Litet nukleolärt RNA SNORD56

Litet nukleolärt RNA SNORD56
RF00275.jpg
Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av SNORD56-
identifierare
Symbol SNORD56
Alt. Symboler U56
Rfam RF00275
Övriga uppgifter
RNA -typ Gen ; snRNA ; snoRNA ; C/D-låda
Domän(er) Eukaryota
GO:0006396 GO:0005730
SO:0000593
PDB- strukturer PDBe

Inom molekylärbiologi är snoRNA U56 (även känd som SNORD56 ) en icke-kodande RNA (ncRNA) molekyl som fungerar i modifieringen av andra små nukleära RNA (snRNA). Denna typ av modifierande RNA är vanligtvis lokaliserad i kärnan i den eukaryota cellen som är en huvudplats för snRNA-biogenes. Det är känt som ett litet nukleolärt RNA (snoRNA) och kallas också ofta för ett guide-RNA.

snoRNA U56 tillhör C/D-box- klassen av snoRNA som innehåller de konserverade sekvensmotiven kända som C-boxen (UGAUGA) och D-boxen (CUGA). De flesta av medlemmarna i box C/D-familjen fungerar i att styra platsspecifik 2'-O- metylering av substrat-RNA.

U56 klonades ursprungligen från HeLa- celler och förutspås styra 2'O-ribos-metyleringen av 18S ribosomalt RNA (rRNA)-rest C517. I det mänskliga genomet kodas U56 i intronerna av samma värdgen som flera andra snoRNA (C/D box snoRNA U57 , U86 och HBII-55, och H/ACA box snoRNA ACA51 ). Denna värdgen kodar för nukleolärt protein 5A (NOL5A).

externa länkar