Modulibacteria
| Modulibacteria | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | |
| Provins: |
" Modulibacteria "
|
| Klass: |
" Moduliflexi "
|
| Beställa: |
" Moduliflexales "
|
| Familj: |
"Moduliflexaceae"
Sekiguchi et al. 2015
|
| Släkte | |
|
|
Modulibacteria är en bakteriefilum tidigare känd som KS3B3 eller GN06 . Det är en kandidatgrupp , vilket betyder att det inte finns några kultiverade representanter för denna grupp. Medlemmar av Modulibacteria phylum är kända för att orsaka dödlig filamentöverväxt (bulking) i höggradiga industriella anaeroba bioreaktorer för avloppsvattenrening .
Modulibacteria-filen föreslogs först 2006 av två oberoende forskargrupper baserat på analyser av 16S rRNA- gensekvenser. En grupp återvann Modulibacteria-sekvenser från en hypersalin mikrobiell matta från Guerrero Negro (Baja California Sur, Mexiko) och använde det provisoriska namnet GN06 för den nya filumen , medan den andra återvann sekvenser från svavelrika marina sediment av svart lera (CA, USA) och använde det provisoriska namnet KSB3.
De första genomiska insikterna i filumet uppnåddes 2015, då namnet "Modulibacteria" föreslogs. Två genom återvanns från metanogena slamprover från en fullskalig upflow anaerob slam filt (UASB) reaktor som behandlar ett höghållfast organiskt avloppsvatten som släpps ut från en livsmedelsfabrik.
Genom en kombination av genombaserad metabolisk rekonstruktion och mikroskopisk observation fastställdes det att de två studerade Modulibacteria-arterna ( Moduliflexus flocculans och Vecturithrix granuli ) producerar filamentösa strukturer och är gramnegativa , strikt anaeroba fermentorer med förmåga till icke- flagelär baserad glidmotilitet. Båda har ett ovanligt stort antal sensoriska och responsregulatorgener jämfört med andra bakterier.
Medlemmar av Modulibacteria phylum har upptäckts i en mängd olika miljöer förutom bioreaktorer och hypersaltmattor, såsom våtmarkssediment ( FJ516883.1 ), delfinmunnen och en tubmask från en coldseep ( FM165273 ).
Taxonomi
Följande taxonomi föreslogs av Sekiguchi et al. 2015. Phylogeny by Annotree v1.2.0 som använder GTDB 05-RS95 ( Genome Taxonomy Database )
- Klass " Moduliflexia " Sekiguchi et al. 2015 ["Vecturitrichia" Sekiguchi et al. 2015 ]
- Beställning " Moduliflexales " Sekiguchi et al. 2015 ["Vecturatrichales" Sekiguchi et al. 2015 ]
- Familjen "Moduliflexaceae" Sekiguchi et al. 2015 ["Vecturatrichaceae" Sekiguchi et al. 2015 ]
-
Släktet " Candidatus Moduliflexus" Sekiguchi et al. 2015
- Art " Ca. M. flocculans" Sekiguchi et al. 2015
-
Släktet " Candidatus Vecturithrix" Sekiguchi et al. 2015
- Art " Ca. V. granuli " Sekiguchi et al. 2015
-
Släktet " Candidatus Moduliflexus" Sekiguchi et al. 2015
- Familjen "Moduliflexaceae" Sekiguchi et al. 2015 ["Vecturatrichaceae" Sekiguchi et al. 2015 ]
- Beställning " Moduliflexales " Sekiguchi et al. 2015 ["Vecturatrichales" Sekiguchi et al. 2015 ]