Lys-N

Lys-N är ett metalloendopeptidas som finns i svampen Grifola frondosa som klyver proteiner på aminosidan av lysinrester .

Kristallstruktur av Lys-N med koordinerad zinkatom.

Masspektrometri

Lys-N håller på att bli ett populärt proteas som används för proteinnedbrytning i proteomikexperiment . Kombinationen Lys-N proteolytiska peptider och masspektrometrisekvensering med ETD skapar tandemmasspektra som mestadels består av aminoterminala peptidfragmentjoner. Detta fragmenteringsmönster underlättar tillämpningen av dessa spektra för de novo peptidsekvensering .

Se även

• Endoproteinas Lys-C
• Masspektrometri
• Tandemmasspektrometri
• Bottom-up proteomik

externa länkar

• MEROPS onlinedatabas för peptidaser och deras hämmare : M35.004
• Bevakning på Genomeweb
• Enzyminträde hos SWISS-PROT