Patellamid A
|
|
| Identifierare | |
|---|---|
|
3D-modell ( JSmol )
|
|
| ChemSpider | |
|
PubChem CID
|
|
|
CompTox Dashboard ( EPA )
|
|
|
|
|
|
| Egenskaper | |
| C35H50N8O6S2 _ _ _ _ _ _ _ _ _ | |
| Molar massa | 742,96 g·mol -1 |
|
Om inte annat anges ges data för material i standardtillstånd (vid 25 °C [77 °F], 100 kPa).
|
|
Patellamid A är en naturlig peptidprodukt producerad av Prochloron didemni , en cyanobakteriell symbiont av Lissoclinum patella , och isolerades först 1981. Patellamid A är en av många didemnidpeptider. Andra närbesläktade peptider inkluderar patellamider B, C och D och trunkamid. Patellamiderna och trunkamiden visar måttlig cytotoxicitet och aktivitet mot multidrug-resistenta cancercellinjer .
Historia
Patellamid A isolerades första gången 1981 från manteldjuret L. patella som samlats in från reven på Korror Island, Palau Islands. L. patella har varit en rik källa till naturliga peptidprodukter. Bortsett från patellamiderna, isolerades lissoclinamiderna, ulicyklamid, ulithiacyklamid och ascidiacyklamid alla från L. patella . Den absoluta stereokemin bestämdes senare genom röntgenkristallografi .
Biosyntes
Patellamid A kommer från en ribosomal peptid, vilket gör den till en medlem av RiPP -superfamiljen av naturliga produkter . Detta bestämdes efter att genomsekvensering av P. didemi visade en brist på icke-ribosomala peptidsyntetaser. Det biosyntetiska genklustret för patellamid A innehåller generna patA , patB , patC , patD , patE , patF och patG . Dessa gener, när de introduceras i E. coli , orsakar produktionen av patellamid A, vilket definitivt bekräftar deras ansvar för patellamid A-biosyntes. Genen patE kodar för prekursorpeptiden som innehåller de primära sekvenserna av patellamiderna A och C. Det har föreslagits av Schmidt et al. att denna prepatellamid heterocykliseras för att bilda oxazolin- och tiazolinringarna av PatD2. Det föreslås att PatG1 därefter är involverad i att oxidera tiazolinringarna till tiazolringarna som finns i patellamid A. Peptiden klyvs sedan, möjligen av PatA eller PatG2, och cykliseras, cykliseringen underlättas sannolikt av adenylering av PatD1, vilket bildar de två cykliska peptider, patellamider A och C. Även om alla aminosyror som används vid framställningen av patellamid A är L-aminosyror, är några av aminosyrorna som finns i naturlig patellamid A D-epimererna. Det föreslås att epimerisering av dessa aminosyror sker spontant. Detta bestämdes genom jämförelse med ett liknande system, lissoclinamide 7.
- ^ a b Irland, C.; Durso, A.; Newman, R.; Hacker, D. (1982). "Antineoplastiska cykliska peptider från den marina manteldjuret Lissoclinum patella". J. Org. Chem . 47 (10): 1807–1811. doi : 10.1021/jo00349a002 .
- ^ a b c d e Schmidt, E.; Nelson, J.; Rasko, D.; Sudek, S.; Eisen, J.; Haygood, M.; Ravel, J. (2005). "Patellamid a och C biosyntes genom en mikrocinliknande väg i Prochloron didemni, den cyanobakteriella symbionten av Lissoclinum patella" . Proc. Natl. Acad. Sci . 102 (20): 7315–7320. Bibcode : 2005PNAS..102.7315S . doi : 10.1073/pnas.0501424102 . PMC 1091749 . PMID 15883371 .
- ^ Degnan, B.; Hawkins, C.; Lavin, M.; Mccaffrey, E.; Parry, D.; Vandenbrenk, A.; Watters D. (1989). "Nya cykliska peptider med cytotoxisk aktivitet från ascidian Lissoclinum patella". J. Med. Chem . 32 (6): 1349–1354. doi : 10.1021/jm00126a034 . PMID 2724305 .
- ^ I, Y.; Doi, M.; Inoue, M.; Ishida, T. (1994). "Patellamid A, en cytotoxisk cyklisk peptid från ascidian Lissoclinum patella" . Acta Crystallogr . 50 (3): 432–434. doi : 10.1107/s010827019300811x . PMID 8018309 .
- ^ Milne, B.; Long, P.; Starcevic, A.; Hranueli, D.; Jaspars, M. (2006). "Spontanitet i patellamidens biosyntetiska väg". Org. Biomol. Chem . 4 (4): 631–638. CiteSeerX 10.1.1.1027.4259 . doi : 10.1039/b515938e . PMID 16467937 .