Litet nukleolärt RNA Z199
| Litet nukleolärt RNA Z199 | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av snoZ199-
| |
| identifierare | |
| Symbol | snoZ199 |
| Rfam | RF00200 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; snRNA ; snoRNA ; CD-box |
| Domän(er) | Eukaryota |
| GÅ | GO:0006396 GO:0005730 |
| SÅ | SO:0000593 |
| PDB- strukturer | PDBe |
Inom molekylärbiologi är snoRNA Z199 en icke-kodande RNA (ncRNA) molekyl som fungerar i biogenes (modifiering) av andra små nukleära RNA (snRNA). Denna typ av modifierande RNA är belägen i kärnan i den eukaryota cellen som är en viktig plats för snRNA-biogenes. Det är känt som ett litet nukleolärt RNA (snoRNA) och kallas också ofta för ett guide-RNA.
snoRNA Z199 är en medlem av C/D-boxklassen av snoRNA som innehåller de konserverade sekvensmotiven kända som C-boxen (UGAUGA) och D-boxen (CUGA). De flesta av medlemmarna i box C/D-familjen fungerar i att styra platsspecifik 2'-O- metylering av substrat-RNA.
snoZ199 förutspås vara en metyleringsguide för platser på 18S och 25S ribosomalt RNA (rRNA). Oryza sativa snoZ199 rapporteras vara homolog med Arabidopsis thaliana snoR13.
- ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (oktober 2002). "Renade box C/D snoRNPs kan reproducera platsspecifik 2'-O-metylering av mål-RNA in vitro" . Molekylär och cellulär biologi . 22 (19): 6663–8. doi : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . PMC 134041 . PMID 12215523 .
- ^ Chen CL, Liang D, Zhou H, Zhuo M, Chen YQ, Qu LH (maj 2003). "Den höga mångfalden av snoRNA i växter: identifiering och jämförande studie av 120 snoRNA-gener från Oryza sativa" . Nukleinsyraforskning . 31 (10): 2601–13. doi : 10.1093/nar/gkg373 . PMC 156054 . PMID 12736310 .
externa länkar