Mycolicibacter
| Mycolicibacter | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | Bakterie |
| Provins: | Actinomycetota |
| Klass: | Actinomycetia |
| Beställa: | Mycobacteriales |
| Familj: | Mycobacteriaceae |
| Släkte: |
Mycolicibacter Gupta et al. 2018 |
| Typ art | |
|
Mycolicibacter terrae (Wayne 1966) Gupta et al. 2018
|
|
| Arter | |
|
|
| Synonymer | |
|
|
Mycolicibacter är ett släkte av grampositiva stavformade bakterier i familjen Mycobacteriaceae från ordningen Mycobacteriales .
Medlemmar av Mycolicibacter avgränsades från det större släktet Mycobacterium 2018 av Gupta et al. baserat på bevis från olika fylogenetiska träd konstruerade baserat på konserverade genomsekvenser, jämförande genomiska analyser och genomsnittliga aminosyraidentitetsvärden. Utöver detta släkte föreslog studien att Mycobacterium skulle delas upp i totalt fem distinkta släkten, vilket möttes av visst motstånd av en del av det vetenskapliga samfundet. Resistensen grundade sig på att Mycobacterium innehåller några kliniskt relevanta arter och namnändringar kan orsaka förvirring bland läkare och andra forskare.
År 2020, Yamada et al. analyserade de grundläggande morfologiska egenskaperna hos de nya släktena, inklusive celldiameter, celllängd, cellomkrets, cellcirkularitet och bildförhållande, och fastställde att det fanns betydande skillnader mellan de fem släktena, vilket stödde den nya uppdelningen.
Namnet Mycolicibacter kommer från det latinska substantivet acidum mycolicum (översätts till mykolsyra) och det latinska substantivet bacter (översätts till stav). Tillsammans hänvisar namnet till ett släkte av mykolsyra som innehåller stavformade bakterier.
Biokemiska egenskaper och molekylära signaturer
Medlemmar av Mycolicibacter är långsamväxande bakteriearter (det tar mer än sju dagar att bilda kolonier) och icke-kromogena (producerar inget pigment). Vissa arter växer i en mellanhastighet, vilket tar 5-15 dagar att bilda kolonier. Medan de flesta medlemmar av Mycolicibacter är icke-patogena, har vissa arter isolerats från djurvärdar och mänskliga patienter. De har ett högre G+C-innehåll (mellan 66,3–70,3 mol%) och relativt korta genom mellan intervallet 3,87–5,11 Mbp.
Analyser av genomsekvenser från Mycolicibacter identifierade 26 konserverade signaturindelar (CSI) som är specifika för detta släkte i proteinerna såsom icke-ribosomalt peptidsyntetas , nukleosidhydrolas, TetR-familjens transkriptionsregulator, kolsvältprotein A, felbenäget DNA-polymeras, amidohydrolas , karboximunkonolakton-dekarboxylasfamiljens protein, polyketidcyklas, spirocyklas AveC-familjens protein, TobH-protein, UDP-N-acetylmuramat–L-alaninligas, DUF2236-domäninnehållande protein, kobaltochelatas - subenhet CobN, alfa-membrantransport , potassium, alfa-transport , a protein , DUF222-domäninnehållande protein, MFS-transportör, adenylat/guanylatcyklasdomäninnehållande protein, DUF2029-domäninnehållande protein och hypotetiska proteiner. Dessa CSI tillhandahåller en tillförlitlig molekylär metod för att identifiera och särskilja medlemmar av Mycolicibacter från andra släkten i familjen Mycobacteriaceae . Dessutom identifierades 15 unika konserverade signaturproteiner (CSP) för att vara specifika för de flesta eller alla medlemmar av detta släkte.
Fylogeni
Mycolicibacters fylogeni är baserad på analys av hela genomet.
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||