PCM1
| PCM1- | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , PTC4, RET/PCM-1, pericentriolärt material 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Externa ID:n | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pericentriolärt material 1 , även känt som PCM1 , är ett protein som hos människor kodas av PCM1 -genen .
Fungera
PCM1-proteinet identifierades ursprungligen på grund av dess distinkta cellcykelberoende association med centrosomkomplexet och mikrotubuli . Proteinet verkar associera med centrosomkomplexet under cellcykeln. Dissociation inträffar under mitos när PCM1 är dispergerat i hela cellen. Immunmärkningsstudier som utfördes fann att PCM1 var närvarande i centriolära satelliter och i elektrontäta granuler mellan 70 och 100 nm i diameter. Dessa ansågs ursprungligen vara utspridda bara runt centrosomerna, men ytterligare studier visade att PCM1 också hittades i hela cytoplasman.
PCM1 visade sig vara avgörande för celldelning eftersom PCM1-antikroppar orsakar cellcykelstopp när de mikroinjiceras i befruktade murina ägg. Inriktning av centrin , pericentrin och ninein minskade också dramatiskt efter PCM1-utarmning med siRNA, överuttryck av PCM1-deletionsmutanter och PCM1-antikroppsmikroinjektion. Som ett resultat av denna utarmning visade sig den radiella organisationen av mikrotubulierna vara avbruten, men verkade inte påverka mikrotubulus kärnbildning.
Genstruktur
PCM1 har fyra kända transkript, varav den längsta har 39 exoner. Den öppna läsramen för PCM1 kodar för ett protein med 2024 aminosyror. Proteinet innehåller lindade spiralregioner mellan områden med låg komplexitet samt en adenosintrifosfat ( ATP ) / GTPas- domän, en nukleär lokaliseringsdomän och en eukaryotisk molybdopterin-domän. Den eukaryota molybdopterinbindande domänen finns för närvarande endast i fem andra mänskliga gener, xantindehydrogenas , sulfitoxidas (mitokondriell prekursor), aldehydoxidas , erytropoietinreceptorprekursor och ATPbindande kassett, underfamilj A, medlem 2 ( ABCA2 ).
Vävnadsfördelning
PCM1 mRNA-uttryck i mushjärnan har visat sig vara högst i hippocampus . Hos människor uttrycks det över mediannivån för uttryck i centrala nervsystemet (CNS) i de flesta delar av hjärnan.
Klinisk signifikans
Mutationer i PCM1 -genen har visat sig orsaka genetisk mottaglighet för schizofreni . Om en isoleucinaminosyraförändring i PCM1 ärvs, visade sig risken för att utveckla schizofreni vara 68 % i två oberoende prover från södra England och Skottland. Det innebär att det nu kan vara möjligt att erbjuda mycket begränsad genetisk rådgivning till en liten del av personer med schizofreni som också är bärare av denna mutation.
PCM1 bildar ett komplex vid centrosomen med störd-in-schizofreni 1 ( DISC1 ) och Bardet-Biedl syndrom 4 protein ( BBS4 ), vilket ger en koppling mellan avvikande PCM1 och den onormala kortikala utvecklingen associerad med patologin för schizofreni.
Interaktioner
PCM1 har visat sig interagera med PCNT .
Vidare läsning
- Tollenaere MAX; Mailand N; Bekker-Jensen S (2014). "Centriolära satelliter: nyckelförmedlare av centrosomfunktioner". Cell. Mol. Life Sci . 72 (1): 11–23. doi : 10.1007/s00018-014-1711-3 . PMID 25173771 . S2CID 2243856 .
- Ohata H, Fujiwara Y, Koyama K, Nakamura Y (1995). "Kartering av genen för humant autoantigen pericentriolar material 1 (PCM1) till kromosom 8p21.3-p22". Genomik . 24 (2): 404–6. doi : 10.1006/geno.1994.1640 . PMID 7698772 .
- Balczon R, Bao L, Zimmer WE (1994). "PCM-1, ett 228-kD centrosomautoantigen med en distinkt cellcykelfördelning" . J. Cell Biol . 124 (5): 783–93. doi : 10.1083/jcb.124.5.783 . PMC 2119948 . PMID 8120099 .
