Lysinspecifikt demetylas 2A (KDM2A) även känt som F-box och leucinrikt repeterande protein 11 (FBXL11) är ett enzym som hos människor kodas av KDM2A - genen . KDM2A är en medlem av superfamiljen av alfa-ketoglutarat-beroende hydroxylaser , som är proteiner som inte innehåller hemjärn.
Fungera
Denna gen kodar för en medlem av F-box -proteinfamiljen som kännetecknas av ett motiv på cirka 40 aminosyror, F-boxen. F-box - proteinerna utgör en av de fyra subenheterna av ubiquitinproteinligaskomplex som kallas SCFs (SKP1-cullin-F-box), som fungerar i fosforyleringsberoende ubiquitination . F-box-proteinerna är indelade i 3 klasser: Fbws som innehåller WD-40- domäner, Fbls som innehåller leucinrika upprepningar och Fbxs som innehåller antingen olika protein-proteininteraktionsmoduler eller inga igenkännbara motiv. Proteinet som kodas av denna gen tillhör Fbls-klassen och innehåller, förutom en F-box, minst 6 starkt degenererade leucinrika upprepningar.
FBXL11/KDM2A är ett histon H3 lysin 36 demetylasenzym . Den enzymatiska aktiviteten hos FBXL11/KDM2A är beroende av en konserverad JmjC-domän i N-terminalen av proteinet som koordinerar järn och alfaketoglutarat för att katalysera demetylering via en hydroxyleringsbaserad mekanism. Det har nyligen visat sig att en ZF-CxxC DNA-bindande domän inom FBXL11/KDM2A har kapacitet att interagera med icke-metylerat DNA och denna domän riktar sig mot FBXL11/KDM2A till CpG-öregioner i genomet där den specifikt tar bort histon H3 lysin 36 metylering . Denna mekanism verkar för att skapa en kromatinmiljö på CpG-öarna som framhäver dessa regulatoriska element och skiljer dem från icke-regulatoriska regioner i stora komplexa däggdjursgenom. I en studie på mushepatocyter visade sig denna gen reglera glukoneogenesen i levern.
Ilyin GP, Rialland M, Pigeon C, Guguen-Guillouzo C (2001). "cDNA-kloning och expressionsanalys av nya medlemmar av däggdjurs-F-box-proteinfamiljen". Genomik . 67 (1): 40–7. doi : 10.1006/geno.2000.6211 . PMID 10945468 .
