PTPRF

PTPRF
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortolog sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, LAR, BNAH2, proteintyrosinfosfatas, receptortyp F, proteintyrosinfosfatasreceptortyp F
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ; ; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Receptortyp tyrosin-protein fosfatas F är ett enzym som hos människor kodas av PTPRF -genen .

Proteinet som kodas av denna gen är en medlem av familjen proteintyrosinfosfatas (PTP). PTP är kända för att vara signalmolekyler som reglerar en mängd cellulära processer inklusive celltillväxt , differentiering, mitotisk cykel och onkogen transformation. Denna PTP har en extracellulär region, en enkel transmembranregion och två tandem intracytoplasmatiska katalytiska domäner, och representerar således en PTP av receptortyp. Den extracellulära regionen innehåller tre Ig-liknande domäner och nio icke-Ig-liknande domäner som liknar den för neurala celladhesionsmolekyler . Denna PTP visade sig fungera i regleringen av epitelcell-cell-kontakter vid adherens-korsningar , såväl som vid kontroll av beta-catenin- signalering. En ökad expressionsnivå av detta protein hittades i den insulinkänsliga vävnaden hos överviktiga, insulinresistenta individer och kan bidra till patogenesen av insulinresistens . Två alternativt splitsade transkriptvarianter av denna gen, som kodar för distinkta proteiner, har rapporterats.

Interaktioner

PTPRF har visats interagera med Beta-catenin och liprin-alfa-1 .