- Engelender S, Sharp AH, Colomer V, et al. (1998). "Huntingtin-associerat protein 1 (HAP1) interagerar med p150Glued subenheten av dynactin" . Brum. Mol. Genet . 6 (13): 2205–12. doi : 10.1093/hmg/6.13.2205 . PMID 9361024 .
- Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). "Hagelgevärssekvensering av det mänskliga transkriptomet med ORF-uttryckta sekvenstaggar" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (7): 3491–6. Bibcode : 2000PNAS...97.3491D . doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800 .
- Corvi R, Berger N, Balczon R, Romeo G (2000). "RET/PCM-1: en ny fusionsgen i papillärt sköldkörtelkarcinom" . Onkogen . 19 (37): 4236–42. doi : 10.1038/sj.onc.1203772 . PMID 10980597 .
- Li Q, Hansen D, Killilea A, et al. (2001). "Kendrin/pericentrin-B, ett centrosomprotein med homologi med pericentrin som komplexbinder med PCM-1". J. Cell Sci . 114 (Pt 4): 797–809. doi : 10.1242/jcs.114.4.797 . PMID 11171385 .
- Kumar S, Connor JR, Dodds RA, et al. (2001). "Identifiering och initial karaktärisering av 5000 uttryckta sekvenserade taggar (EST) var och en från vuxna humana normala och osteoartritiska brosk-cDNA-bibliotek" . Osteoarthr. Cartil . 9 (7): 641–53. doi : 10.1053/joca.2001.0421 . PMID 11597177 .
- Dammermann A, Merdes A (2002). "Montering av centrosomala proteiner och mikrotubulusorganisation beror på PCM-1" . J. Cell Biol . 159 (2): 255–66. doi : 10.1083/jcb.200204023 . PMC 2173044 . PMID 12403812 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Ansley SJ, Badano JL, Blacque OE, et al. (2003). "Basal kroppsdysfunktion är en trolig orsak till pleiotropt Bardet-Biedl syndrom". Naturen . 425 (6958): 628–33. Bibcode : 2003Natur.425..628A . doi : 10.1038/nature02030 . PMID 14520415 . S2CID 4310157 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
- Kim JC, Badano JL, Sibold S, et al. (2004). "Bardet-Biedl-proteinet BBS4 riktar last till den pericentriolära regionen och krävs för mikrotubuliförankring och cellcykelprogression. " Nat. Genet . 36 (5): 462–70. doi : 10.1038/ng1352 . PMID 15107855 .
- Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, et al. (2004). "Robust fosfoproteomisk profilering av tyrosinfosforyleringsställen från mänskliga T-celler med hjälp av immobiliserad metallaffinitetskromatografi och tandemmasspektrometri". Anal. Chem . 76 (10): 2763–72. doi : 10.1021/ac035352d . PMID 15144186 .
- Armes JE, Hammet F, de Silva M, et al. (2004). "Kandidat tumörsuppressorgener på kromosomarm 8p i tidigt debuterande och höggradig bröstcancer" . Onkogen . 23 (33): 5697–702. doi : 10.1038/sj.onc.1207740 . PMID 15184884 .
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
- Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, et al. (2005). "Fosfoproteomisk analys av den utvecklande mushjärnan" . Mol. Cell. Proteomik . 3 (11): 1093–101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIH fullängds cDNA-projektet: Däggdjursgensamlingen (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
- Hames RS, Crookes RE, Straatman KR, et al. (2005). "Dynamisk rekrytering av Nek2-kinas till centrosomen involverar mikrotubuli, PCM-1 och lokaliserad proteasomal nedbrytning" . Mol. Biol. Cell . 16 (4): 1711–24. doi : 10.1091/mbc.E04-08-0688 . PMC 1073654 . PMID 15659651 .
- Reiter A, Walz C, Watmore A, et al. (2005). "t(8;9)(p22;p24) är en återkommande abnormitet vid kronisk och akut leukemi som förenar PCM1 till JAK2" . Cancer Res . 65 (7): 2662–7. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-04-4263 . PMID 15805263 .
- Murati A, Gelsi-Boyer V, Adélaïde J, et al. (2005). "PCM1-JAK2-fusion vid myeloproliferativa störningar och akut erytroid leukemi med t(8;9) translokation" . Leukemi . 19 (9): 1692–6. doi : 10.1038/sj.leu.2403879 . PMID 16034466 .