Litet nukleolärt RNA SNORD43
| Litet nukleolärt RNA SNORD43 | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av SNORD43-
| |
| identifierare | |
| Symbol | SNORD43 |
| Alt. Symboler | U43 |
| Rfam | RF00221 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; snRNA ; snoRNA ; CD-box |
| Domän(er) | Eukaryota |
| GÅ | GO:0006396 GO:0005730 |
| SÅ | SO:0000593 |
| PDB- strukturer | PDBe |
Inom molekylärbiologi är snoRNA U43 (även känd som SNORD43 ) en icke-kodande RNA (ncRNA) molekyl som fungerar i modifieringen av andra små nukleära RNA (snRNA). Denna typ av modifierande RNA är vanligtvis lokaliserad i kärnan i den eukaryota cellen som är en huvudplats för snRNA-biogenes. Det är känt som ett litet nukleolärt RNA (snoRNA) och kallas också ofta för ett guide-RNA.
snoRNA U43 tillhör C/D-boxklassen av snoRNA som innehåller de konserverade sekvensmotiven som är kända som C-boxen (UGAUGA) och D-boxen (CUGA). De flesta av medlemmarna i box C/D-familjen fungerar i att styra platsspecifik 2'-O- metylering av substrat-RNA.
U43 kodas i intron 1 av den ribosomala protein L3-genen i människa och ko. Tre andra snoRNA (U82, U83a och U83b) är också kodade i samma värdgen men från olika introner. Arabidopsis thaliana -homologen kallas snoR41 i de offentliga sekvensdatabaserna (Genbank). Rishomologen uttrycks från ett kluster som också innehåller snoR16.
U43 antas styra metylering av 2'-O-ribosrester på 18S ribosomalt RNA.
externa länkar