PTPN13

PTPN13
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, FAP-1, PNP1, PTP-BAS, PTP-BL, PTP1E, PTPL1, PTPLE, hPTP1E, proteintyrosinfosfatas, icke-receptortyp 13, proteintyrosinfosfatas icke-receptortyp 13 Externa ID:
n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Tyrosin-protein fosfatas icke-receptor typ 13 är ett enzym som hos människor kodas av PTPN13 -genen .

Proteinet som kodas av denna gen är en medlem av familjen proteintyrosinfosfatas (PTP). PTP är kända för att vara signalmolekyler som reglerar en mängd olika cellulära processer inklusive celltillväxt , differentiering , mitotisk cykel och onkogen transformation. Detta PTP är ett stort protein som har en PTP-domän vid C-terminalen och flera icke-katalytiska domäner, som inkluderar en domän med likhet med band 4.1 superfamilj av cytoskelettassocierade proteiner , en region bestående av fem PDZ-domäner och ett leucinblixtlåsmotiv . Denna PTP visade sig interagera med och defosforylera Fas-receptorn , såväl som IkappaBalpha genom PDZ-domänerna, vilket antydde dess roll i Fas-medierad programmerad celldöd. Denna PTP visades också interagera med GTPas-aktiverande protein och kan således fungera som en regulator av Rho- signalvägen. Fyra alternativt splitsade transkriptvarianter, som kodar för distinkta proteiner, har rapporterats.

Interaktioner

PTPN13 har visats interagera med PKN2 .