Vidare läsning

Chernoff J (1999). "Proteintyrosinfosfataser som negativa regulatorer av mitogen signalering". J. Cell. Physiol . 180 (2): 173–81. doi : 10.1002/(SICI)1097-4652(199908)180:2<173::AID-JCP5>3.0.CO;2-Y . PMID 10395287 . S2CID 24952421 .
Hashimoto N, Feener EP, Zhang WR, Goldstein BJ (1992). "Insulinreceptorprotein-tyrosinfosfataser. Leukocyt-vanligt antigenrelaterat fosfatas deaktiverar snabbt insulinreceptorkinaset genom preferentiell defosforylering av receptorns regleringsdomän" . J. Biol. Chem . 267 (20): 13811–4. doi : 10.1016/S0021-9258(19)49639-7 . PMID 1321126 .
Jirik FR, Harder KW, Melhado IG, Anderson LL, Duncan AM (1993). "Genen för leukocytantigenrelaterat tyrosinfosfatas (LAR) är lokaliserad till human kromosom 1p32, en region som ofta raderas i tumörer av neuroektodermalt ursprung". Cytogenet. Cell Genet . 61 (4): 266–8. doi : 10.1159/000133418 . PMID 1486801 .
Streuli M, Krueger NX, Thai T, Tang M, Saito H (1990). "Särskilda funktionella roller för de två intracellulära fosfatasliknande domänerna av de receptorkopplade proteintyrosinfosfataserna LCA och LAR" . EMBO J . 9 (8): 2399-407. doi : 10.1002/j.1460-2075.1990.tb07415.x . PMC 552264 . PMID 1695146 .
Streuli M, Krueger NX, Tsai AY, Saito H (1989). "En familj av receptorkopplade proteintyrosinfosfataser hos människor och Drosophila" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 86 (22): 8698–702. Bibcode : 1989PNAS...86.8698S . doi : 10.1073/pnas.86.22.8698 . PMC 298355 . PMID 2554325 .
Streuli M, Krueger NX, Hall LR, Schlossman SF, Saito H (1988). "En ny medlem av immunglobulinsuperfamiljen som har en cytoplasmatisk region som är homolog med leukocytantigenet. " J. Exp. Med . 168 (5): 1523–30. doi : 10.1084/jem.168.5.1523 . PMC 2189122 . PMID 2972792 .
Schaapveld RQ, van den Maagdenberg AM, Schepens JT, Weghuis DO, Geurts van Kessel A, Wieringa B, Hendriks WJ (1995). "Musgenen Ptprf som kodar för leukocytens vanliga antigenrelaterade molekyl LAR: kloning, karakterisering och kromosomal lokalisering". Genomik . 27 (1): 124–30. doi : 10.1006/geno.1995.1014 . hdl : 2066/21329 . PMID 7665159 .
Serra-Pagès C, Kedersha NL, Fazikas L, Medley Q, Debant A, Streuli M (1995). "LAR-transmembranproteinet tyrosinfosfatas och ett coiled-coil LAR-interagerande protein samlokaliserar vid fokala vidhäftningar" . EMBO J . 14 (12): 2827–38. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07282.x . PMC 398401 . PMID 7796809 .
O'Grady P, Krueger NX, Streuli M, Saito H (1994). "Genomisk organisation av den humana LAR-proteintyrosinfosfatasgenen och alternativ splitsning i de extracellulära fibronektin-typ-III-domänerna" . J. Biol. Chem . 269 (40): 25193–9. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31516-8 . PMID 7929208 .
Pulido R, Serra-Pagès C, Tang M, Streuli M (1996). "LAR/PTP delta/PTP-sigma-underfamiljen av transmembranprotein-tyrosin-fosfataser: multipla humana LAR-, PTP-delta- och PTP-sigma-isoformer uttrycks på ett vävnadsspecifikt sätt och associeras med det LAR-interagerande proteinet LIP.1" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (25): 11686–90. Bibcode : 1995PNAS...9211686P . doi : 10.1073/pnas.92.25.11686 . PMC 40467 . PMID 8524829 .
Liu X, Vega QC, Decker RA, Pandey A, Worby CA, Dixon JE (1996). "Onkogena RET-receptorer visar olika autofosforyleringsställen och substratbindningsspecificiteter" . J. Biol. Chem . 271 (10): 5309–12. doi : 10.1074/jbc.271.10.5309 . PMID 8621380 .
Debant A, Serra-Pagès C, Seipel K, O'Brien S, Tang M, Park SH, Streuli M (1996). "Multidomänproteinet Trio binder LAR-transmembranet tyrosinfosfatas, innehåller en proteinkinasdomän och har separata rac-specifika och rho-specifika guanin-nukleotidutbytesfaktordomäner. " Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (11): 5466–71. Bibcode : 1996PNAS...93.5466D . doi : 10.1073/pnas.93.11.5466 . PMC 39269 . PMID 8643598 .
Zhang WR, Li PM, Oswald MA, Goldstein BJ (1996). "Modulation av insulinsignaltransduktion genom eutopiskt överuttryck av proteintyrosinfosfatas LAR av receptortyp. " Mol. Endokrinol . 10 (5): 575–84. doi : 10.1210/mend.10.5.8732688 . PMID 8732688 . S2CID 42128485 .
Tabiti K, Cui L, Chhatwal VJ, Moochhala S, Ngoi SS, Pallen CJ (1996). "Ny alternativ splitsning förutsäger en utsöndrad extracellulär isoform av det humana receptorliknande proteinet tyrosinfosfatas LAR". Gene . 175 (1–2): 7–13. doi : 10.1016/0378-1119(96)00113-8 . PMID 8917069 .
Ahmad F, Goldstein BJ (1997). "Funktionell association mellan insulinreceptorn och transmembranproteinet-tyrosinfosfatas LAR i intakta celler" . J. Biol. Chem . 272 (1): 448–57. doi : 10.1074/jbc.272.1.448 . PMID 8995282 .
Aicher B, Lerch MM, Muller T, Schilling J, Ullrich A (1997). "Cellulär omfördelning av proteintyrosinfosfataser LAR och PTPσ genom inducerbar proteolytisk bearbetning" . J. Cell Biol . 138 (3): 681–96. doi : 10.1083/jcb.138.3.681 . PMC 2141638 . PMID 9245795 .
Serra-Pagès C, Medley QG, Tang M, Hart A, Streuli M (1998). "Liprins, en familj av LAR-transmembranprotein-tyrosinfosfatas-interagerande proteiner" . J. Biol. Chem . 273 (25): 15611–20. doi : 10.1074/jbc.273.25.15611 . PMID 9624153 .
O'Grady P, Thai TC, Saito H (1998). "Laminin-Nidogen-komplexet är en ligand för en specifik splitsningsisoform av det transmembrana proteinet tyrosinfosfatas LAR" . J. Cell Biol . 141 (7): 1675–84. doi : 10.1083/jcb.141.7.1675 . PMC 2133008 . PMID 9647658 .
Chiplunkar S, Chamblis K, Chwa M, Rosenberg S, Kenney MC, Brown DJ (1999). "Förbättrat uttryck av ett transmembranfosfotyrosinfosfatas (LAR) i keratokonuskulturer och hornhinnor". Exp. Eye Res . 68 (3): 283–93. doi : 10.1006/exer.1998.0604 . PMID 10079136 .