Nepovirus

Nepovirus
	Kristallstruktur av Grapevine Fanleaf Virus
Virus klassificering
(orankad):	Virus
Rike :	Riboviria
Rike:	Orthornavirae
Provins:	Pisuviricota
Klass:	Pisoniviricetes
Beställa:	Picornavirales
Familj:	Secoviridae
Underfamilj:	Comovirinae
Släkte:	Nepovirus
Art
	se text

Nepovirus är ett släkte av virus i ordningen Picornavirales , i familjen Secoviridae , i underfamiljen Comovirinae . Växter fungerar som naturliga värdar. Det finns 40 arter i detta släkte. Nepovirus, till skillnad från de andra två släktena ( Comovirus och Fabavirus ) i underfamiljen Comovirinae , överförs av nematoder .

Taxonomi

Släktet innehåller följande arter:

Aeonium ringspot virus
Aprikos latent ringspot-virus
Arabis mosaikvirus
Arracacha virus A
Kronärtskocka Egeiska ringfläcksvirus
Kronärtskocka italienskt latent virus
Kronärtskocka gula ringfläcksvirus
Beet ringspot virus
Svarta vinbär reversion virus
Blåbär latent sfäriskt virus
Blåbärsblad mottle virus
Cassava amerikanskt latent virus
Cassava green mottle virus
Körsbärsbladrullevirus
Cikoriagul fläckvirus
Kakao nekrosvirus
Crimson klöver latent virus
Cycas nekrotisk stuntvirus
Grapevine Anatolian ringspot virus
Grapevine Bulgarian latent virus
Grapevine chrome mosaic virus
Grapevine deformation virus
Grapevine fanleaf virus
Grapevine Tunisian ringspot virus
Hibiskus latent ringfläcksvirus
Luzern australiskt latent virus
Melon milt fläckvirus
Mulberry mosaik blad rulle tillhörande virus
Mulberry ringspot virus
Myrobalan latent ringfläcksvirus
Olive latent ringfläckvirus
Persika rosett mosaikvirus
Potatis svarta ringfläcksvirus
Potatisvirus B
Potatisvirus U
Hallon ringspot virus
Sojabönor latent sfäriskt virus
Tobak ringspot virus
Tomat svart ringvirus
Tomat ringspot virus

Strukturera

Virus i Nepovirus är icke-hölje, med icosaedriska geometrier och T=pseudo3-symmetri. Diametern är cirka 28-30 nm. Genomerna är linjära och segmenterade, tvådelade, cirka 23,9 kb långa.

Släkte	Strukturera	Symmetri	Capsid	Genomiskt arrangemang	Genomisk segmentering
Nepovirus	Icosahedral	Pseudo T=3	Ej kuverterade	Linjär	Segmenterad

Livscykel

Viral replikation är cytoplasmatisk. Inträde i värdcellen uppnås genom penetration in i värdcellen. Replikation följer den positiva strängade RNA-virusreplikationsmodellen. Positivt strängat RNA-virustranskription är metoden för transkription. Viruset lämnar värdcellen genom tubulstyrd viral rörelse. Växter fungerar som naturlig värd. Viruset överförs via en vektor (nematoder, kvalster och trips). Överföringsvägar är vektorer.

Släkte	Värdinformation	Vävnadstropism	Inträdesuppgifter	Releaseinformation	Replikeringsplats	Monteringsplats	Överföring
Nepovirus	Växter	Ingen	Viral rörelse; mekanisk ympning	Viral rörelse	Cytoplasma	Cytoplasma	Nematoder; kvalster; trips

Genom

Nepovirus klassificeras som typ IV- virus under Baltimores klassificeringssystem och innehåller följaktligen bipartita, linjära, enkelsträngade positiva sens RNA- genom . De två genomsegmenten är inkapslade separat i två olika ikosaedriska partiklar. Vart och ett av genomsegmenten producerar en annan polypeptid, som genomgår en serie steg (dvs proteolys och andra posttranslationella modifieringar ) för att producera ett funktionellt protein.

RNA1

Det första segmentet (RNA1) är ungefär 8 000 nukleotider långt och uppträder som en enda kopia i varje virion av B-typ . Den kodar för de proteiner som är viktiga i replikationen och är den första genen som aktiveras.

RNA2

Det andra segmentet (RNA2) är cirka 4 000–7 000 nukleotider långt och uppträder vanligtvis som en enda kopia i varje virion av M-typ. Den kodar för de proteiner som är viktiga för cell-cellöverföring och undvikande av cellulärt försvar.

externa länkar