Metylmalonyl-CoA-dekarboxylas
metylmalonyl-CoA-dekarboxylas | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
identifierare | |||||||||
EG nr. | 7.2.4.3 | ||||||||
CAS-nr. | 37289-44-4 | ||||||||
Databaser | |||||||||
IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
KEGG | KEGG inträde | ||||||||
MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
PRIAM | profil | ||||||||
PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
Inom enzymologi är ett metylmalonyl-CoA-dekarboxylas ( EC 7.2.4.3 ) ett enzym som katalyserar den kemiska reaktionen
- (S)-metylmalonyl-CoA propanoyl-CoA + CO 2
Följaktligen har detta enzym ett substrat , (S)-metylmalonyl- CoA , och två produkter , propanoyl-CoA och CO2 . Tillsammans med denna reaktion transporterar detta enzym natriumkatjoner över membranet, vilket skapar en gradient som kan användas för syntes av ATP , därav dess klassificering som ett translokas .
Detta enzym tillhör familjen lyaser , närmare bestämt karboxilyaserna, som klyver kol-kolbindningar. Det systematiska namnet på denna enzymklass är (S)-metylmalonyl-CoA-karboxi-lyas (propanoyl-CoA-bildande) . Andra namn i vanlig användning inkluderar propionyl-CoA-karboxylas , propionylkoenzym A-karboxylas , metylmalonyl-koenzym A-dekarboxylas , (S)-2-metyl-3-oxopropanoyl-CoA-karboxi-lyas [felaktigt] och (S)-metylmalonyl-CoA karboxi-lyas . Detta enzym deltar i propanoatmetabolismen .
Strukturstudier
I slutet av 2007 har två strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB- accessionskoderna 1EF8 och 1EF9 .
- Galivan JH, Allen SH (1968). "Methylmalonyl coenzyme A decarboxylase. Dess roll i succinatdekarboxylering av Micrococcus lactilyticus". J. Biol. Chem . 243 (6): 1253–61. PMID 5646172 .
- Hilpert W, Dimroth P (1982). "Omvandling av den kemiska energin av metylmalonyl-CoA-dekarboxylering till en Na+-gradient". Naturen . 296 (5857): 584–5. Bibcode : 1982Natur.296..584H . doi : 10.1038/296584a0 . PMID 7070502 . S2CID 2595001 .
- Hoffmann A, Hilpert W, Dimroth P (1989). "Karboxyltransferasaktiviteten hos det natriumjontranslokerande metylmalonyl-CoA-dekarboxylaset från Veillonella alcalescens" . Eur. J. Biochem . 179 (3): 645–50. doi : 10.1111/j.1432-1033.1989.tb14596.x . PMID 2920730 .