Litet nukleolärt RNA SNORD103
| Litet nukleolärt RNA SNORD103/SNORD85 | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av SNORD103-
| |
| identifierare | |
| Symbol | SNORD103 |
| Alt. Symboler | U103 |
| Rfam | RF00188 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; snRNA ; snoRNA ; CD-box |
| Domän(er) | Eukaryota |
| GÅ | GO:0006396 GO:0005730 |
| SÅ | SO:0000593 |
| PDB- strukturer | PDBe |
Inom molekylärbiologi är snoRNA U103 (även känd som SNORD103 ) en icke-kodande RNA (ncRNA) molekyl som fungerar i modifieringen av andra små nukleära RNA (snRNA). Denna typ av modifierande RNA är vanligtvis lokaliserad i kärnan i den eukaryota cellen som är en huvudplats för snRNA-biogenes. Det är känt som ett litet nukleolärt RNA (snoRNA) och kallas också ofta för ett guide-RNA.
snoRNA U103 tillhör C/D-boxklassen av snoRNA som innehåller de konserverade sekvensmotiven kända som C-boxen (UGAUGA) och D-boxen (CUGA). De flesta av medlemmarna i box C/D-familjen fungerar i att styra platsspecifik 2'-O- metylering av substrat-RNA.
U103 identifierades genom beräkningsscreening av intronerna av ribosomala proteingener för konserverade C/D-boxsekvensmotiv och uttryck experimentellt verifierats med northern blotting .
U103 förutsägs styra 2'O-ribos-metyleringen av 18S ribosomalt RNA (rRNA)-rest G601. I både human- och musgenomet finns två U103-genkopior (kallade U103A eller SNORD103A och U103B eller SNORD103B) belägna inom intron 17 och 21 av PUM1-genen.
- ^ Galardi, S.; Fatica, A.; Bachi, A.; Scaloni, A.; Presutti, C.; Bozzoni, I. (oktober 2002). "Renade Box C/D snoRNPs kan reproducera platsspecifik 2'-O-metylering av mål-RNA in vitro" . Molekylär och cellulär biologi . 22 (19): 6663–6668. doi : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . PMC 134041 . PMID 12215523 .
- ^ a b c Vitali P, Royo H, Seitz H, Bachellerie JP, Hüttenhofer A, Cavaillé J (2003). "Identifiering av 13 nya mänskliga modifieringsguide-RNA:n" . Nucleic Acids Res . 31 (22): 6543–51. doi : 10.1093/nar/gkg849 . PMC 275545 . PMID 14602913 .
- ^ Lestrade, Laurent; Weber, Michel J. (2006). "snoRNA-LBME-db, en omfattande databas av humana H/ACA och C/D box snoRNAs" . Nukleinsyraforskning . 34 (Bilaga 1: Databasnummer): D158–D162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . doi : 10.1093/nar/gkj002 . PMC 1347365 . PMID 16381836 .
externa länkar
- Sida för litet nukleolärt RNA SNORD103 på Rfam
- Inträde för SNORD103A på snoRNABase
- Inträde för SNORD103B på snoRNABase