Vidare läsning

•   Sato T, Irie S, Kitada S, Reed JC (1995). "FAP-1: ett proteintyrosinfosfatas som associerar med Fas". Vetenskap . 268 (5209): 411–415. Bibcode : 1995Sci...268..411S . doi : 10.1126/science.7536343 . PMID 7536343 .
•   Saras J, Claesson-Welsh L, Heldin CH, Gonez LJ (1994). "Klonning och karakterisering av PTPL1, ett proteintyrosinfosfatas med likheter med cytoskelettassocierade proteiner" . J. Biol. Chem . 269 ​​(39): 24082–9. doi : 10.1016/S0021-9258(19)51050-X . PMID 7929060 .
•   Banville D, Ahmad S, Stocco R, Shen SH (1994). "Ett nytt protein-tyrosinfosfatas med homologi till både cytoskelettproteinerna i band 4.1-familjen och junction-associerade guanylatkinaser" . J. Biol. Chem . 269 ​​(35): 22320–7. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31792-1 . PMID 8071359 .
•   Inazawa J, Ariyama T, Abe T, et al. (1997). "PTPN13, ett fas-associerat proteintyrosinfosfatas, är beläget på den långa armen av kromosom 4 vid band q21.3". Genomik . 31 (2): 240–242. doi : 10.1006/geno.1996.0039 . PMID 8824809 .
•   Yanagisawa J, Takahashi M, Kanki H, et al. (1997). "Den molekylära interaktionen mellan Fas och FAP-1. En tripeptidblockerare av human Fas-interaktion med FAP-1 främjar Fas-inducerad apoptos" . J. Biol. Chem . 272 (13): 8539–8545. doi : 10.1074/jbc.272.13.8539 . PMID 9079683 .
•   Saras J, Engström U, Góñez LJ, Heldin CH (1997). "Karakterisering av interaktionerna mellan PDZ-domäner av protein-tyrosinfosfataset PTPL1 och den karboxylterminala svansen av Fas" . J. Biol. Chem . 272 (34): 20979–20981. doi : 10.1074/jbc.272.34.20979 . PMID 9261095 .
•   Saras J, Franzén P, Aspenström P, et al. (1997). "Ett nytt GTPase-aktiverande protein för Rho interagerar med en PDZ-domän av protein-tyrosinfosfataset PTPL1" . J. Biol. Chem . 272 (39): 24333–24338. doi : 10.1074/jbc.272.39.24333 . PMID 9305890 .
•    Ekiel I, Banville D, Shen SH, et al. (1999). "Huvudkedjesignaltilldelning för PDZ2-domänen från humant proteintyrosinfosfatas hPTP1E och dess komplex med en C-terminal peptid från Fas-receptorn". J. Biomol. NMR . 12 (3): 455–456. doi : 10.1023/A:1008267807859 . PMID 9835052 . S2CID 19976473 .
•    Maekawa K, Imagawa N, Naito A, et al. (1999). "Associering av protein-tyrosinfosfatas PTP-BAS med det transkriptionsfaktorhämmande proteinet IkappaBalpha genom interaktion mellan PDZ1-domänen och ankyrinupprepningar" . Biochem. J . 337 (2): 179–84. doi : 10.1042/0264-6021:3370179 . PMC 1219950 . PMID 9882613 .
•   Lin D, Gish GD, Songyang Z, Pawson T (1999). "Karboxylterminalen av B klass efriner utgör ett PDZ-domänbindande motiv" . J. Biol. Chem . 274 (6): 3726–3733. doi : 10.1074/jbc.274.6.3726 . PMID 9920925 .
•   Murthy KK, Clark K, Fortin Y, et al. (1999). "ZRP-1, ett zyxinrelaterat protein, interagerar med den andra PDZ-domänen av det cytosoliska proteinet tyrosinfosfatas hPTP1E" . J. Biol. Chem . 274 (29): 20679–20687. doi : 10.1074/jbc.274.29.20679 . PMID 10400701 .
•    Cuppen E, van Ham M, Pepers B, et al. (1999). "Identifiering och molekylär karakterisering av BP75, ett nytt bromodomäninnehållande protein" . FEBS Lett . 459 (3): 291–298. doi : 10.1016/S0014-5793(99)01191-6 . PMID 10526152 . S2CID 41216030 .
•    Irie S, Hachiya T, Rabizadeh S, et al. (1999). "Funktionell interaktion av Fas-associerat fosfatas-1 (FAP-1) med p75(NTR) och deras effekt på NF-kappaB-aktivering" . FEBS Lett . 460 (2): 191–198. doi : 10.1016/S0014-5793(99)01324-1 . PMID 10544233 . S2CID 25143664 .
•    Lee SH, Shin MS, Park WS, et al. (2000). "Immunohistokemisk lokalisering av FAP-1, en hämmare av Fas-medierad apoptos, i normala och neoplastiska mänskliga vävnader". APMIS . 107 (12): 1101–1108. doi : 10.1111/j.1699-0463.1999.tb01515.x . PMID 10660140 . S2CID 24672576 .
•   Kozlov G, Gehring K, Ekiel I (2000). "Lösningsstruktur för PDZ2-domänen från humant fosfatas hPTP1E och dess interaktioner med C-terminala peptider från Fas-receptorn". Biokemi . 39 (10): 2572–2580. doi : 10.1021/bi991913c . PMID 10704206 .
•   Cuppen E, van Ham M, Wansink DG, et al. (2000). "Det zyxinrelaterade proteinet TRIP6 interagerar med PDZ-motiv i adapterproteinet RIL och proteinet tyrosinfosfatas PTP-BL". Eur. J. Cell Biol . 79 (4): 283–293. doi : 10.1078/S0171-9335(04)70031-X . PMID 10826496 .
•   Erdmann KS, Kuhlmann J, Lessmann V, et al. (2000). "Adenomatous Polyposis Coli-proteinet (APC) interagerar med proteinet tyrosinfosfatas PTP-BL via en alternativt splitsad PDZ-domän" . Onkogen . 19 (34): 3894–3901. doi : 10.1038/sj.onc.1203725 . PMID 10951583 .
•   Nakai Y, Irie S, Sato TA (2001). "Identifiering av IkappaBalpha som ett substrat för Fas-associerat fosfatas-1". Eur. J. Biochem . 267 (24): 7170–7175. doi : 10.1046/j.1432-1327.2000.01818.x . PMID 11106428 .
•    Gross C, Heumann R, Erdmann KS (2001). "Det proteinkinas C-relaterade kinaset PRK2 interagerar med proteinet tyrosinfosfatas PTP-BL via ett nytt PDZ-domänbindande motiv" . FEBS Lett . 496 (2–3): 101–104. doi : 10.1016/S0014-5793(01)02401-2 . PMID 11356191 . S2CID 205880882 .