Lymfocystivirus
| Lymfocystivirus | |
|---|---|
| Virus klassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Varidnaviria |
| Rike: | Bamfordvirae |
| Provins: | Nucleocytoviricota |
| Klass: | Megaviricetes |
| Beställa: | Pimascovirales |
| Familj: | Iridoviridae |
| Underfamilj: | Alphairidovirinae |
| Släkte: | Lymfocystivirus |
Lymfocystivirus är ett släkte av virus i familjen Iridoviridae . Fisk fungerar som naturliga värdar. Det finns fyra arter i detta släkte. Sjukdomar associerade med detta släkte inkluderar: tumörliknande utväxter på huden.
Värdar
Lymfocystivirus är ett av sex släkten av virus inom den virala familjen Iridoviridae och ett av tre släkten inom denna familj som infekterar teleostfiskar , tillsammans med Megalocytivirus och Ranavirus . Lymfocystivirus infekterar mer än 140 sötvattens- och marina arter, som spänner över minst 42 värdfamiljer världen över, vilket orsakar den kroniska, självbegränsande kliniska sjukdomen, lymfocystis . Även om lymfocystis inte orsakar massdödlighetshändelser som megalocytivirus och ranavirus, uppvisar fiskar med lymfocystis kraftigt synliga papillomliknande hudskador som avsevärt minskar deras kommersiella värde. Inga vacciner finns för närvarande tillgängliga för lymfocystis-virus.
Taxonomi
Släktet innehåller följande arter:
- Lymphocystis virus virus 1
- Lymphocystis virus virus 2
- Lymphocystis virus virus 3
- Lymphocystis virus virus 4
LCDV-genom
Lymfocystivirus är grupp I-virus med ett dsDNA- genom . LCDV-1-genomet är ungefär 102,7 kilobaspar (kbp) långt, med 195 potentiella öppna läsramar (ORF), och kodar för två DNA-beroende RNA- polymerassubenheter, ett DNA-metyltransferas , ett DNA-polymeras , ett guanosintrifosfatfosfohydrolas ( GTPase ), ett helikas , proteinkinaser , ett ribonukleosid-difosfatreduktas och zinkfingerproteiner , bland andra. LCDV-2-genomet liknar det för LCDV-1 men är något mindre, cirka 98 kilobaspar (kbp) långt.
Strukturera
Virus i släktet Lymphocystivirus är omslutna, med icosaedriska och polyedriska geometrier och T=189-217 symmetri. Diametern är runt 120-350 nm. Genomerna är linjära, cirka 100 kb långa.
| Släkte | Strukturera | Symmetri | Capsid | Genomiskt arrangemang | Genomisk segmentering |
|---|---|---|---|---|---|
| Lymfocystivirus | Polyedral | T=189-217 | Linjär | Endelad |
Livscykel
Lymfocystivirus fäster till värdcellen och kommer in genom receptormedierad endocytos liknande andra iridovirus. Virala partiklar är obelagda och flyttar till cellens kärna , där DNA-replikation börjar via ett viralt kodat DNA-polymeras . Viralt DNA förflyttas sedan till cytoplasman för det andra steget av DNA-replikation, vilket resulterar i bildandet av DNA- konkatemerer . Det konkatamera virala DNA:t förpackas därefter via en huvudmekanism i virioner. Det virala lymfocystis genomet är cirkulärt permuterat med terminalt redundant DNA . DNA-mallrad transkription är metoden för transkription. Fisk fungerar som naturlig värd.
| Släkte | Värdinformation | Vävnadstropism | Inträdesuppgifter | Releaseinformation | Replikeringsplats | Monteringsplats | Överföring |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Lymfocystivirus | Fisk | Ingen | Cellreceptorendocytos | lysering; gryende | Kärna | Cytoplasma | Okänd |
Patogenes
Lymfocystis är en kronisk sjukdom som sällan orsakar dödlighet. Infektion orsakar transformation och hypertrofi (ungefär 1000x) av celler i dermis, vilket bildar kraftigt synliga lymfocystisknölar, såväl som transformation och hypertrofi i celler i bindväven i olika inre organ. Fibroblaster och osteoblaster är specifikt inriktade på viruset. Lymphocystis-virus odlas inte lätt i cellkultur , vilket sätter begränsningar för in vitro molekylära patogenesexperiment.
Diagnostisk patologi
Eftersom lymfocystis-virus inte är lätt att odla i cellkultur, baseras diagnosen på kliniska tecken , grov patologi , histopatologi , serologi och/eller polymeraskedjereaktion (PCR)-baserade molekylära analyser .
Grov patologi
Lymphocystis patologi består av papillomliknande hudlesioner som består av kraftigt hypertrofierade infekterade värdceller inbäddade i extracellulär matris, ibland kallade lymfocystis-tumörceller, vilka är mycket tydliga som vita fläckar på huden och fenorna hos infekterade fiskar. Dessa lesioner förökar sig som epiteltumörer i vissa fall.
Histopatologi
I en nyligen genomförd jämförelse av lymfocystis histopatologi av fyra icke-besläktade marina arter, inkluderade lesioner konsekvent associerade med lymfocystis hypertrofierade celler som uppvisar oregelbundna kärnor, basofila cytoplasmatiska inklusionskroppar som färgades positivt via Feulgen och Manns reaktion och periodic acid-Shiff (PAS)-positiva kapselhyror. Hyalina kapslar härrör från den extracellulära matrisen som produceras av de infekterade cellerna och är sammansatta av sulfaterade och karboxylerade glykoproteiner (sura mukopolysackarider). Däremot varierade inklusionskroppsformen, distributionen av viruspartiklar i cytoplasman och det övergripande utseendet av lymfocystis-knölar efter art. Arterna som undersöktes i denna studie inkluderade vitfläckig puffer ( Arothron hispidus ), den japanska havsabborren ( Lateolabrax japonicus ), olivflundra ( Paralichthys olivaceus ) och "stickfisken" eller Schlegels svarta stenfisk ( Sebastes schegeli )
Serologi
Flera serologiska analyser har utvecklats för att identifiera LCDV-infektioner, inklusive flödescytometri , immunoblot och immunfluorescens . Men PCR-baserade molekylära analyser är mer praktiska för de flesta tillämpningar.
Elektronmikroskopi
Transmissionselektronmikroskopi (TEM) av infekterade celler avslöjar cytoplasmatiska viruspartiklar som vanligtvis mäter från 198-227 nm i diameter (i vissa fall så stora som 380 nm) och elektrontäta ämnen i det perinukleära utrymmet .
Molekylär patologi
Publicerade PCR-primrar och protokoll finns tillgängliga för att amplifiera en del av LCDV-1 MCP. När den diagnostiska PCR-analysen kombineras med slot blot , ökar den diagnostiska känsligheten , vilket underlättar diagnosen av asymtomatiska LCDV-1-infektioner.