H, de Winter JP, Wang W (september 2005). "En mänsklig ortolog av arkealt DNA-reparationsprotein Hef är defekt i Fanconi-anemikomplementeringsgrupp M" . Naturgenetik . 37 (9): 958–63. doi : 10.1038/ng1626 . PMC 2704909 . PMID 16116422 .